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拟穴青蟹DDX5基因的表达及功能初步分析
1
作者
赵逗裟
姚成杰
+1 位作者
张子平
王艺磊
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期225-235,共11页
拟穴青蟹(Scylla paramamosain)是我国东南沿海重要的经济养殖蟹类之一。DDX5基因是DEAD-box解旋酶基因家族中的成员,已有研究表明其在生殖细胞的成熟分化及功能维持中起重要的调控作用。我们从拟穴青蟹转录组数据库中筛选获得了DDX5(Sp...
拟穴青蟹(Scylla paramamosain)是我国东南沿海重要的经济养殖蟹类之一。DDX5基因是DEAD-box解旋酶基因家族中的成员,已有研究表明其在生殖细胞的成熟分化及功能维持中起重要的调控作用。我们从拟穴青蟹转录组数据库中筛选获得了DDX5(SpDDX5)基因序列,采用实时荧光定量PCR技术分析了其在成熟青蟹各组织、性腺各发育时期及胚胎各发育时期的表达模式。此外,利用RNAi技术分析了SpDDX5在性腺发育中可能发挥的作用。结果如下:SpDDX5的开放阅读框长1 893 bp,编码630个氨基酸,具有DEXDc和HELICc两个结构域。SpDDX5在拟穴青蟹的各组织中广泛表达,且在精巢中的表达水平明显高于其他组织(P<0.05);在精巢发育过程中,SpDDX5的表达水平逐渐降低;在胚胎发育过程中,SpDDX5的表达水平逐渐升高。干扰SpDDX5后,生殖细胞分子标记基因Vasa和Nanos表达上调,性腺发育相关基因foxl-2表达下调,Dmrt家族基因Dsx表达上调,Dmrt-like和idmrt-2表达下调。根据以上结果,我们推测SpDDX5基因可能在拟穴青蟹生殖细胞发育和精巢发育中发挥重要作用。
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关键词
海洋生物学
DDX5基因
DEAD-box解旋酶
RNAI
生殖细胞发育
精巢发育
拟穴青蟹
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职称材料
福建沿海巨蛎属(Crassostrea)牡蛎的种类及其分布
被引量:
3
2
作者
于诗奇
韩自强
+2 位作者
陈燕婷
郭团玉
阙华勇
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1682-1692,共11页
福建省位于我国东南沿海,海岸线曲折,港湾众多,有多条河流入海,适宜牡蛎栖息繁衍,是我国牡蛎资源最丰富的地区之一。迄今关于福建沿海牡蛎种类组成及分布情况的研究报道尚少,鉴于近20余年福建主要海湾经历了高强度的牡蛎养殖,有必要了...
福建省位于我国东南沿海,海岸线曲折,港湾众多,有多条河流入海,适宜牡蛎栖息繁衍,是我国牡蛎资源最丰富的地区之一。迄今关于福建沿海牡蛎种类组成及分布情况的研究报道尚少,鉴于近20余年福建主要海湾经历了高强度的牡蛎养殖,有必要了解福建沿海牡蛎自然群体的物种组成和数量占比等自然种质资源状况。基于现场调查取样,结合采用多重种特异性PCR、ITS2杂交种鉴定和CO I测序共同鉴定福建沿海巨蛎属(Crassostrea)牡蛎种类及其分布情况。研究结果表明,从福建沿海由北至南牡蛎野生种苗海区的19个采样点共960个样品中发现3种巨蛎属牡蛎,分别是福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(C.sikamea)和香港牡蛎(C.hongkongensis),并未发现以往报道的近江牡蛎(C.ariakensis)。其中福建牡蛎(607个)占63.23%、熊本牡蛎(343个)占35.73%、香港牡蛎(10个)占1.04%。除个别采样点外,福建牡蛎和熊本牡蛎在各采样海区均有分布。香港牡蛎仅在泉州湾河口湿地自然保护区(新发现群体)有少量分布。研究结果揭示的福建沿海地区巨蛎属的物种种类及其分布为后续开展牡蛎遗传多样性分析和遗传分化等种群遗传研究提供了关键基础资料,为牡蛎种质资源的保护和利用打下重要基础。
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关键词
牡蛎种类
巨蛎属
福建沿海
多重种特异性PCR
基于ITS2序列的杂交种鉴定
CO
I测序
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职称材料
题名
拟穴青蟹DDX5基因的表达及功能初步分析
1
作者
赵逗裟
姚成杰
张子平
王艺磊
机构
集美大学水产学院、农业农村部东海海水健康养殖重点实验室
福建农林
大学
海洋
学院
出处
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期225-235,共11页
基金
国家自然科学基金(41676161)
中央引导地方科技发展专项(2020L3011)
福建省海洋经济发展专项(FJHJF-L-2022-18)。
文摘
拟穴青蟹(Scylla paramamosain)是我国东南沿海重要的经济养殖蟹类之一。DDX5基因是DEAD-box解旋酶基因家族中的成员,已有研究表明其在生殖细胞的成熟分化及功能维持中起重要的调控作用。我们从拟穴青蟹转录组数据库中筛选获得了DDX5(SpDDX5)基因序列,采用实时荧光定量PCR技术分析了其在成熟青蟹各组织、性腺各发育时期及胚胎各发育时期的表达模式。此外,利用RNAi技术分析了SpDDX5在性腺发育中可能发挥的作用。结果如下:SpDDX5的开放阅读框长1 893 bp,编码630个氨基酸,具有DEXDc和HELICc两个结构域。SpDDX5在拟穴青蟹的各组织中广泛表达,且在精巢中的表达水平明显高于其他组织(P<0.05);在精巢发育过程中,SpDDX5的表达水平逐渐降低;在胚胎发育过程中,SpDDX5的表达水平逐渐升高。干扰SpDDX5后,生殖细胞分子标记基因Vasa和Nanos表达上调,性腺发育相关基因foxl-2表达下调,Dmrt家族基因Dsx表达上调,Dmrt-like和idmrt-2表达下调。根据以上结果,我们推测SpDDX5基因可能在拟穴青蟹生殖细胞发育和精巢发育中发挥重要作用。
关键词
海洋生物学
DDX5基因
DEAD-box解旋酶
RNAI
生殖细胞发育
精巢发育
拟穴青蟹
Keywords
marine biology
DDX5 gene
DEAD-box helicase
RNAi
germ cell development
testicular development
Scylla paramamosain
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
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职称材料
题名
福建沿海巨蛎属(Crassostrea)牡蛎的种类及其分布
被引量:
3
2
作者
于诗奇
韩自强
陈燕婷
郭团玉
阙华勇
机构
集美大学水产学院、农业农村部东海海水健康养殖重点实验室
、福建省
水产
生物育种与
健康
养殖
工程研究中心
福建省
水产
技术推广总站
厦门海洋职业技术
学院
海洋生物
学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1682-1692,共11页
基金
国家自然科学基金项目,32172979号
福建省自然科学基金项目,2021J05159号。
文摘
福建省位于我国东南沿海,海岸线曲折,港湾众多,有多条河流入海,适宜牡蛎栖息繁衍,是我国牡蛎资源最丰富的地区之一。迄今关于福建沿海牡蛎种类组成及分布情况的研究报道尚少,鉴于近20余年福建主要海湾经历了高强度的牡蛎养殖,有必要了解福建沿海牡蛎自然群体的物种组成和数量占比等自然种质资源状况。基于现场调查取样,结合采用多重种特异性PCR、ITS2杂交种鉴定和CO I测序共同鉴定福建沿海巨蛎属(Crassostrea)牡蛎种类及其分布情况。研究结果表明,从福建沿海由北至南牡蛎野生种苗海区的19个采样点共960个样品中发现3种巨蛎属牡蛎,分别是福建牡蛎(Crassostrea angulata)、熊本牡蛎(C.sikamea)和香港牡蛎(C.hongkongensis),并未发现以往报道的近江牡蛎(C.ariakensis)。其中福建牡蛎(607个)占63.23%、熊本牡蛎(343个)占35.73%、香港牡蛎(10个)占1.04%。除个别采样点外,福建牡蛎和熊本牡蛎在各采样海区均有分布。香港牡蛎仅在泉州湾河口湿地自然保护区(新发现群体)有少量分布。研究结果揭示的福建沿海地区巨蛎属的物种种类及其分布为后续开展牡蛎遗传多样性分析和遗传分化等种群遗传研究提供了关键基础资料,为牡蛎种质资源的保护和利用打下重要基础。
关键词
牡蛎种类
巨蛎属
福建沿海
多重种特异性PCR
基于ITS2序列的杂交种鉴定
CO
I测序
Keywords
oyster species
Crassostrea
Fujian coast
multiplex species-specific PCR
hybrid identification based on ITS2 sequence
CO I sequence analysis
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
S931 [农业科学—渔业资源]
S968.3 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
拟穴青蟹DDX5基因的表达及功能初步分析
赵逗裟
姚成杰
张子平
王艺磊
《应用海洋学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
福建沿海巨蛎属(Crassostrea)牡蛎的种类及其分布
于诗奇
韩自强
陈燕婷
郭团玉
阙华勇
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
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职称材料
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