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基于生物信息学筛选阿尔茨海默病和慢性牙周炎的关键基因
1
作者
杨延延
方玲玉
+3 位作者
马雪静
刘畅
任丽莉
王鹏
《中国医科大学学报》
北大核心
2025年第11期1029-1035,共7页
目的通过生物信息学方法分析阿尔茨海默病(AD)和慢性牙周炎(CP)潜在的生物学联系。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中AD和CP的2个数据集。识别数据集的差异表达基因(DEGs),使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别最相关的模块,对共同...
目的通过生物信息学方法分析阿尔茨海默病(AD)和慢性牙周炎(CP)潜在的生物学联系。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中AD和CP的2个数据集。识别数据集的差异表达基因(DEGs),使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别最相关的模块,对共同基因进行功能富集分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用MCODE识别关键模块,并通过机器学习发现关键基因。此外,利用基因集富集分析(GSEA)和CIBERSORT算法研究KLRB1相关的分子途径和免疫细胞分布。结果本研究确定了AD和CP共有的18个基因。MCODE确定了5个关键基因,机器学习确定了AD的13个基因,CP的8个基因,最终确定KLRB1为AD和CP的共同关键基因。GSEA揭示了这些基因在疾病相关途径中的复杂作用。免疫细胞分析强调了KLRB1与γδT细胞的强相关性。结论本研究强调KLRB1是AD和CP的关键基因,并为二者的分子联系提供了新的见解。
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关键词
阿尔茨海默病
慢性牙周炎
KLRB1
生物信息学
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职称材料
β-1,3-半乳糖基转移酶2对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制
2
作者
马丰源
刁赫
+3 位作者
古岳
卢连生
范莉婕
王鹏
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第8期736-740,共5页
目的探讨β-1,3-半乳糖基转移酶2(B3galt2)对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制。方法将成年雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组(Sham组)、大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型组、MCAO模型+慢病毒载体对照...
目的探讨β-1,3-半乳糖基转移酶2(B3galt2)对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制。方法将成年雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组(Sham组)、大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型组、MCAO模型+慢病毒载体对照组(LV-GFP组)、MCAO模型+慢病毒载体过表达B3galt2组(LV-B3galt2组),每组6只。各组小鼠于脑缺血24 h后进行神经功能缺损评分和旋转棒实验,采用2,3,5-三氨基苯甲四氮唑染色测定脑梗死体积,采用尼氏染色法观察各组小鼠脑缺血半影区神经元数量,检测各组小鼠脑组织中氧化应激相关因子水平。结果与Sham组比较,MCAO模型组小鼠脑梗死体积增大,神经功能缺损明显(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显减少,活性氧(ROS)和丙二醛(MDA)水平明显升高(均P<0.05),超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽(GSH)水平明显降低(均P<0.05);与MCAO模型组比较,LV-B3galt2组小鼠脑梗死体积减小,神经功能明显改善(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显增加,ROS和MDA水平明显降低(均P<0.05),SOD和GSH水平明显升高(均P<0.05)。结论B3galt2过表达可以减轻脑缺血损伤模型小鼠脑损伤,其作用机制可能是通过抑制氧化应激反应实现的。
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关键词
β-1
3-半乳糖基转移酶2
脑缺血损伤模型小鼠
脑损伤
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职称材料
题名
基于生物信息学筛选阿尔茨海默病和慢性牙周炎的关键基因
1
作者
杨延延
方玲玉
马雪静
刘畅
任丽莉
王鹏
机构
锦州
医科
大学
基础
医学院
神经生物学教研室
锦州医科大学口腔医学院口腔修复科
出处
《中国医科大学学报》
北大核心
2025年第11期1029-1035,共7页
基金
辽宁省自然科学基金(2022-MS-391)
锦州医科大学大学生创新创业训练计划(X202410160041)。
文摘
目的通过生物信息学方法分析阿尔茨海默病(AD)和慢性牙周炎(CP)潜在的生物学联系。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中AD和CP的2个数据集。识别数据集的差异表达基因(DEGs),使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别最相关的模块,对共同基因进行功能富集分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用MCODE识别关键模块,并通过机器学习发现关键基因。此外,利用基因集富集分析(GSEA)和CIBERSORT算法研究KLRB1相关的分子途径和免疫细胞分布。结果本研究确定了AD和CP共有的18个基因。MCODE确定了5个关键基因,机器学习确定了AD的13个基因,CP的8个基因,最终确定KLRB1为AD和CP的共同关键基因。GSEA揭示了这些基因在疾病相关途径中的复杂作用。免疫细胞分析强调了KLRB1与γδT细胞的强相关性。结论本研究强调KLRB1是AD和CP的关键基因,并为二者的分子联系提供了新的见解。
关键词
阿尔茨海默病
慢性牙周炎
KLRB1
生物信息学
Keywords
Alzheimer disease
chronic periodontitis
KLRB1
bioinformatics
分类号
R246.6 [医药卫生—针灸推拿学]
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职称材料
题名
β-1,3-半乳糖基转移酶2对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制
2
作者
马丰源
刁赫
古岳
卢连生
范莉婕
王鹏
机构
锦州医科大学口腔医学院口腔修复科
锦州
医科
大学
第一附属医院放射
科
锦州
医科
大学
第一附属医院传染
科
锦州
医科
大学
基础
医学院
神经生物学教研室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024年第8期736-740,共5页
基金
国家级大学生创新创业训练计划(202210160016)
辽宁省自然科学基金(2022-MS-391)。
文摘
目的探讨β-1,3-半乳糖基转移酶2(B3galt2)对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制。方法将成年雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组(Sham组)、大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型组、MCAO模型+慢病毒载体对照组(LV-GFP组)、MCAO模型+慢病毒载体过表达B3galt2组(LV-B3galt2组),每组6只。各组小鼠于脑缺血24 h后进行神经功能缺损评分和旋转棒实验,采用2,3,5-三氨基苯甲四氮唑染色测定脑梗死体积,采用尼氏染色法观察各组小鼠脑缺血半影区神经元数量,检测各组小鼠脑组织中氧化应激相关因子水平。结果与Sham组比较,MCAO模型组小鼠脑梗死体积增大,神经功能缺损明显(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显减少,活性氧(ROS)和丙二醛(MDA)水平明显升高(均P<0.05),超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽(GSH)水平明显降低(均P<0.05);与MCAO模型组比较,LV-B3galt2组小鼠脑梗死体积减小,神经功能明显改善(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显增加,ROS和MDA水平明显降低(均P<0.05),SOD和GSH水平明显升高(均P<0.05)。结论B3galt2过表达可以减轻脑缺血损伤模型小鼠脑损伤,其作用机制可能是通过抑制氧化应激反应实现的。
关键词
β-1
3-半乳糖基转移酶2
脑缺血损伤模型小鼠
脑损伤
Keywords
β-1,3-galactosyltransferase 2
cerebral ischemic injury mice model
brain injury
分类号
R743.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学筛选阿尔茨海默病和慢性牙周炎的关键基因
杨延延
方玲玉
马雪静
刘畅
任丽莉
王鹏
《中国医科大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
β-1,3-半乳糖基转移酶2对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制
马丰源
刁赫
古岳
卢连生
范莉婕
王鹏
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2024
0
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