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番茄群体果实光泽度评价及全基因组关联分析
1
作者
董舒超
张静雯
+7 位作者
凌嘉怡
洪骏
谢紫欣
张胜军
宋刘霞
王银磊
赵统敏
赵丽萍
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第5期36-41,共6页
果实光泽度是评价番茄外观品质的重要指标之一。为挖掘高果实光泽度的番茄种质资源和调控番茄果实光泽度的关键基因,利用微孔光泽度仪NHG60M,于2023年春季对201份大果番茄、88份樱桃番茄和8份醋栗番茄种质的第2穗成熟果实表面光泽度进...
果实光泽度是评价番茄外观品质的重要指标之一。为挖掘高果实光泽度的番茄种质资源和调控番茄果实光泽度的关键基因,利用微孔光泽度仪NHG60M,于2023年春季对201份大果番茄、88份樱桃番茄和8份醋栗番茄种质的第2穗成熟果实表面光泽度进行快速无损测定,并进行统计分析和全基因组关联分析(Genome-Wide Association Studies, GWAS)。鉴定出果实光泽度在1.13~2.30之间的低光泽种质TS-21、TS-413、TS-270、TS-594、TS-604、TS-256、TS-258、TS-272、TS-643和TS-195,以及果实光泽度在11.90~18.70之间的高光泽种质TS-203、TS-653、TS-543、TS-588、TS-592、TS-587、TS-539、TS-210、TS-519和TS-577。GWAS分析共检测到2个与番茄果实光泽度显著关联的SNP位点:位于1号染色体63 041 874 bp位置的S01.1826715和位于5号染色体8 787 996 bp位置的S05.0271578,2个位点分别可以解释15.67%和33.62%的表型变异。挖掘到2个调控番茄果实光泽度的候选基因,基因ID分别为Solyc05g014760和Solyc05g014710,2个基因主要在番茄果实中表达,分别编码细胞分裂蛋白激酶10和Remorin蛋白,与细胞壁形成、表皮角质积累的调控具有相关性。研究结果有助于解析番茄果实光泽度的遗传基础及其调控机制,为番茄外观品质遗传改良奠定基础。
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关键词
番茄
果实
光泽度
全基因组关联分析
候选基因
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职称材料
题名
番茄群体果实光泽度评价及全基因组关联分析
1
作者
董舒超
张静雯
凌嘉怡
洪骏
谢紫欣
张胜军
宋刘霞
王银磊
赵统敏
赵丽萍
机构
江苏省
农业
科学院蔬菜
研究
所
江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
南京
农业
大学
园艺学院
扬州
大学
园艺园林学院
阿卜杜拉国王科技大学沙漠农业研究中心
伊犁哈萨克自治州
农业
科学
研究
所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第5期36-41,共6页
基金
江苏省自然科学基金青年基金(编号:BK20220743)
国家自然科学基金青年基金(编号:32202489)
+3 种基金
江苏省重点研发计划现代农业项目(编号:BE2022339)
江苏省现代农业(蔬菜)产业技术体系建设专项(编号:JATS[2023]391)
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目[编号:JBGS(2021)066]
南京市品种选育专项(编号:202210023)。
文摘
果实光泽度是评价番茄外观品质的重要指标之一。为挖掘高果实光泽度的番茄种质资源和调控番茄果实光泽度的关键基因,利用微孔光泽度仪NHG60M,于2023年春季对201份大果番茄、88份樱桃番茄和8份醋栗番茄种质的第2穗成熟果实表面光泽度进行快速无损测定,并进行统计分析和全基因组关联分析(Genome-Wide Association Studies, GWAS)。鉴定出果实光泽度在1.13~2.30之间的低光泽种质TS-21、TS-413、TS-270、TS-594、TS-604、TS-256、TS-258、TS-272、TS-643和TS-195,以及果实光泽度在11.90~18.70之间的高光泽种质TS-203、TS-653、TS-543、TS-588、TS-592、TS-587、TS-539、TS-210、TS-519和TS-577。GWAS分析共检测到2个与番茄果实光泽度显著关联的SNP位点:位于1号染色体63 041 874 bp位置的S01.1826715和位于5号染色体8 787 996 bp位置的S05.0271578,2个位点分别可以解释15.67%和33.62%的表型变异。挖掘到2个调控番茄果实光泽度的候选基因,基因ID分别为Solyc05g014760和Solyc05g014710,2个基因主要在番茄果实中表达,分别编码细胞分裂蛋白激酶10和Remorin蛋白,与细胞壁形成、表皮角质积累的调控具有相关性。研究结果有助于解析番茄果实光泽度的遗传基础及其调控机制,为番茄外观品质遗传改良奠定基础。
关键词
番茄
果实
光泽度
全基因组关联分析
候选基因
分类号
S641.201 [农业科学—蔬菜学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
番茄群体果实光泽度评价及全基因组关联分析
董舒超
张静雯
凌嘉怡
洪骏
谢紫欣
张胜军
宋刘霞
王银磊
赵统敏
赵丽萍
《江苏农业科学》
北大核心
2024
0
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