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基于TMT技术对高温胁迫条件下大菱鲆幼鱼心脏的差异蛋白筛选分析
1
作者
赵一诺
徐荣静
+6 位作者
黄智慧
蒋宇航
曹郡文
王新安
刘诗颖
闫鹏飞
马爱军
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第5期30-41,共12页
水温是影响鱼类生存生长的重要因素,而心脏对于维持脊椎动物机体稳态有关键作用。因此,为探究与大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温性状相关的关键蛋白或代谢通路,本研究利用TMT联合LC-MS/MS技术开展高温胁迫下大菱鲆心脏差异表达蛋白...
水温是影响鱼类生存生长的重要因素,而心脏对于维持脊椎动物机体稳态有关键作用。因此,为探究与大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温性状相关的关键蛋白或代谢通路,本研究利用TMT联合LC-MS/MS技术开展高温胁迫下大菱鲆心脏差异表达蛋白谱分析。将大菱鲆幼鱼分为3组进行实验:control组(14.0±0.5)℃(适宜温度),HT1组(20.0±0.5)℃(高温),HT2组(28.0±0.5)℃(极高温)。定量分析鉴定到的肽段数量为35434个,其中特有肽段数量为31704个;鉴定到的蛋白质总数4765个。3个实验组间两两比较形成3个比较组,并进行差异蛋白筛选,结果显示,HT1/control共筛选到87个差异表达蛋白(DEPs),HT2/control共筛选到171个DEPs,HT2/HT1共筛选到188个DEPs。KEGG富集结果显示,HT2组与control组和HT2组与HT1组的差异蛋白均主要富集在与脂肪酸代谢、炎症以及免疫防御相关的通路;热休克蛋白家族中多个蛋白(HSP90B、HSP70等)在HT2组相较于control组均显著上调。蛋白互作网络结果显示,关联度最高的是HSP90B。首次发现,高温胁迫下心脏组织纤维蛋白原相关蛋白(FGA、FGB和FGG)表达水平呈上升趋势,其在热响应中的作用仍需进一步研究。结果表明,极高温可能引起大菱鲆的脂肪酸代谢紊乱,引发炎症反应,而热休克蛋白家族蛋白的上调可能对缓解热胁迫下的应激症状有积极作用。本研究为进一步阐明大菱鲆热应激的分子机制提供了理论依据,并为大菱鲆的耐高温选育提供候选蛋白标记。
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关键词
大菱鲆
蛋白组学
高温胁迫
心脏
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职称材料
退火促进变性蛋白的正确折叠
2
作者
黄清艺
杨留艳
沈庆涛
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期44-50,共7页
退火技术是冶金工业常用的热处理工艺,通过对金属、合金和半导体材料进行先加热后降温的处理,可以同步化其微观结构,改善其物理和化学性质。前期,本课题组率先把退火引入生物大分子的结构生物学研究,实现对生物大分子构象的同步化,进而...
退火技术是冶金工业常用的热处理工艺,通过对金属、合金和半导体材料进行先加热后降温的处理,可以同步化其微观结构,改善其物理和化学性质。前期,本课题组率先把退火引入生物大分子的结构生物学研究,实现对生物大分子构象的同步化,进而提高冷冻电镜解析分辨率。为了拓宽退火的应用,本文以绿色荧光蛋白(EGFP)为研究对象,对热变性的EGFP进行退火处理,发现退火处理的EGFP展现出更快的复性速度和更高的复性效率,这一发现有利于深入理解蛋白质折叠的机制,也为利用退火稳定和修复变性蛋白提供了理论基础和实验支撑。
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关键词
退火
蛋白质复性
负染电镜
绿色荧光蛋白
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职称材料
低盐度胁迫下不同脂肪含量饲料对大菱鲆幼鱼生长及脂质代谢相关基因表达的影响
3
作者
徐菲
刘志峰
+4 位作者
赵海池
杨明超
孙志宾
徐荣静
马爱军
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第5期42-52,共11页
为了研究脂肪水平是否对低盐胁迫导致的大菱鲆(Scophthalmus maximus)脂质代谢紊乱具有缓解作用,本研究进行了低盐胁迫下不同脂肪含量饲料的投喂实验,以确定大菱鲆在应对低盐度时的最佳脂质需求量。本研究设置了3个盐度梯度(10、20和30)...
为了研究脂肪水平是否对低盐胁迫导致的大菱鲆(Scophthalmus maximus)脂质代谢紊乱具有缓解作用,本研究进行了低盐胁迫下不同脂肪含量饲料的投喂实验,以确定大菱鲆在应对低盐度时的最佳脂质需求量。本研究设置了3个盐度梯度(10、20和30),每个盐度组设置4个脂肪含量梯度(8%、12%、16%和20%),分析在不同盐度下不同脂肪含量饲料对大菱鲆幼鱼生长性能、脂质代谢及其相关基因表达的影响。结果显示,脂质含量为16%时,盐度20与盐度30组之间大菱鲆幼鱼的生长性能无显著差异,盐度10组的生长性能要低于盐度20和盐度30组;盐度为10时,大菱鲆幼鱼的生长性能随脂肪含量的增加而增加,最高值出现在20%组,且高于盐度30与盐度20下的20%组。脂质代谢相关基因表达方面,在盐度10和盐度20养殖条件下,与脂质合成相关的基因lxra、cyp 7a1和srebp-1的表达量基本随脂肪含量升高呈先升高后降低的趋势,尤其在盐度为10时,12%组的表达量高于其他各组,20%组显著低于其他各组(P<0.05)。此外,盐度为10时,acc和fas基因的表达水平类似,在高脂肪20%组中均被抑制,在12%组的表达量较高。与脂质吸收相关的基因apoa-Ⅳ在盐度10下20%组的表达量远高于相同盐度条件下其他各组(P<0.05),而且在脂肪含量20%条件下呈随盐度升高而降低的趋势,这与其他脂质组中的趋势完全相反。以上结果表明,低盐胁迫影响脂质代谢后,通过不同脂肪含量的饲料可以从脂质合成和脂质吸收的角度来缓解胁迫带来的不利影响,且这种缓解作用更多的体现在脂质吸收层面上,进而提高低盐胁迫下的生长表现。研究结果从盐度影响脂质代谢的角度探索鱼类对低盐的适应性,可为大菱鲆耐低盐良种选育提供理论和技术支撑。
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关键词
盐度
大菱鲆
生长性能
脂质代谢相关基因
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职称材料
题名
基于TMT技术对高温胁迫条件下大菱鲆幼鱼心脏的差异蛋白筛选分析
1
作者
赵一诺
徐荣静
黄智慧
蒋宇航
曹郡文
王新安
刘诗颖
闫鹏飞
马爱军
机构
中国水产科
学
研究院黄海水产研究所、海水养殖
生物
育种与可持续产出全国重点
实验室
、山东省
海洋
渔业
生物技术
与遗传育种重点
实验室
、
青岛
市海水鱼类种子工程
与生物技术
重点
实验室
中国水产科
学
研究院黄海水产研究所、海水养殖
生物
育种与可持续产出全国重点
实验室
、山东省
海洋
渔业
生物技术
与遗传育种重点
实验室
、
青岛
市海水鱼类种子工程
与生物技术
重点
实验室
中国农业科
学
院研究生院
青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室
烟台开发区天源水产有限公司
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第5期30-41,共12页
基金
国家重点研发计划(2022YFD2400403)
现代农业产业技术体系专项(CARS-47-G01)
中国水产科学研究院基本科研业务费(2020TD25)共同资助。
文摘
水温是影响鱼类生存生长的重要因素,而心脏对于维持脊椎动物机体稳态有关键作用。因此,为探究与大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温性状相关的关键蛋白或代谢通路,本研究利用TMT联合LC-MS/MS技术开展高温胁迫下大菱鲆心脏差异表达蛋白谱分析。将大菱鲆幼鱼分为3组进行实验:control组(14.0±0.5)℃(适宜温度),HT1组(20.0±0.5)℃(高温),HT2组(28.0±0.5)℃(极高温)。定量分析鉴定到的肽段数量为35434个,其中特有肽段数量为31704个;鉴定到的蛋白质总数4765个。3个实验组间两两比较形成3个比较组,并进行差异蛋白筛选,结果显示,HT1/control共筛选到87个差异表达蛋白(DEPs),HT2/control共筛选到171个DEPs,HT2/HT1共筛选到188个DEPs。KEGG富集结果显示,HT2组与control组和HT2组与HT1组的差异蛋白均主要富集在与脂肪酸代谢、炎症以及免疫防御相关的通路;热休克蛋白家族中多个蛋白(HSP90B、HSP70等)在HT2组相较于control组均显著上调。蛋白互作网络结果显示,关联度最高的是HSP90B。首次发现,高温胁迫下心脏组织纤维蛋白原相关蛋白(FGA、FGB和FGG)表达水平呈上升趋势,其在热响应中的作用仍需进一步研究。结果表明,极高温可能引起大菱鲆的脂肪酸代谢紊乱,引发炎症反应,而热休克蛋白家族蛋白的上调可能对缓解热胁迫下的应激症状有积极作用。本研究为进一步阐明大菱鲆热应激的分子机制提供了理论依据,并为大菱鲆的耐高温选育提供候选蛋白标记。
关键词
大菱鲆
蛋白组学
高温胁迫
心脏
Keywords
Scophthalmus maximus
Proteomics
High temperature stress
Heart
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
退火促进变性蛋白的正确折叠
2
作者
黄清艺
杨留艳
沈庆涛
机构
南方
科技
大
学
生命科
学
学
院
青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室
南方
科技
大
学
生物
电镜研究院
山东大
学
微
生物技术
研究院
崂山国家
实验室
出处
《电子显微学报》
北大核心
2025年第1期44-50,共7页
基金
国家重点研发计划资助项目(No.2021YFF1200400)
国家自然科学基金资助项目(No.32170127)
深圳医学研究专项资金(No.B2401003).
文摘
退火技术是冶金工业常用的热处理工艺,通过对金属、合金和半导体材料进行先加热后降温的处理,可以同步化其微观结构,改善其物理和化学性质。前期,本课题组率先把退火引入生物大分子的结构生物学研究,实现对生物大分子构象的同步化,进而提高冷冻电镜解析分辨率。为了拓宽退火的应用,本文以绿色荧光蛋白(EGFP)为研究对象,对热变性的EGFP进行退火处理,发现退火处理的EGFP展现出更快的复性速度和更高的复性效率,这一发现有利于深入理解蛋白质折叠的机制,也为利用退火稳定和修复变性蛋白提供了理论基础和实验支撑。
关键词
退火
蛋白质复性
负染电镜
绿色荧光蛋白
Keywords
annealing
protein refolding
negative staining electron microscopy
green fluorescent protein
分类号
Q518 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
低盐度胁迫下不同脂肪含量饲料对大菱鲆幼鱼生长及脂质代谢相关基因表达的影响
3
作者
徐菲
刘志峰
赵海池
杨明超
孙志宾
徐荣静
马爱军
机构
浙江
海洋
大
学
中国水产科
学
研究院黄海水产研究所、海水养殖
生物
育种与可持续产出全国重点
实验室
、山东省
海洋
渔业
生物技术
与遗传育种重点
实验室
、
青岛
市海水鱼类种子工程
与生物技术
重点
实验室
青岛海洋科技中心海洋生物学与生物技术功能实验室
烟台开发区天源水产有限公司
出处
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024年第5期42-52,共11页
基金
国家自然科学基金(32002362)
国家重点研发计划(2022YFD2400403)
+1 种基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-47-01)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2020TD25)共同资助。
文摘
为了研究脂肪水平是否对低盐胁迫导致的大菱鲆(Scophthalmus maximus)脂质代谢紊乱具有缓解作用,本研究进行了低盐胁迫下不同脂肪含量饲料的投喂实验,以确定大菱鲆在应对低盐度时的最佳脂质需求量。本研究设置了3个盐度梯度(10、20和30),每个盐度组设置4个脂肪含量梯度(8%、12%、16%和20%),分析在不同盐度下不同脂肪含量饲料对大菱鲆幼鱼生长性能、脂质代谢及其相关基因表达的影响。结果显示,脂质含量为16%时,盐度20与盐度30组之间大菱鲆幼鱼的生长性能无显著差异,盐度10组的生长性能要低于盐度20和盐度30组;盐度为10时,大菱鲆幼鱼的生长性能随脂肪含量的增加而增加,最高值出现在20%组,且高于盐度30与盐度20下的20%组。脂质代谢相关基因表达方面,在盐度10和盐度20养殖条件下,与脂质合成相关的基因lxra、cyp 7a1和srebp-1的表达量基本随脂肪含量升高呈先升高后降低的趋势,尤其在盐度为10时,12%组的表达量高于其他各组,20%组显著低于其他各组(P<0.05)。此外,盐度为10时,acc和fas基因的表达水平类似,在高脂肪20%组中均被抑制,在12%组的表达量较高。与脂质吸收相关的基因apoa-Ⅳ在盐度10下20%组的表达量远高于相同盐度条件下其他各组(P<0.05),而且在脂肪含量20%条件下呈随盐度升高而降低的趋势,这与其他脂质组中的趋势完全相反。以上结果表明,低盐胁迫影响脂质代谢后,通过不同脂肪含量的饲料可以从脂质合成和脂质吸收的角度来缓解胁迫带来的不利影响,且这种缓解作用更多的体现在脂质吸收层面上,进而提高低盐胁迫下的生长表现。研究结果从盐度影响脂质代谢的角度探索鱼类对低盐的适应性,可为大菱鲆耐低盐良种选育提供理论和技术支撑。
关键词
盐度
大菱鲆
生长性能
脂质代谢相关基因
Keywords
Salinity
Scophthalmus maximus
Growth performance
Lipid metabolism-related genes
分类号
S965 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
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1
基于TMT技术对高温胁迫条件下大菱鲆幼鱼心脏的差异蛋白筛选分析
赵一诺
徐荣静
黄智慧
蒋宇航
曹郡文
王新安
刘诗颖
闫鹏飞
马爱军
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
退火促进变性蛋白的正确折叠
黄清艺
杨留艳
沈庆涛
《电子显微学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
3
低盐度胁迫下不同脂肪含量饲料对大菱鲆幼鱼生长及脂质代谢相关基因表达的影响
徐菲
刘志峰
赵海池
杨明超
孙志宾
徐荣静
马爱军
《渔业科学进展》
CSCD
北大核心
2024
0
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