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Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
栗学清
庞鑫
+3 位作者
高慧芳
张廉芸
宋英达
武翠玲
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022年第9期125-130,共6页
目的:预测海洋菌Rheinheimera sp.QH分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据。方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸...
目的:预测海洋菌Rheinheimera sp.QH分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据。方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等进行分析。结果:KerQH2为S8家族丝氨酸蛋白酶,其分子表面无规则卷曲占比较高,α-螺旋与β-折叠占比较低且多位于酶分子内部。KerQH2具有保守的催化三联体(Asp8、His41和Ser197),催化三联体区域表面静电势为中性。KerQH2催化结构域中含有大量保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,与底物结合有关的序列富含Gly和Ala。KerQH2主要切割疏水性氨基酸Val(V)/ILe(I)和极性氨基酸Cys(C)/Gln(Q)之间形成的肽键。结论:角蛋白酶KerQH2的特殊结构有助于其降解结构复杂角蛋白分子,这可能是海洋菌对海洋寡营养环境的一种适应性。
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关键词
角蛋白酶
KerQH2
海洋菌
Rheinheimera
sp.
生物信息学
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职称材料
题名
Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
栗学清
庞鑫
高慧芳
张廉芸
宋英达
武翠玲
机构
长治医学院基础医学部生物化学与分子生物学教研室
长治
医学院
精神卫生系
长治
医学院
临床
医学
系
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022年第9期125-130,共6页
基金
山西省自然科学基金项目(201801D221284)
长治医学院科学技术带头人(XS202002)。
文摘
目的:预测海洋菌Rheinheimera sp.QH分泌的角蛋白酶KerQH2的结构特征及与底物的互作位点,为深入研究KerQH2对角蛋白底物的降解机理提供理论依据。方法:应用生物信息学技术对KerQH2的结构特征、作用于角蛋白底物的可能位点及关键氨基酸等进行分析。结果:KerQH2为S8家族丝氨酸蛋白酶,其分子表面无规则卷曲占比较高,α-螺旋与β-折叠占比较低且多位于酶分子内部。KerQH2具有保守的催化三联体(Asp8、His41和Ser197),催化三联体区域表面静电势为中性。KerQH2催化结构域中含有大量保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,与底物结合有关的序列富含Gly和Ala。KerQH2主要切割疏水性氨基酸Val(V)/ILe(I)和极性氨基酸Cys(C)/Gln(Q)之间形成的肽键。结论:角蛋白酶KerQH2的特殊结构有助于其降解结构复杂角蛋白分子,这可能是海洋菌对海洋寡营养环境的一种适应性。
关键词
角蛋白酶
KerQH2
海洋菌
Rheinheimera
sp.
生物信息学
Keywords
keratinase
KerQH2
marine bacteria
Rheinheimera sp.
bioinformatics
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
Rheinheimera sp.QH胞外角蛋白酶KerQH2的生物信息学分析
栗学清
庞鑫
高慧芳
张廉芸
宋英达
武翠玲
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2022
1
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