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益肺解毒颗粒防治新型冠状病毒感染的作用机制研究
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作者 安玉叶 张红 +5 位作者 刘琪琪 周洁 陈静 王春柳 刘洋 李晔 《特产研究》 2023年第2期47-53,61,共8页
本文研究益肺解毒颗粒防治新型冠状病毒感染的作用机制。通过TCMSP数据库收集益肺解毒颗粒中11味药材所含化学成分及对应靶点,利用数据库OMIM和GeenCards查找“novel coronavirus”的相关靶点,通过R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析,利... 本文研究益肺解毒颗粒防治新型冠状病毒感染的作用机制。通过TCMSP数据库收集益肺解毒颗粒中11味药材所含化学成分及对应靶点,利用数据库OMIM和GeenCards查找“novel coronavirus”的相关靶点,通过R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析,利用Cytoscape3.7.2软件构建“药材-成分-疾病-靶点”网络图,采用计算机软件AutoDock4.2.1进行分子对接分析。拓扑学分析表明,益肺解毒颗粒防治新型冠状病毒感染的活性成分主要有柚皮素、β-谷甾醇、汉黄芩素和木犀草素等10个,关键靶点有RELA、MAPK3和IL6等12个,通过KEGG分析及文献报道,筛选出IL-17、PI3K-Akt和NF-kB等相关通路20条;分子对接结果表明,益肺解毒颗粒主要药效成分与SARS-CoV-23CL水解酶具有良好的结合能力。益肺解毒颗粒可能通过调控多条信号通路,并与SARS-CoV-23CL水解酶结合,从而发挥防治新型冠状病毒感染的作用。 展开更多
关键词 益肺解毒颗粒 新型冠状病毒 网络药理学 分子对接
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白刺花叶总生物碱通过抑制MAPK/NF-κB信号通路减轻脂多糖诱导的RAW264.7细胞炎症反应 被引量:1
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作者 姜盛楠 支文冰 +6 位作者 陈静 孙婷婷 许宗仁 刘帅 张红 李晔 刘洋 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第20期2835-2840,共6页
目的探讨白刺花叶总生物碱(Sophora davidii Hance leaves total alkaloids,SDLTAs)的体外抗炎作用及可能的分子机制。方法采用脂多糖(LPS)诱导RAW264.7细胞炎症模型,给予不同浓度(50、100、200μg/mL)SDLTAs,Griess法检测SDLTAs对细胞N... 目的探讨白刺花叶总生物碱(Sophora davidii Hance leaves total alkaloids,SDLTAs)的体外抗炎作用及可能的分子机制。方法采用脂多糖(LPS)诱导RAW264.7细胞炎症模型,给予不同浓度(50、100、200μg/mL)SDLTAs,Griess法检测SDLTAs对细胞NO表达的影响;ELISA法检测SDLTAs对细胞因子IL-6、TNF-α和IL-1β表达的影响;RT-qPCR法检测细胞中iNOS、NF-κB p65和IκBαmRNA的表达;Western blotting法检测细胞中p-p38、p-p65和p-JNK以及细胞核内NF-κB p65的蛋白表达。结果SDLTAs显著抑制LPS诱导的RAW264.7细胞炎症反应。SDLTAs极显著降低细胞中NO、IL-6、TNF-α和IL-1β的分泌(P<0.01),极显著下调细胞中iNOS、NF-κB p65和IκBαmRNA的表达(P<0.01),极显著降低细胞中p-p38、p-p65和p-JNK以及细胞核内NF-κB p65的蛋白表达(P<0.01)。结论SDLTAs可通过调节MAPK/NF-κB信号通路发挥抗炎作用。 展开更多
关键词 白刺花叶 总生物碱 抗炎 作用机制
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基于网络药理学和分子对接技术探究川芎抗肝纤维化的作用机制 被引量:1
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作者 夏丽 刘洋 +4 位作者 王海峰 白荷荷 马莉 王晓婷 支文冰 《特产研究》 2024年第1期111-118,共8页
为探究川芎抗肝纤维化的活性成分及作用机制。本研究采用网络药理学方法,采用GEO数据库及DisGeNET数据库检索获取肝纤维化靶点;利用TCMSP数据库及文献检索获取川芎化学成分及作用靶点;将川芎药物靶点与疾病靶点取交集,并进行蛋白互作网... 为探究川芎抗肝纤维化的活性成分及作用机制。本研究采用网络药理学方法,采用GEO数据库及DisGeNET数据库检索获取肝纤维化靶点;利用TCMSP数据库及文献检索获取川芎化学成分及作用靶点;将川芎药物靶点与疾病靶点取交集,并进行蛋白互作网络构建及拓扑分析;采用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,利用微生信进行做图;通过Cytoscape软件构建“成分-靶点-信号通路”调控网络。采用分子对接技术针对川芎活性成分和关键靶点进行对接模拟。结果表明,TCMSP数据库检索结合文献研究,筛选得到川芎中8个活性成分及对应的88个作用靶点;GEO数据库筛选及DisGeNET数据库检索获取疾病靶点2038个,交集得到32个川芎治疗肝纤维化的共同靶点,并筛选出转录激活因子3(Signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、前列腺素内过氧化物合成酶2(Recombinant prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS2)和表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)等关键靶点。富集分析表明,川芎治疗肝纤维化的靶点主要参与肝癌信号通路、脂质代谢和动脉粥样硬化、白介素17信号通路和内分泌抵抗等信号通路,涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正向调节过程和信号转导过程等生物学过程。“成分-靶点-信号通路”分析表明,川芎抗肝纤维化活性成分6个,分别为阿魏酸(Ferulic acid,FA)、川芎哚(Perlolyrine)、叶酸(Folic acid)、川芎萘呋内酯(Wallichilide)、亚麻油酸乙酯(Mandenol)和肉豆蔻酮(Myricanone),其中阿魏酸的节点度值最大。分子对接结果表明,川芎抗肝纤维化关键成分阿魏酸和关键靶点PTSG2、MMP9和EGFR分子均具有较好的结合能力,结合能分别为-23.04kJ/mol、-22.17kJ/mol和-25.14kJ/mol。川芎可通过靶向STAT3、PTGS2和EGFR等靶点,调控肝癌和脂质代谢等信号通路,改善肝纤维化病变,发挥保护肝脏的作用。 展开更多
关键词 川芎 肝纤维化 网络药理学 阿魏酸 分子对接
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基于TLR4-NF-κB信号通路的槐果碱改善人支气管上皮细胞炎症和黏液高分泌的机制 被引量:4
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作者 姜盛楠 支文冰 +6 位作者 张红 王晓婷 孙婷婷 许宗仁 陈静 李晔 刘洋 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第19期2461-2468,共8页
目的基于TLR4-NF-κB信号通路探讨槐果碱(SC)体外抗炎作用及其抗哮喘的潜在效应机制。方法采用脂多糖(LPS)刺激人支气管上皮细胞NCI-H292诱导体外炎症模型,给予不同浓度SC进行治疗。采用MTT法筛选LPS和SC对NCI-H292细胞的安全浓度;设Con... 目的基于TLR4-NF-κB信号通路探讨槐果碱(SC)体外抗炎作用及其抗哮喘的潜在效应机制。方法采用脂多糖(LPS)刺激人支气管上皮细胞NCI-H292诱导体外炎症模型,给予不同浓度SC进行治疗。采用MTT法筛选LPS和SC对NCI-H292细胞的安全浓度;设Control组、LPS组(10μg/mL LPS)、SC组(10μg/mL LPS+不同浓度SC),ELISA法检测细胞中黏蛋白5AC(MUC5AC)的表达和上清液中白细胞介素-6(IL-6)和白细胞介素-8(IL-8)的分泌情况;RT-PCR法检测细胞中MUC5AC、IL-6、IL-8、髓样分化因子(MyD88)和核因子-κB(NF-κB p65)mRNA的表达;Western blot方法检测细胞中Toll样受体4(TLR4)、肿瘤坏死因子受体相关蛋白6(TRAF6)、磷酸化p38(p-p38)和磷酸化p65(p-p65)以及细胞核内NF-κB p65的蛋白表达。结果MTT结果显示,LPS和SC分别在0~10μg/mL、0~40μg/mL浓度范围内对细胞活力无影响;ELISA结果表明,与Control组相比,LPS组细胞中MUC5AC含量极显著升高(P<0.01),细胞上清液中IL-6、IL-8也极显著升高(P<0.01);与LPS组相比,SC组细胞中MUC5AC含量极显著降低(P<0.01),细胞上清液中IL-6、IL-8也极显著降低(P<0.01);RT-PCR结果显示,与Control组相比,LPS组细胞中MUC5AC、IL-6、IL-8、MyD88和NF-κB p65 mRNA表达均极显著升高(P<0.01),而SC组细胞中MUC5AC、IL-6、IL-8 mRNA的表达显著降低(P<0.05),MyD88和NF-κB p65 mRNA的表达极显著降低(P<0.01)。Western blotting结果表明,SC可极显著降低LPS诱导的NCI-H292细胞中TRAF6、TLR4、p-p38和p-p65以及细胞核内NF-κB p65蛋白表达(P<0.01)。结论SC可能通过抑制TLR4-NF-κB信号通路,改善气道炎症和黏液高分泌,进而发挥抗哮喘的作用。 展开更多
关键词 槐果碱 NCI-H292细胞 TLR4-NF-κB信号通路 炎症 黏液高分泌
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基于小鼠肺组织蛋白质组学预测哮喘发病机制及潜在治疗靶点
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作者 支文冰 刘洋 +5 位作者 李晔 许宗仁 姜盛楠 周洁 孟雪 张红 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期961-969,共9页
目的以蛋白质组学分析为基础,联合网络药理学技术,初步预测哮喘发病的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点。方法采用卵清蛋白诱导和激发,建立小鼠哮喘模型;通过Maxquant检索,获得质谱蛋白和基因数据,方差分析和t检验获得差异蛋白,建立差... 目的以蛋白质组学分析为基础,联合网络药理学技术,初步预测哮喘发病的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点。方法采用卵清蛋白诱导和激发,建立小鼠哮喘模型;通过Maxquant检索,获得质谱蛋白和基因数据,方差分析和t检验获得差异蛋白,建立差异蛋白聚类分析图谱及靶点集,构建蛋白互作网络图,通过网络可视化分析,预测哮喘发病机制涉及的靶点、信号通路和生物学过程。结果蛋白质组学检索得到5063个基因,以模型组基因表达/空白组基因表达≥2且P≤0.05、模型组基因表达/空白组基因表达≤1/2且P≤0.05为条件筛选得到的差异基因共904个,聚类分析分为3簇,模型组与空白组比较,上调基因595个,下调基因309个;哮喘发病机制可能涉及调控代谢、FcγR介导的吞噬、白细胞内皮迁移、肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、B细胞受体信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路、血管平滑肌收缩和细胞黏附等相关通路;筛选得到的作用靶点包括ITGB3、CYBB、SYK、VWF、ITGB2、MYD88、COMP、VEGFA和FCGR2B;且哮喘病变主要影响信号转导、氧化还原过程、免疫应答、炎症反应、细胞黏附、GTP酶活性正调控、细胞凋亡和细胞外基质形成过程等生物学过程。结论初步揭示了9个哮喘潜在的治疗靶点,其中靶点VWF和COMP鲜有报道,哮喘发病机制涉及代谢调控、B细胞信号通路和Fc gamma R介导的吞噬等相关信号通路。 展开更多
关键词 哮喘模型 蛋白质组学 网络药理 作用靶点
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