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甘蓝硫苷生物合成相关基因FMO_(GS-OXS)的预测与分析
1
作者
刘蕾
宋佳
王辉
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第11期22-25,共4页
以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族FMO_(GS-OX)位点基因全长编码区及蛋白为参考序列,在甘蓝(Brassica oleraceae L.)基因组数据库中进行Blastn和Blastp检索,得到具备Score≥100、E值≤10-10、coverage≥70%条件的甘蓝注释基因作...
以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族FMO_(GS-OX)位点基因全长编码区及蛋白为参考序列,在甘蓝(Brassica oleraceae L.)基因组数据库中进行Blastn和Blastp检索,得到具备Score≥100、E值≤10-10、coverage≥70%条件的甘蓝注释基因作为候选拟南芥FMO_(GS-OX)的同源基因,并进一步进行同源性比较、基因结构比较及序列聚类分析。结果显示,在甘蓝中发现3个旁系同源基因Bol010993、Bol029100、Bol031350。甘蓝和拟南芥FMO_(GS-OX)同源基因之间在核酸水平上的相似性为69.4%~83.0%;甘蓝3个FMO_(GS-OX)旁系同源基因间的相似性保持在70.0%~84.0%。甘蓝Bol010993与拟南芥FMO_(GS-OX)1~FMO_(GS-OX)4的结构较为相似,而Bol029100、Bol031350与拟南芥FMO_(GS-OX)5的结构较相似。系统进化分析及共线性分析初步确定,甘蓝中分别存在1个FMO_(GS-OX)2(Bol010993)和2个FMO_(GS-OX)5(Bol029100、Bol031350)基因。
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关键词
十字花科
甘蓝
硫代葡萄糖苷
FMOGS-OX基因
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职称材料
山东省番茄尖孢镰刀菌的分离及鉴定
被引量:
9
2
作者
张秀
刘蕾
+2 位作者
王辉
李文丽
王富
《山东农业科学》
2019年第12期78-81,共4页
本研究以山东省单县番茄枯萎病及临淄、寿光、胶州、即墨、海阳、莱阳等地区的番茄颈腐、根腐病发病植株为主要试验材料,对病原菌进行分离、纯化及培养,并利用分子检测技术对供试菌株进行生理小种鉴定。结果显示,山东单县番茄枯萎病的...
本研究以山东省单县番茄枯萎病及临淄、寿光、胶州、即墨、海阳、莱阳等地区的番茄颈腐、根腐病发病植株为主要试验材料,对病原菌进行分离、纯化及培养,并利用分子检测技术对供试菌株进行生理小种鉴定。结果显示,山东单县番茄枯萎病的致病菌为番茄枯萎病菌生理小种1,其他地区番茄颈腐、根腐病致病菌为番茄枯萎病菌生理小种3。
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关键词
山东省
番茄
分子检测
尖孢镰刀菌
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职称材料
干制辣椒InDel-PCR反应体系的构建及应用
被引量:
4
3
作者
王辉
王爽
+2 位作者
姜童
杨延杰
林多
《江苏农业科学》
2018年第10期28-30,共3页
以干制辣椒叶片为试验材料,筛选适用于InDel-PCR(insertion-deletion-PCR)的DNA提取方法。采用单因素试验设计,对干制辣椒InDel-PCR反应体系进行优化,以及建立干制辣椒InDel的最佳反应体系和扩增程序,利用构建的InDel-PCR反应体系对InDe...
以干制辣椒叶片为试验材料,筛选适用于InDel-PCR(insertion-deletion-PCR)的DNA提取方法。采用单因素试验设计,对干制辣椒InDel-PCR反应体系进行优化,以及建立干制辣椒InDel的最佳反应体系和扩增程序,利用构建的InDel-PCR反应体系对InDel引物进行筛选。结果表明:植物基因组试剂盒较改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取的DNA质量高、杂质少,更适合InDel-PCR的应用;适用于干制辣椒的InDel-PCR反应体系总体积为15μL,其中模板DNA 2.0μL,正反向引物各1.0μL,2×Go Taq R Colorless Master Mix 7.5μL,其余用dd H2O补齐。扩增程序:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸45 s,30次循环;72℃延伸5 min。在上述PCR条件下从60对InDel引物中筛选出25对多态性好、稳定性高的引物。
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关键词
干制辣椒
InDel-PCR
InDel引物
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职称材料
山东省番茄颈腐根腐病病原菌鉴定
被引量:
1
4
作者
张秀
李芬
+1 位作者
王辉
王富
《青岛农业大学学报(自然科学版)》
2023年第1期24-29,共6页
以山东省6个地区的番茄颈腐根腐病(Fusarium crown and root rot,FCRR)8份发病植株为试验材料,对病原菌进行分离纯化。利用真菌通用引物、多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因特异标记、特定指示性番茄材料、无毒基因特异引物及尖孢镰刀菌番茄颈...
以山东省6个地区的番茄颈腐根腐病(Fusarium crown and root rot,FCRR)8份发病植株为试验材料,对病原菌进行分离纯化。利用真菌通用引物、多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因特异标记、特定指示性番茄材料、无毒基因特异引物及尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型特异引物等多种方法对该病原菌进行鉴定。研究结果表明,尖孢镰刀菌通用引物鉴定结果显示8份FCRR病原菌均为尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum,Fo);PG酶基因特异标记鉴定结果表明所有病原菌均为番茄枯萎病病原菌生理小种3(Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici race 3,Fol3);而指示性番茄材料鉴定结果表明所有病原菌并非番茄枯萎病病原菌生理小种Fol1、Fol2或Fol3;无毒基因特异性引物鉴定结果初步显示所有病原菌均为尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型(Fusarium oxysporum f.sp.radicis-lycopersici,Forl);尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型特异性引物FrlDel30F/R进一步确定所有菌株均为番茄颈腐根腐专化型。因此,引起山东省6个地区的番茄FCRR的病原菌为Forl。
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关键词
番茄
颈腐根腐病
尖孢镰刀菌
分子标记
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职称材料
题名
甘蓝硫苷生物合成相关基因FMO_(GS-OXS)的预测与分析
1
作者
刘蕾
宋佳
王辉
机构
青岛农业大学园艺学院/青岛市遗传改良与育种重点实验室
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第11期22-25,共4页
基金
山东省青岛市应用基础研究计划项目(编号:14-2-4-112-jch)
文摘
以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族FMO_(GS-OX)位点基因全长编码区及蛋白为参考序列,在甘蓝(Brassica oleraceae L.)基因组数据库中进行Blastn和Blastp检索,得到具备Score≥100、E值≤10-10、coverage≥70%条件的甘蓝注释基因作为候选拟南芥FMO_(GS-OX)的同源基因,并进一步进行同源性比较、基因结构比较及序列聚类分析。结果显示,在甘蓝中发现3个旁系同源基因Bol010993、Bol029100、Bol031350。甘蓝和拟南芥FMO_(GS-OX)同源基因之间在核酸水平上的相似性为69.4%~83.0%;甘蓝3个FMO_(GS-OX)旁系同源基因间的相似性保持在70.0%~84.0%。甘蓝Bol010993与拟南芥FMO_(GS-OX)1~FMO_(GS-OX)4的结构较为相似,而Bol029100、Bol031350与拟南芥FMO_(GS-OX)5的结构较相似。系统进化分析及共线性分析初步确定,甘蓝中分别存在1个FMO_(GS-OX)2(Bol010993)和2个FMO_(GS-OX)5(Bol029100、Bol031350)基因。
关键词
十字花科
甘蓝
硫代葡萄糖苷
FMOGS-OX基因
分类号
S635.03 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
山东省番茄尖孢镰刀菌的分离及鉴定
被引量:
9
2
作者
张秀
刘蕾
王辉
李文丽
王富
机构
青岛农业大学园艺学院/青岛市遗传改良与育种重点实验室
出处
《山东农业科学》
2019年第12期78-81,共4页
基金
山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT-05-02)
山东省自然科学基金项目(ZR2014CQ034)
+1 种基金
山东省农业良种工程项目(2017LZGC013)
青岛市民生科技计划项目(18-6-1-114-nsh)
文摘
本研究以山东省单县番茄枯萎病及临淄、寿光、胶州、即墨、海阳、莱阳等地区的番茄颈腐、根腐病发病植株为主要试验材料,对病原菌进行分离、纯化及培养,并利用分子检测技术对供试菌株进行生理小种鉴定。结果显示,山东单县番茄枯萎病的致病菌为番茄枯萎病菌生理小种1,其他地区番茄颈腐、根腐病致病菌为番茄枯萎病菌生理小种3。
关键词
山东省
番茄
分子检测
尖孢镰刀菌
Keywords
Shandong Province
Tomato
Molecular markers
Fusarium oxysporum
分类号
S432.4 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
干制辣椒InDel-PCR反应体系的构建及应用
被引量:
4
3
作者
王辉
王爽
姜童
杨延杰
林多
机构
青岛农业大学园艺学院/青岛市遗传改良与育种重点实验室
出处
《江苏农业科学》
2018年第10期28-30,共3页
基金
山东省农业良种工程(编号:2016LZGC011)
青岛农业大学高层次人才科研基金(编号:6631115041)
文摘
以干制辣椒叶片为试验材料,筛选适用于InDel-PCR(insertion-deletion-PCR)的DNA提取方法。采用单因素试验设计,对干制辣椒InDel-PCR反应体系进行优化,以及建立干制辣椒InDel的最佳反应体系和扩增程序,利用构建的InDel-PCR反应体系对InDel引物进行筛选。结果表明:植物基因组试剂盒较改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取的DNA质量高、杂质少,更适合InDel-PCR的应用;适用于干制辣椒的InDel-PCR反应体系总体积为15μL,其中模板DNA 2.0μL,正反向引物各1.0μL,2×Go Taq R Colorless Master Mix 7.5μL,其余用dd H2O补齐。扩增程序:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸45 s,30次循环;72℃延伸5 min。在上述PCR条件下从60对InDel引物中筛选出25对多态性好、稳定性高的引物。
关键词
干制辣椒
InDel-PCR
InDel引物
分类号
S641.301 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
山东省番茄颈腐根腐病病原菌鉴定
被引量:
1
4
作者
张秀
李芬
王辉
王富
机构
青岛农业大学园艺学院/青岛市遗传改良与育种重点实验室
出处
《青岛农业大学学报(自然科学版)》
2023年第1期24-29,共6页
基金
山东省农业良种工程(2020LZGC005)
山东省现代农业产业技术体系(SDAIT-05)
青岛市科技惠民示范引导专项资助项目(21-1-4-ny-25-nsh)。
文摘
以山东省6个地区的番茄颈腐根腐病(Fusarium crown and root rot,FCRR)8份发病植株为试验材料,对病原菌进行分离纯化。利用真菌通用引物、多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因特异标记、特定指示性番茄材料、无毒基因特异引物及尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型特异引物等多种方法对该病原菌进行鉴定。研究结果表明,尖孢镰刀菌通用引物鉴定结果显示8份FCRR病原菌均为尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum,Fo);PG酶基因特异标记鉴定结果表明所有病原菌均为番茄枯萎病病原菌生理小种3(Fusarium oxysporum f.sp.lycopersici race 3,Fol3);而指示性番茄材料鉴定结果表明所有病原菌并非番茄枯萎病病原菌生理小种Fol1、Fol2或Fol3;无毒基因特异性引物鉴定结果初步显示所有病原菌均为尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型(Fusarium oxysporum f.sp.radicis-lycopersici,Forl);尖孢镰刀菌番茄颈腐根腐专化型特异性引物FrlDel30F/R进一步确定所有菌株均为番茄颈腐根腐专化型。因此,引起山东省6个地区的番茄FCRR的病原菌为Forl。
关键词
番茄
颈腐根腐病
尖孢镰刀菌
分子标记
Keywords
tomato
Fusarium crown and root rot(FCRR)
Fusarium oxysporum
molecular marker
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝硫苷生物合成相关基因FMO_(GS-OXS)的预测与分析
刘蕾
宋佳
王辉
《江苏农业科学》
北大核心
2017
0
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职称材料
2
山东省番茄尖孢镰刀菌的分离及鉴定
张秀
刘蕾
王辉
李文丽
王富
《山东农业科学》
2019
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
干制辣椒InDel-PCR反应体系的构建及应用
王辉
王爽
姜童
杨延杰
林多
《江苏农业科学》
2018
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
山东省番茄颈腐根腐病病原菌鉴定
张秀
李芬
王辉
王富
《青岛农业大学学报(自然科学版)》
2023
1
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职称材料
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