以前期转录组测序结果为基础,利用SSR分子标记技术对姜荷花SSR引物进行开发,并验证所开发引物的通用性及有效性,分析其多态性。用Primer 6.0软件设计的97对引物在姜荷花资源中进行验证,确定了32对具有多态性的SSR引物。32对引物多态信...以前期转录组测序结果为基础,利用SSR分子标记技术对姜荷花SSR引物进行开发,并验证所开发引物的通用性及有效性,分析其多态性。用Primer 6.0软件设计的97对引物在姜荷花资源中进行验证,确定了32对具有多态性的SSR引物。32对引物多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.5047,期望杂合度(expected heterozygosity,He)平均值为0.284。Shannon遗传多样性指数(Shannon's information index,I)平均值为0.435;平均遗传分化系数(genetic differentiation,Fst)为0.642。通过N-J聚类图分析,得出此32对引物可有效理清10份姜荷花资源之间的亲缘关系。为姜荷花各品种的重要性状基因遗传定位和遗传多样性的研究提供了重要基础数据,有利于姜荷花的鉴定及遗传研究。展开更多
文摘以前期转录组测序结果为基础,利用SSR分子标记技术对姜荷花SSR引物进行开发,并验证所开发引物的通用性及有效性,分析其多态性。用Primer 6.0软件设计的97对引物在姜荷花资源中进行验证,确定了32对具有多态性的SSR引物。32对引物多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.5047,期望杂合度(expected heterozygosity,He)平均值为0.284。Shannon遗传多样性指数(Shannon's information index,I)平均值为0.435;平均遗传分化系数(genetic differentiation,Fst)为0.642。通过N-J聚类图分析,得出此32对引物可有效理清10份姜荷花资源之间的亲缘关系。为姜荷花各品种的重要性状基因遗传定位和遗传多样性的研究提供了重要基础数据,有利于姜荷花的鉴定及遗传研究。
