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天峻牦牛分子遗传多样性及群体遗传结构分析
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作者 吴志鹏 曹萍 +4 位作者 王贵元 李瑞哲 扎西东主 郭卫兴 马志杰 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第3期706-715,共10页
【目的】旨在揭示青海省天峻牦牛群体的分子遗传多样性、群体结构及遗传背景。【方法】利用mtDNA D-loop区序列及6个Y染色体标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3、OFD1Y10和INRA189)对37头天峻牦牛(35♂,2♀)进行分析,探究其遗传多样性、... 【目的】旨在揭示青海省天峻牦牛群体的分子遗传多样性、群体结构及遗传背景。【方法】利用mtDNA D-loop区序列及6个Y染色体标记(SRY4、USP9Y、UTY19、AMELY3、OFD1Y10和INRA189)对37头天峻牦牛(35♂,2♀)进行分析,探究其遗传多样性、群体结构及系统发育情况。【结果】(1)37头天峻牦牛mtDNA D-loop区序列(617~618 bp)比对分析共检测到29处变异位点,包括3处单一多态位点和26处简约信息位点,根据序列间核苷酸变异确定了12种单倍型。母系遗传多样性分析显示,其单倍型多样度和核苷酸多样度分别达到0.836±0.045和0.011±0.005,与野牦牛及中国17个牦牛品种(群体)相比,其母系遗传多样性水平较低。系统发育分析显示天峻牦牛由2个母系遗传支系(Mt-Ⅰ和Mt-Ⅱ)组成,推测其拥有2个母系起源。(2)35头天峻牦牛Y-SNP和Y-STR标记联合分型中共确定了4种Y染色体单倍型(即H1Y1、H6Y1、H9Y1和H11Y2)。父系遗传多样性分析显示,天峻牦牛Y染色体单倍型多样度为0.356±0.099,父系遗传多样性水平较低。系统发育分析显示天峻牦牛4种Y染色体单倍型聚为2个父系支系(Y1和Y2),提示其有2个父系起源。【结论】天峻牦牛遗传多样性水平较低;由2个母系支系(Mt-Ⅰ和Mt-Ⅱ)和2个父系支系(Y1和Y2)组成,推测其拥有2个母系起源和2个父系起源。 展开更多
关键词 天峻牦牛 mtDNA D-loop区 Y染色体标记 遗传多样性 群体结构
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