目的探讨人乙醛脱氢酶家族1成员A3(aldehyde dehydrogenase 1 family member A3,ALDH1A3)在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达情况,并研究其对胰腺癌侵袭的调控及可能的机制。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数...目的探讨人乙醛脱氢酶家族1成员A3(aldehyde dehydrogenase 1 family member A3,ALDH1A3)在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达情况,并研究其对胰腺癌侵袭的调控及可能的机制。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中胰腺癌患者数据集、基因组织表达项目(Genotype-Tissue Expression Project,GTEx)中正常胰腺组织基因表达谱数据和肿瘤细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)数据库中胰腺癌细胞系的基因表达谱矩阵,分析ALDH家族各亚型的表达情况;Transwell实验检测敲低ALDH1A3对胰腺癌细胞侵袭能力的影响;基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨ALDH1A3与JAK/STAT3通路活化的关系。结果 ALDH1A3在胰腺癌组织中的表达高于正常胰腺组织;在胰腺癌细胞系中的表达高于其他ALDH亚型;下调ALDH1A3可以降低胰腺癌细胞系的侵袭能力;JAK/STAT3通路在ALDH1A3高表达胰腺癌患者中显著富集;下调ALDH1A3可抑制STAT3的磷酸化。结论 ALDH1A3参与调控胰腺癌细胞的侵袭,其机制可能与JAK/STAT3通路的活化有关。展开更多
目的观察C型尼曼-匹克蛋白2(Niemann-Pick protein C2,NPC2)在胃癌中的表达情况,分析其预后意义,初步探讨NPC2对胃癌的调控作用。方法利用胃癌数据库和组织芯片,比较NPC2在胃癌与正常胃黏膜中的表达差异;列联表分析NPC2表达与胃癌患者...目的观察C型尼曼-匹克蛋白2(Niemann-Pick protein C2,NPC2)在胃癌中的表达情况,分析其预后意义,初步探讨NPC2对胃癌的调控作用。方法利用胃癌数据库和组织芯片,比较NPC2在胃癌与正常胃黏膜中的表达差异;列联表分析NPC2表达与胃癌患者临床病理参数的相关性;Kaplan-Meier分析和COX回归分析NPC2表达在胃癌中的预后判断意义;通过GSEA挖掘NPC2调控胃癌细胞的可能分子机制;利用Transwell试验检测下调NPC2后胃癌细胞迁移能力的变化。结果相较于正常胃黏膜,NPC2在胃癌中高表达[GSE33335:(7.917±0.077)vs(7.601±0.074),P=0.0096;GSE63089:(9.083±0.123)vs(8.435±0.148),P=0.0001;组织芯片:(4.596±0.230)vs(3.336±0.176),P<0.0001];其表达水平与胃癌患者的AJCC临床分期(GSE15459:P=0.009;组织芯片:P=0.04)、区域淋巴结转移(组织芯片:P=0.04)等临床病理参数相关;NPC2高表达者预后不良(TCGA:P<0.0001;GSE15459:P=0.0023;组织芯片:P=0.0032),其表达水平是胃癌的独立预后预测因素(TCGA:风险比为2.140,95%CI为1.523~3.006,P<0.0001;组织芯片:风险比为1.926,95%CI为1.108~3.348,P=0.02);细胞黏附分子相关基因在NPC2高表达胃癌中显著富集,提示其或与胃癌细胞的侵袭迁移相关;下调胃癌细胞中的NPC2表达后,显著抑制其迁移能力(NC组vs si-1组:P=0.00004;NC组vs si-2组:P=0.000449)。结论NPC2表达与胃癌患者预后密切相关,并在细胞迁移中发挥重要调控作用,可作为胃癌的潜在诊疗靶标。展开更多
文摘目的探讨人乙醛脱氢酶家族1成员A3(aldehyde dehydrogenase 1 family member A3,ALDH1A3)在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达情况,并研究其对胰腺癌侵袭的调控及可能的机制。方法利用癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中胰腺癌患者数据集、基因组织表达项目(Genotype-Tissue Expression Project,GTEx)中正常胰腺组织基因表达谱数据和肿瘤细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)数据库中胰腺癌细胞系的基因表达谱矩阵,分析ALDH家族各亚型的表达情况;Transwell实验检测敲低ALDH1A3对胰腺癌细胞侵袭能力的影响;基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨ALDH1A3与JAK/STAT3通路活化的关系。结果 ALDH1A3在胰腺癌组织中的表达高于正常胰腺组织;在胰腺癌细胞系中的表达高于其他ALDH亚型;下调ALDH1A3可以降低胰腺癌细胞系的侵袭能力;JAK/STAT3通路在ALDH1A3高表达胰腺癌患者中显著富集;下调ALDH1A3可抑制STAT3的磷酸化。结论 ALDH1A3参与调控胰腺癌细胞的侵袭,其机制可能与JAK/STAT3通路的活化有关。
文摘目的观察C型尼曼-匹克蛋白2(Niemann-Pick protein C2,NPC2)在胃癌中的表达情况,分析其预后意义,初步探讨NPC2对胃癌的调控作用。方法利用胃癌数据库和组织芯片,比较NPC2在胃癌与正常胃黏膜中的表达差异;列联表分析NPC2表达与胃癌患者临床病理参数的相关性;Kaplan-Meier分析和COX回归分析NPC2表达在胃癌中的预后判断意义;通过GSEA挖掘NPC2调控胃癌细胞的可能分子机制;利用Transwell试验检测下调NPC2后胃癌细胞迁移能力的变化。结果相较于正常胃黏膜,NPC2在胃癌中高表达[GSE33335:(7.917±0.077)vs(7.601±0.074),P=0.0096;GSE63089:(9.083±0.123)vs(8.435±0.148),P=0.0001;组织芯片:(4.596±0.230)vs(3.336±0.176),P<0.0001];其表达水平与胃癌患者的AJCC临床分期(GSE15459:P=0.009;组织芯片:P=0.04)、区域淋巴结转移(组织芯片:P=0.04)等临床病理参数相关;NPC2高表达者预后不良(TCGA:P<0.0001;GSE15459:P=0.0023;组织芯片:P=0.0032),其表达水平是胃癌的独立预后预测因素(TCGA:风险比为2.140,95%CI为1.523~3.006,P<0.0001;组织芯片:风险比为1.926,95%CI为1.108~3.348,P=0.02);细胞黏附分子相关基因在NPC2高表达胃癌中显著富集,提示其或与胃癌细胞的侵袭迁移相关;下调胃癌细胞中的NPC2表达后,显著抑制其迁移能力(NC组vs si-1组:P=0.00004;NC组vs si-2组:P=0.000449)。结论NPC2表达与胃癌患者预后密切相关,并在细胞迁移中发挥重要调控作用,可作为胃癌的潜在诊疗靶标。
