目的快速制备并分离纯化硫化氢特异性荧光探针(Washington State Probe-5),建立动物组织中硫化氢的荧光探针测定法,并在癌性胸水模型中进行方法适用性验证。方法优化条件分离纯化WSP-5;对荧光探针反应液配制溶剂、DMSO加入体积、pH、反...目的快速制备并分离纯化硫化氢特异性荧光探针(Washington State Probe-5),建立动物组织中硫化氢的荧光探针测定法,并在癌性胸水模型中进行方法适用性验证。方法优化条件分离纯化WSP-5;对荧光探针反应液配制溶剂、DMSO加入体积、pH、反应液溶剂和反应液体积、样品前处理温度、研磨次数、研磨后静置时间等条件进行考察;以S-180腹水瘤细胞建立癌性胸水小鼠模型,测定小鼠各脏器中的硫化氢含量。结果以硅胶和葡聚糖凝胶为固定相,二氯甲烷-甲醇-甲酸(60∶1∶0.1,V/V/V)和二氯甲烷-甲醇(1∶1,V/V)为洗脱剂制备WSP-5纯品;动物组织样本和硫氢化钠标准溶液加入优化后的5倍量冰冷反应液,低温研磨、高速离心,上清液避光孵育12 h,测定荧光强度并计算硫化氢浓度;该方法检测限约0.6μmol·L^(-1),定量限1μmol·L^(-1),在硫氢化钠一定浓度范围内,浓度与荧光强度线性系数均大于0.99;在癌性胸水小鼠模型中,各脏器硫化氢含量随着注射癌细胞数量的增多均有不同程度的增加趋势。结论该方法操作简单、成本低、灵敏度高、特异性强,适合各类组织样本的高通量检测,可为硫化氢相关药效机制的深入研究和相关药物开发提供方法学参考。展开更多
目的基于生物信息学分析大量公共数据库,探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白(DPTs),STRING在线构建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和信号通路;使用cBio Po...目的基于生物信息学分析大量公共数据库,探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白(DPTs),STRING在线构建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和信号通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突变,并利用OncoPrint可视化;从TCGA数据库下载乳腺癌与正常组织中的转录组数据,利用DECenter分析差异过表达基因,对STRING分析得到的DPTs相互关联基因与TCGA中的差异过表达基因求交集,确认阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,并利用Gene Ontology进行GO功能富集分析。最终通过蛋白免疫印迹实验验证阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点。结果搜索Drug Bank 5.1.3确定了11个阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6个DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)与癌症发生发展有关。通过分析TCGA数据库中乳腺癌与正常组织中的转录组数据获得10220个过表达差异基因,与STRING分析得到的6个阿司匹林DPTs的相互关联基因求交集,发现4个基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其基因功能主要富集于细胞周期与细胞分裂。蛋白免疫印迹实验结果显示:阿司匹林可以降低人乳腺癌细胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表达。结论CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其可能通过影响细胞周期和细胞分裂发挥抗肿瘤增殖作用。展开更多
文摘目的快速制备并分离纯化硫化氢特异性荧光探针(Washington State Probe-5),建立动物组织中硫化氢的荧光探针测定法,并在癌性胸水模型中进行方法适用性验证。方法优化条件分离纯化WSP-5;对荧光探针反应液配制溶剂、DMSO加入体积、pH、反应液溶剂和反应液体积、样品前处理温度、研磨次数、研磨后静置时间等条件进行考察;以S-180腹水瘤细胞建立癌性胸水小鼠模型,测定小鼠各脏器中的硫化氢含量。结果以硅胶和葡聚糖凝胶为固定相,二氯甲烷-甲醇-甲酸(60∶1∶0.1,V/V/V)和二氯甲烷-甲醇(1∶1,V/V)为洗脱剂制备WSP-5纯品;动物组织样本和硫氢化钠标准溶液加入优化后的5倍量冰冷反应液,低温研磨、高速离心,上清液避光孵育12 h,测定荧光强度并计算硫化氢浓度;该方法检测限约0.6μmol·L^(-1),定量限1μmol·L^(-1),在硫氢化钠一定浓度范围内,浓度与荧光强度线性系数均大于0.99;在癌性胸水小鼠模型中,各脏器硫化氢含量随着注射癌细胞数量的增多均有不同程度的增加趋势。结论该方法操作简单、成本低、灵敏度高、特异性强,适合各类组织样本的高通量检测,可为硫化氢相关药效机制的深入研究和相关药物开发提供方法学参考。
文摘目的基于生物信息学分析大量公共数据库,探讨阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的分子机制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索确定阿司匹林的直接靶点蛋白(DPTs),STRING在线构建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络和信号通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突变,并利用OncoPrint可视化;从TCGA数据库下载乳腺癌与正常组织中的转录组数据,利用DECenter分析差异过表达基因,对STRING分析得到的DPTs相互关联基因与TCGA中的差异过表达基因求交集,确认阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,并利用Gene Ontology进行GO功能富集分析。最终通过蛋白免疫印迹实验验证阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点。结果搜索Drug Bank 5.1.3确定了11个阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6个DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)与癌症发生发展有关。通过分析TCGA数据库中乳腺癌与正常组织中的转录组数据获得10220个过表达差异基因,与STRING分析得到的6个阿司匹林DPTs的相互关联基因求交集,发现4个基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其基因功能主要富集于细胞周期与细胞分裂。蛋白免疫印迹实验结果显示:阿司匹林可以降低人乳腺癌细胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表达。结论CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌细胞增殖的潜在靶点,其可能通过影响细胞周期和细胞分裂发挥抗肿瘤增殖作用。
