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DNA条形码技术在陕西省鼠形动物鉴定中的应用
被引量:
3
1
作者
陈宝宝
孙养信
+4 位作者
范锁平
吕文
聂守民
李胜振
安翠红
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期325-329,339,共6页
目的探究应用DNA条形码技术进行分子生物学鉴定的可行性,弥补形态学鉴定缺陷。方法结合鼠疫监测工作,使用样方法、5 m夹笼法、夹夜法采集鼠形动物标本,所有标本形态学初步鉴定后基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(COI基因)进行分子鉴...
目的探究应用DNA条形码技术进行分子生物学鉴定的可行性,弥补形态学鉴定缺陷。方法结合鼠疫监测工作,使用样方法、5 m夹笼法、夹夜法采集鼠形动物标本,所有标本形态学初步鉴定后基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(COI基因)进行分子鉴定,计算遗传距离,构建系统发育树。结果获得709只鼠形动物的COI基因序列,隶属于3目10科24属38种。COI基因序列显示种内遗传距离在3.6%以内,平均为1.4%,种间遗传距离大于5.6%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离,属间、科间遗传距离界限不明显,对多只鼠形动物形态学鉴定结果进行了纠正。系统发育树显示同种个体聚为高支持度的单一分支,发现索氏仓鼠和中国仓鼠2个隐存种。结论DNA条形码技术可对鼠形动物进行有效的鉴定,但因数据库的不完善,仍需将传统的分类学鉴定方法和现代分子生物学鉴定方法结合,以保证鉴定结果的准确性。
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关键词
DNA条形码
鼠形动物
COI基因
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职称材料
题名
DNA条形码技术在陕西省鼠形动物鉴定中的应用
被引量:
3
1
作者
陈宝宝
孙养信
范锁平
吕文
聂守民
李胜振
安翠红
机构
陕西省疾病预防控制中心消毒生防所
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期325-329,339,共6页
基金
陕西省科学技术研究发展计划(No.2012K16-12-03)。
文摘
目的探究应用DNA条形码技术进行分子生物学鉴定的可行性,弥补形态学鉴定缺陷。方法结合鼠疫监测工作,使用样方法、5 m夹笼法、夹夜法采集鼠形动物标本,所有标本形态学初步鉴定后基于线粒体细胞色素C氧化酶I亚基基因(COI基因)进行分子鉴定,计算遗传距离,构建系统发育树。结果获得709只鼠形动物的COI基因序列,隶属于3目10科24属38种。COI基因序列显示种内遗传距离在3.6%以内,平均为1.4%,种间遗传距离大于5.6%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离,属间、科间遗传距离界限不明显,对多只鼠形动物形态学鉴定结果进行了纠正。系统发育树显示同种个体聚为高支持度的单一分支,发现索氏仓鼠和中国仓鼠2个隐存种。结论DNA条形码技术可对鼠形动物进行有效的鉴定,但因数据库的不完善,仍需将传统的分类学鉴定方法和现代分子生物学鉴定方法结合,以保证鉴定结果的准确性。
关键词
DNA条形码
鼠形动物
COI基因
Keywords
DNA barcoding
murine-like animal
C oxidase I subunit gene(COI gene)
分类号
Q95 [生物学—动物学]
S443 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DNA条形码技术在陕西省鼠形动物鉴定中的应用
陈宝宝
孙养信
范锁平
吕文
聂守民
李胜振
安翠红
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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