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牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析
被引量：
4
1
作者
曹政
居马别克·夏拉巴依
+1 位作者
李春燕
马力克·艾则孜
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期460-468,共9页
旨在探索牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)与宿主细胞的相互作用,采集了具有典型临床症状的牛皮肤病变组织,接种MDBK细胞进行病毒分离,采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞,同时对感染后24 h的MDBK细胞...
旨在探索牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)与宿主细胞的相互作用,采集了具有典型临床症状的牛皮肤病变组织,接种MDBK细胞进行病毒分离,采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞,同时对感染后24 h的MDBK细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因并将其按功能分类,分析它们参与的细胞信号通路。结果显示,LSDV在电镜下呈椭圆形,病毒粒子大小约320 nm×260 nm。转录组分析发现,与未处理组相比,显著差异表达的基因共499个,其中,112个基因上调表达,387个基因下调表达。通过GO和KEGG分析得知,差异表达基因主要富集在从细胞表面传导信号至细胞核内部的MAPK信号通路,其中,参与天然免疫且涉及细胞凋亡的MAP3K1基因表达呈现显著下调,提示病毒感染会影响宿主细胞的迁移与凋亡等过程。显著变化基因包括HIF1A、RORA、LRRK2、AP3B1和ANO6等,分别涉及到调节血管内皮生长因子、炎症反应、细胞增殖分化以及信号转导等功能,除此之外,不饱和脂肪酸及胆汁分泌两个信号通路也发生了显著变化。本研究为进一步深入探究LSDV的致病机制奠定了基础。
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关键词
牛结节性皮肤病病毒
MDBK细胞
高通量测序
转录组
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题名
牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析
被引量：
4
1
作者
曹政
居马别克·夏拉巴依
李春燕
马力克·艾则孜
机构
重庆市畜牧科学院
新疆维吾尔自治区动物卫生监督所
陆军军医大学第一附属医院全军临床病理学研究所
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期460-468,共9页
基金
科研机构绩效引导专项(CSSA2019ZN038)。
文摘
旨在探索牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)与宿主细胞的相互作用,采集了具有典型临床症状的牛皮肤病变组织,接种MDBK细胞进行病毒分离,采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞,同时对感染后24 h的MDBK细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因并将其按功能分类,分析它们参与的细胞信号通路。结果显示,LSDV在电镜下呈椭圆形,病毒粒子大小约320 nm×260 nm。转录组分析发现,与未处理组相比,显著差异表达的基因共499个,其中,112个基因上调表达,387个基因下调表达。通过GO和KEGG分析得知,差异表达基因主要富集在从细胞表面传导信号至细胞核内部的MAPK信号通路,其中,参与天然免疫且涉及细胞凋亡的MAP3K1基因表达呈现显著下调,提示病毒感染会影响宿主细胞的迁移与凋亡等过程。显著变化基因包括HIF1A、RORA、LRRK2、AP3B1和ANO6等,分别涉及到调节血管内皮生长因子、炎症反应、细胞增殖分化以及信号转导等功能,除此之外,不饱和脂肪酸及胆汁分泌两个信号通路也发生了显著变化。本研究为进一步深入探究LSDV的致病机制奠定了基础。
关键词
牛结节性皮肤病病毒
MDBK细胞
高通量测序
转录组
Keywords
lumpy skin disease virus(LSDV)
MDBK cells
high throughput sequencing
transcriptome
分类号
S852.659.1 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析
曹政
居马别克·夏拉巴依
李春燕
马力克·艾则孜
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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