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一种新的基于A-I RNA编辑预测乳腺癌预后模型的建立和验证
被引量：
1
1
作者
李健
刘阳
+1 位作者
闫霞
王颜
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第5期359-363,共5页
目的:开发一种基于腺苷到肌苷的脱氨基(A-to-I RNA编辑,ATIRE)的预后模型用于改善乳腺癌的个体化治疗。方法:首先使用单变量Cox回归分析来获得训练集中与总生存(OS)相关的ATIRE位点,然后进行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法来确...
目的:开发一种基于腺苷到肌苷的脱氨基(A-to-I RNA编辑,ATIRE)的预后模型用于改善乳腺癌的个体化治疗。方法:首先使用单变量Cox回归分析来获得训练集中与总生存(OS)相关的ATIRE位点,然后进行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法来确定最佳预后ATIRE位点,进行多因素Cox比例风险回归分析建立风险模型,纳入ATIRE风险评分和临床病理学特征变量构建预后列线图,绘制校准曲线并计算一致性指数以评价模型的预测概率与实际的一致性,通过决策曲线分析(DCA)评价该模型的临床收益价值。结果:确定18个预后位点用来构建预后模型,并生成ATIRE风险评分。高风险评分患者的中位生存时间显著缩短,列线图在预测乳腺癌的OS概率方面表现良好。校准曲线表现出优异的一致性,决策曲线显示其具有更高的净收益。结论:分析ATIRE事件在预测乳腺癌生存中的作用,基于AITRE的预后模型可以帮助临床医师更好进行临床决策。
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关键词
乳腺癌
A-to-I
RNA编辑
总生存
列线图
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职称材料
一种基于m7G RNA修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型的构建和验证
2
作者
李健
刘阳
+1 位作者
刘飞
王颜
《中国现代普通外科进展》
CAS
2023年第12期933-938,共6页
目的:建立并验证一种基于N7甲基鸟苷(m7G)RNA甲基化修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型。方法:检测31种m7G RNA甲基化相关的关键调控因子在乳腺癌组织中的表达模式。下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的乳腺癌患者的m...
目的:建立并验证一种基于N7甲基鸟苷(m7G)RNA甲基化修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型。方法:检测31种m7G RNA甲基化相关的关键调控因子在乳腺癌组织中的表达模式。下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的乳腺癌患者的m RNA基因表达和临床预后数据。通过单变量Cox回归分析评估每个m7G相关基因对生存的预后价值。应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归方法,构建基于m7G甲基化调节基因的乳腺癌预后风险模型。通过基因集富集分析(GSEA)阐述BC高危人群的主要作用机制。基于m7G建立预后列线图,分别在TCGA和GEO队列中进行验证。结果:构建基于7个m7G甲基化调节基因的预后风险模型。高危组总生存率(OS)明显低于低危组(P<0.001)。GSEA分析表明,在高危人群中“细胞周期”是最重要的致癌通路。利用训练集TCGA队列的风险评分及临床特征,构建了预后列线图,校准曲线和决策曲线分析(DCA)表明其一致性和预测效能很好,并于GEO队列中进行了验证。结论:基于m7G相关基因的预后模型对乳腺癌的预后具有预测作用,可用于指导乳腺癌患者的个体化治疗。
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关键词
乳腺癌
m7G
RNA甲基化修饰
预后列线图
癌症基因组图谱
基因表达综合数据库
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职称材料
题名
一种新的基于A-I RNA编辑预测乳腺癌预后模型的建立和验证
被引量：
1
1
作者
李健
刘阳
闫霞
王颜
机构
青岛大学附属泰安市中心医院乳腺疾病诊疗中心
青岛大学
附属
泰安市
中心医院
肝胆胰腺外科
山东农业
大学
信息科学与工程学院应用数学系
出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第5期359-363,共5页
文摘
目的:开发一种基于腺苷到肌苷的脱氨基(A-to-I RNA编辑,ATIRE)的预后模型用于改善乳腺癌的个体化治疗。方法:首先使用单变量Cox回归分析来获得训练集中与总生存(OS)相关的ATIRE位点,然后进行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法来确定最佳预后ATIRE位点,进行多因素Cox比例风险回归分析建立风险模型,纳入ATIRE风险评分和临床病理学特征变量构建预后列线图,绘制校准曲线并计算一致性指数以评价模型的预测概率与实际的一致性,通过决策曲线分析(DCA)评价该模型的临床收益价值。结果:确定18个预后位点用来构建预后模型,并生成ATIRE风险评分。高风险评分患者的中位生存时间显著缩短,列线图在预测乳腺癌的OS概率方面表现良好。校准曲线表现出优异的一致性,决策曲线显示其具有更高的净收益。结论:分析ATIRE事件在预测乳腺癌生存中的作用,基于AITRE的预后模型可以帮助临床医师更好进行临床决策。
关键词
乳腺癌
A-to-I
RNA编辑
总生存
列线图
Keywords
Breast cancer
A-to-I RNA editing
Overall surviva
Nomogram
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
在线阅读
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职称材料
题名
一种基于m7G RNA修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型的构建和验证
2
作者
李健
刘阳
刘飞
王颜
机构
青岛大学附属泰安市中心医院乳腺疾病诊疗中心
青岛大学
附属
泰安市
中心医院
肝胆胰腺外科
山东农业
大学
信息科学与工程学院应用数学系
出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2023年第12期933-938,共6页
文摘
目的:建立并验证一种基于N7甲基鸟苷(m7G)RNA甲基化修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型。方法:检测31种m7G RNA甲基化相关的关键调控因子在乳腺癌组织中的表达模式。下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)中的乳腺癌患者的m RNA基因表达和临床预后数据。通过单变量Cox回归分析评估每个m7G相关基因对生存的预后价值。应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归方法,构建基于m7G甲基化调节基因的乳腺癌预后风险模型。通过基因集富集分析(GSEA)阐述BC高危人群的主要作用机制。基于m7G建立预后列线图,分别在TCGA和GEO队列中进行验证。结果:构建基于7个m7G甲基化调节基因的预后风险模型。高危组总生存率(OS)明显低于低危组(P<0.001)。GSEA分析表明,在高危人群中“细胞周期”是最重要的致癌通路。利用训练集TCGA队列的风险评分及临床特征,构建了预后列线图,校准曲线和决策曲线分析(DCA)表明其一致性和预测效能很好,并于GEO队列中进行了验证。结论:基于m7G相关基因的预后模型对乳腺癌的预后具有预测作用,可用于指导乳腺癌患者的个体化治疗。
关键词
乳腺癌
m7G
RNA甲基化修饰
预后列线图
癌症基因组图谱
基因表达综合数据库
Keywords
Breast cancer
m7G
RNA methylation modification
Prognostic nomogram
TCGA
GEO
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的基于A-I RNA编辑预测乳腺癌预后模型的建立和验证
李健
刘阳
闫霞
王颜
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一种基于m7G RNA修饰相关基因的乳腺癌预后预测模型的构建和验证
李健
刘阳
刘飞
王颜
《中国现代普通外科进展》
CAS
2023
0
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已选择
0
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引证文献
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