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基于网络药理学和分子对接分析探讨消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎的可行性
被引量：
5
1
作者
周瑞
刘妍如
+6 位作者
王征
张军武
李宏
许洪波
何姬
张玉茹
唐志书
《中国现代中药》
CAS
2020年第4期475-483,共9页
目的:运用网络药理学和分子对接法分析消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可行性。方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)和Pubchem数据库检索消炎退热合剂中大青叶、蒲公英、紫花地丁、甘草的化学成分和作用靶点。通过Uni...
目的:运用网络药理学和分子对接法分析消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可行性。方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)和Pubchem数据库检索消炎退热合剂中大青叶、蒲公英、紫花地丁、甘草的化学成分和作用靶点。通过UniProt、GeneCards等数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape3.7.2构建化合物-靶点(基因)网络,采用R软件包(3.6.2)的Cluster profiler包对交集靶点进行GO(Gene Ontology)生物信息学富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制,采用ChemOffice软件将筛选出的18个核心化学成分与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果:化合物-靶点网络包含4种药材,117个化合物和相应靶点498个,与疾病靶点144个交集后,筛选出关键的核心化合物18个,对应的疾病靶点27个,关键靶点涉及肾上腺素能受体β2抗体(ADRB2)、前列腺素过氧化物合酶1(PTGS1)、凝血酶原(F2)、肿瘤坏死因子(TNF)、肾素(REN)及血管紧张素转化酶(ACE2)等。GO功能分析得到GO条目910个(P<0.05)。其中生物过程(BP)条目867个,细胞组成(CC)条目6个,分子功能(MF)条目37个。KEGG通路富集筛选到10条信号通路(P<0.05),主要涉及cAMP信号通路、病毒蛋白与细胞因子受体间相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、细胞因子相互作用受体通路、肾素-血管紧张素系统等。分子对接结果显示靛蓝、β-谷甾醇、γ-谷甾醇、十八碳二烯酸、亚油酸甲酯及高丽槐素6个核心化合物与ACE2结合力和临床推荐用药氯喹的相近。结论:消炎退热合剂中的活性化合物靛蓝、β-谷甾醇、γ-谷甾醇、十八碳二烯酸、亚油酸甲酯及高丽槐素可能通过与ACE2结合,且可能通过作用于ADRB2、PTGS1、F2、TNF、REN等靶点调节多条信号通路,通过以上结果预测该复方对COVID-19具有潜在的干预作用。
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关键词
新型冠状病毒肺炎
消炎退热合剂
网络药理学
分子对接
血管紧张素转换酶Ⅱ
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职称材料
基于“扶正祛邪”理论的生血宝合剂辅助治疗新型冠状病毒肺炎的可行性分析
被引量：
9
2
作者
于金高
唐志书
+6 位作者
刘妍如
许洪波
周瑞
宋忠兴
闫亚峰
常爱冰
周建平
《中国现代中药》
CAS
2020年第4期504-511,551,共9页
目的:基于“扶正祛邪”理论研究生血宝合剂对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在辅助治疗作用。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库中搜集生血宝合剂各药味含有的化学成分及其相应靶点,并通过与严重急性呼吸综合征(SARS)等疾病...
目的:基于“扶正祛邪”理论研究生血宝合剂对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在辅助治疗作用。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库中搜集生血宝合剂各药味含有的化学成分及其相应靶点,并通过与严重急性呼吸综合征(SARS)等疾病靶点进行交集分析,筛选生血宝合剂潜在的抗病毒性肺炎作用靶点及其活性成分;通过UniProt数据库、GeneCards数据库查询以及Cytoscape软件分析,构建中药-活性成分-抗病毒性肺炎靶点网络,揭示生血宝合剂可能的抗病毒性肺炎作用途径;通过R语言软件进行基因本体(GO)富集分析和KEGG信号通路富集分析,揭示相关生物学信息;最后借助DS16软件的LibDock程序进行人ACE2蛋白、新型冠状病毒S蛋白的对接研究,筛选生血宝合剂中可能抑制新型冠状病毒感染过程的活性成分。结果:从何首乌等7味中药中共收集到143个化学成分和660个作用靶点,其中45个化学成分及其对应的39个作用靶点与SARS等疾病密切相关;黄酮、蒽醌和多酚(酚酸)类成分是生血宝合剂潜在的抗病毒性肺炎活性成分,主要作用于免疫和炎症调节、凝血功能调节以及病毒入侵等过程。网络分析和富集分析表明,女贞子、桑椹、墨旱莲等对于抗病毒性肺炎作用贡献较大,主要涉及炎症调节和病毒感染等相关通路。女贞果苷D等5个活性成分与人ACE2蛋白和新型冠状病毒S蛋白均具有较强的相互作用,可能直接起到抑制新型冠状病毒的作用。结论:生血宝合剂可能通过调节机体炎症和免疫功能、凝血功能以及病毒入侵过程从而可能对COVID-19发挥潜在的辅助治疗作用。
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关键词
生血宝合剂
新型冠状病毒肺炎
扶正祛邪
网络药理学
炎症
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接分析探讨消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎的可行性
被引量：
5
1
作者
周瑞
刘妍如
王征
张军武
李宏
许洪波
何姬
张玉茹
唐志书
机构
陕西
中医药大学
陕西
中药
资源
产业化
省
部
共建
协同
创新
中心/
秦
药
特色
资源
研究与
开发
国家
重点
实验室
(
培育
)/
陕西省
创新
药物
研究
中心
陕西
中医药大学
制
药
厂/
陕西省
博士后
创新
基地
出处
《中国现代中药》
CAS
2020年第4期475-483,共9页
基金
2020年度咸阳市重点研发计划“新型冠状病毒肺炎疫情应急防治”科技专项
陕西省三秦学者创新团队(陕组通字[2018]34号)
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-21)。
文摘
目的:运用网络药理学和分子对接法分析消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可行性。方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)和Pubchem数据库检索消炎退热合剂中大青叶、蒲公英、紫花地丁、甘草的化学成分和作用靶点。通过UniProt、GeneCards等数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape3.7.2构建化合物-靶点(基因)网络,采用R软件包(3.6.2)的Cluster profiler包对交集靶点进行GO(Gene Ontology)生物信息学富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制,采用ChemOffice软件将筛选出的18个核心化学成分与血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果:化合物-靶点网络包含4种药材,117个化合物和相应靶点498个,与疾病靶点144个交集后,筛选出关键的核心化合物18个,对应的疾病靶点27个,关键靶点涉及肾上腺素能受体β2抗体(ADRB2)、前列腺素过氧化物合酶1(PTGS1)、凝血酶原(F2)、肿瘤坏死因子(TNF)、肾素(REN)及血管紧张素转化酶(ACE2)等。GO功能分析得到GO条目910个(P<0.05)。其中生物过程(BP)条目867个,细胞组成(CC)条目6个,分子功能(MF)条目37个。KEGG通路富集筛选到10条信号通路(P<0.05),主要涉及cAMP信号通路、病毒蛋白与细胞因子受体间相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、细胞因子相互作用受体通路、肾素-血管紧张素系统等。分子对接结果显示靛蓝、β-谷甾醇、γ-谷甾醇、十八碳二烯酸、亚油酸甲酯及高丽槐素6个核心化合物与ACE2结合力和临床推荐用药氯喹的相近。结论:消炎退热合剂中的活性化合物靛蓝、β-谷甾醇、γ-谷甾醇、十八碳二烯酸、亚油酸甲酯及高丽槐素可能通过与ACE2结合,且可能通过作用于ADRB2、PTGS1、F2、TNF、REN等靶点调节多条信号通路,通过以上结果预测该复方对COVID-19具有潜在的干预作用。
关键词
新型冠状病毒肺炎
消炎退热合剂
网络药理学
分子对接
血管紧张素转换酶Ⅱ
Keywords
COVID-19
Xiaoyan Tuire Mixture
network pharmacology
molecular docking
angiotensin converting enzyme Ⅱ
分类号
R289 [医药卫生—方剂学]
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于“扶正祛邪”理论的生血宝合剂辅助治疗新型冠状病毒肺炎的可行性分析
被引量：
9
2
作者
于金高
唐志书
刘妍如
许洪波
周瑞
宋忠兴
闫亚峰
常爱冰
周建平
机构
陕西
中医药大学
陕西
中药
资源
产业化
省
部
共建
协同
创新
中心/
秦
药
特色
资源
研究与
开发
国家
重点
实验室
(
培育
)/
陕西省
创新
药物
研究
中心
清华德人西安幸福制
药
有限公司
出处
《中国现代中药》
CAS
2020年第4期504-511,551,共9页
基金
2020年度咸阳市重点研发计划“新型冠状病毒肺炎疫情应急防治”科技专项
陕西省三秦学者创新团队(陕组通字[2018]34号)。
文摘
目的:基于“扶正祛邪”理论研究生血宝合剂对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在辅助治疗作用。方法:从中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库中搜集生血宝合剂各药味含有的化学成分及其相应靶点,并通过与严重急性呼吸综合征(SARS)等疾病靶点进行交集分析,筛选生血宝合剂潜在的抗病毒性肺炎作用靶点及其活性成分;通过UniProt数据库、GeneCards数据库查询以及Cytoscape软件分析,构建中药-活性成分-抗病毒性肺炎靶点网络,揭示生血宝合剂可能的抗病毒性肺炎作用途径;通过R语言软件进行基因本体(GO)富集分析和KEGG信号通路富集分析,揭示相关生物学信息;最后借助DS16软件的LibDock程序进行人ACE2蛋白、新型冠状病毒S蛋白的对接研究,筛选生血宝合剂中可能抑制新型冠状病毒感染过程的活性成分。结果:从何首乌等7味中药中共收集到143个化学成分和660个作用靶点,其中45个化学成分及其对应的39个作用靶点与SARS等疾病密切相关;黄酮、蒽醌和多酚(酚酸)类成分是生血宝合剂潜在的抗病毒性肺炎活性成分,主要作用于免疫和炎症调节、凝血功能调节以及病毒入侵等过程。网络分析和富集分析表明,女贞子、桑椹、墨旱莲等对于抗病毒性肺炎作用贡献较大,主要涉及炎症调节和病毒感染等相关通路。女贞果苷D等5个活性成分与人ACE2蛋白和新型冠状病毒S蛋白均具有较强的相互作用,可能直接起到抑制新型冠状病毒的作用。结论:生血宝合剂可能通过调节机体炎症和免疫功能、凝血功能以及病毒入侵过程从而可能对COVID-19发挥潜在的辅助治疗作用。
关键词
生血宝合剂
新型冠状病毒肺炎
扶正祛邪
网络药理学
炎症
Keywords
Shengxuebao Mixture
COVID-19
strengthening body resistance and eliminating evil
network pharmacology
inflammation
分类号
R289 [医药卫生—方剂学]
R285 [医药卫生—中药学]
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基于网络药理学和分子对接分析探讨消炎退热合剂干预新型冠状病毒肺炎的可行性
周瑞
刘妍如
王征
张军武
李宏
许洪波
何姬
张玉茹
唐志书
《中国现代中药》
CAS
2020
5
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职称材料
2
基于“扶正祛邪”理论的生血宝合剂辅助治疗新型冠状病毒肺炎的可行性分析
于金高
唐志书
刘妍如
许洪波
周瑞
宋忠兴
闫亚峰
常爱冰
周建平
《中国现代中药》
CAS
2020
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