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长江口泥螺群体遗传多样性的AFLP分析
被引量：
2
1
作者
杨梅
徐嘉伟
+1 位作者
王成辉
张文驹
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期20-25,共6页
本研究应用AFLP分子标记技术,对我国长江口泥螺的4个群体（江苏启东,崇明东滩,九段沙湿地国家自然保护区和上海南汇）进行了遗传多样性分析。4对AFLP引物扩增得到577个位点,启东、崇明、九段沙和南汇群体的多态率分别为78.2%、56.0%、58...
本研究应用AFLP分子标记技术,对我国长江口泥螺的4个群体（江苏启东,崇明东滩,九段沙湿地国家自然保护区和上海南汇）进行了遗传多样性分析。4对AFLP引物扩增得到577个位点,启东、崇明、九段沙和南汇群体的多态率分别为78.2%、56.0%、58.4%和57.9%。群体总基因多样性为0.2218,显示出较高的遗传多样性水平,且96%以上的遗传变异存在于群体内,群体间的遗传分化极微小（0.0000~0.0404）。群体间Nei’s遗传距离为0.0000~0.0124,主要存在于江苏启东群体和其他3个群体之间。利用STRUCTURE分析群体隐性遗传结构,结果表明长江口泥螺群体有3种遗传来源,同时群体之间有强大的基因流。泥螺较强的扩散能力和海洋开放的环境可能是造成泥螺群体遗传同质性较高的主要原因。
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关键词
泥螺
AFLP
遗传多样性
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职称材料
黄鳝Ⅰ型α螺旋细胞因子中6个白介素基因的序列特征及表达分析
2
作者
谢梦
张哲华
+2 位作者
周江
许巧情
邹远超
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期208-216,共9页
为了解白介素在黄鳝抗维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)感染过程中的分子机制,利用生物信息学方法分析了黄鳝il-6、il-12p35、il-12p40、il-15、ebi3和il-34基因及其编码蛋白的序列特征,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了这些...
为了解白介素在黄鳝抗维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)感染过程中的分子机制,利用生物信息学方法分析了黄鳝il-6、il-12p35、il-12p40、il-15、ebi3和il-34基因及其编码蛋白的序列特征,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了这些基因在健康和维氏气单胞菌感染后黄鳝中的表达模式。结果显示,黄鳝6个白介素蛋白氨基酸序列与尼罗罗非鱼相似性最高且进化关系最近;6个白介素基因与其他鱼类的基因结构基本相同;共线性分析显示il-15在进化上相对保守;白介素基因在健康黄鳝不同组织中均有表达;与对照组相比,白介素基因的表达在维氏气单胞菌感染后均发生了显著变化,其中,il-6、il-12p35和ebi3参与早期阶段的黄鳝抗菌免疫反应。研究结果表明,il-6、il-12p35、il-12p40、il-15、e bi3和il-34基因在黄鳝抵抗病原入侵的免疫防御活动中均有调控作用。
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关键词
黄鳝
维氏气单胞菌
白介素
基因结构
表达分析
免疫防御
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职称材料
题名
长江口泥螺群体遗传多样性的AFLP分析
被引量：
2
1
作者
杨梅
徐嘉伟
王成辉
张文驹
机构
长江大学教育部湿地生态与农业利用工程研究中心
上海海洋
大学
农业
部水产种质资源与养殖
生态
重点开放实验室
复旦
大学
教育部
生物多样性与
生态
工程
重点实验室
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期20-25,共6页
基金
长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放基金(KF201411)~~
文摘
本研究应用AFLP分子标记技术,对我国长江口泥螺的4个群体（江苏启东,崇明东滩,九段沙湿地国家自然保护区和上海南汇）进行了遗传多样性分析。4对AFLP引物扩增得到577个位点,启东、崇明、九段沙和南汇群体的多态率分别为78.2%、56.0%、58.4%和57.9%。群体总基因多样性为0.2218,显示出较高的遗传多样性水平,且96%以上的遗传变异存在于群体内,群体间的遗传分化极微小（0.0000~0.0404）。群体间Nei’s遗传距离为0.0000~0.0124,主要存在于江苏启东群体和其他3个群体之间。利用STRUCTURE分析群体隐性遗传结构,结果表明长江口泥螺群体有3种遗传来源,同时群体之间有强大的基因流。泥螺较强的扩散能力和海洋开放的环境可能是造成泥螺群体遗传同质性较高的主要原因。
关键词
泥螺
AFLP
遗传多样性
Keywords
Bullacta exarata
amplified fragment length polymorphism
genetic diversity
分类号
S963 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
黄鳝Ⅰ型α螺旋细胞因子中6个白介素基因的序列特征及表达分析
2
作者
谢梦
张哲华
周江
许巧情
邹远超
机构
长江大学教育部湿地生态与农业利用工程研究中心
内江师范学院生命科学学院/
长江
上游鱼类资源保护与
利用
四川省重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期208-216,共9页
基金
长江大学教育部湿地生态与农业利用工程研究中心开放课题(KF202114)
农业农村部长江中上游渔业资源与环境科学开放项目(FRESES201901)
农业农村部长江渔业资源与环境调查项目(CJDC-2017-09)。
文摘
为了解白介素在黄鳝抗维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)感染过程中的分子机制,利用生物信息学方法分析了黄鳝il-6、il-12p35、il-12p40、il-15、ebi3和il-34基因及其编码蛋白的序列特征,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了这些基因在健康和维氏气单胞菌感染后黄鳝中的表达模式。结果显示,黄鳝6个白介素蛋白氨基酸序列与尼罗罗非鱼相似性最高且进化关系最近;6个白介素基因与其他鱼类的基因结构基本相同;共线性分析显示il-15在进化上相对保守;白介素基因在健康黄鳝不同组织中均有表达;与对照组相比,白介素基因的表达在维氏气单胞菌感染后均发生了显著变化,其中,il-6、il-12p35和ebi3参与早期阶段的黄鳝抗菌免疫反应。研究结果表明,il-6、il-12p35、il-12p40、il-15、e bi3和il-34基因在黄鳝抵抗病原入侵的免疫防御活动中均有调控作用。
关键词
黄鳝
维氏气单胞菌
白介素
基因结构
表达分析
免疫防御
Keywords
Monopterus albus
Aeromonas veronii
interleukin
gene structure
expression analysis
immune defense
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长江口泥螺群体遗传多样性的AFLP分析
杨梅
徐嘉伟
王成辉
张文驹
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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职称材料
2
黄鳝Ⅰ型α螺旋细胞因子中6个白介素基因的序列特征及表达分析
谢梦
张哲华
周江
许巧情
邹远超
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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