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题名韭菜根际真菌和内生真菌种群多样性分析
被引量：7
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作者
付静
刘堰凤
梅眉
黄永红
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机构
青岛农业大学园艺学院
青岛市胶州市现代农业发展服务中心
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2018年第A01期246-252,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(31471864
31272151)
+1 种基金
青岛农业大学人才启动基金(6631115024)
国家级大学生创新项目(201710435070)
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文摘
在前期研究发现,韭菜处理可以减轻香蕉枯萎病和根结线虫病害的发生,推测韭菜中含有能抑制病原菌及致死根结线虫的生防菌。对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌的种群结构及多样性进行比较分析,以期为分离鉴定韭菜中抑菌和杀根结线虫的生防真菌提供理论依据。通过Illumina平台对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌样品中的18S rRNA序列进行测序,并进行生物信息学分析。结果表明:从韭菜根际土壤、根系、叶片中获得348 484高质量序列和123个操作分类单元(OTU)。根际真菌的Chao、ACE、Shannon指数显著高于内生真菌(叶片和根系),而Simpson指数则显著小于内生真菌。根际真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)(67. 20%)和担子菌门(Basidiomycota)(24.44%) 2个菌门组成;而内生真菌主要由子囊菌门组成,在叶片和根系中含量分别为91. 39%和96. 60%。在检测到的5个菌门中,内生真菌中子囊菌门显著高于根际土壤,其他菌门则显著低于根际土壤。叶片和根系中内生真菌稍有不同,但是差异并不显著。该研究表明,韭菜根际真菌和内生真菌的种群结构存在显著差异,根际真菌的多样性及丰富性显著高于内生真菌。该研究为分离鉴定韭菜中抑制植物病原菌及致死根结线虫的生防真菌提供参考。
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关键词
韭菜
真菌多样性
Illumina测序
内生菌
根际土壤
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Keywords
Chinese leek
Fungal diversity
Illumina sequence
Endophyte
Rhizophyere soil
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分类号
S432
[农业科学—植物病理学]
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