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贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因生物信息学预测与系统进化分析
被引量:
1
1
作者
宋兴超
孟金柱
+2 位作者
赵园园
吴震洋
安清明
《特产研究》
2023年第5期16-21,共6页
本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因的结构特性,为该基因功能探究提供理论依据。基于生物信息学及比较基因组学方法,对NCBI数据库中已登录的贵州白山羊MSTN基因完整编码区序列(CDS)核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构...
本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因的结构特性,为该基因功能探究提供理论依据。基于生物信息学及比较基因组学方法,对NCBI数据库中已登录的贵州白山羊MSTN基因完整编码区序列(CDS)核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构开展预测及分析,构建了15个物种MSTN基因系统进化树。结果表明,贵州白山羊MSTN基因CDS长度为1128bp,共编码375个氨基酸,由3个外显子和2个内含子构成,其AT含量均高于GC。贵州白山羊MSTN蛋白属混合型二级结构,存在无规则卷曲、延伸链和α-螺旋,为弱碱不稳定亲水蛋白质;包括1个18个氨基酸的潜在信号肽,无跨膜区,形成5对二硫键,含有16个磷酸化位点;278~375位氨基酸为转化生长因子-β样结构域。贵州白山羊MSTN基因与绵羊、牛等牛科动物的亲缘关系较近,与鸡形目原鸡和绿头野鸭的亲缘关系较远。本研究可为贵州白山羊MSTN基因分子遗传学及其表达调控研究奠定理论基础。
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关键词
贵州白山羊
肌肉生长抑制素基因
编码蛋白
比较基因组学
肌肉发育
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职称材料
题名
贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因生物信息学预测与系统进化分析
被引量:
1
1
作者
宋兴超
孟金柱
赵园园
吴震洋
安清明
机构
铜仁学院农林工程与规划学院、贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室
出处
《特产研究》
2023年第5期16-21,共6页
基金
铜仁市科学技术局博士人才项目(铜市科研[2020]126号)
铜仁学院博士科研启动基金项目(trxyDH2001)
+1 种基金
铜仁市科学技术局博士人才项目(铜市科研[2023]4号)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2020]1Y138)。
文摘
本研究旨在解析贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因的结构特性,为该基因功能探究提供理论依据。基于生物信息学及比较基因组学方法,对NCBI数据库中已登录的贵州白山羊MSTN基因完整编码区序列(CDS)核苷酸组成特性及编码蛋白的相关结构开展预测及分析,构建了15个物种MSTN基因系统进化树。结果表明,贵州白山羊MSTN基因CDS长度为1128bp,共编码375个氨基酸,由3个外显子和2个内含子构成,其AT含量均高于GC。贵州白山羊MSTN蛋白属混合型二级结构,存在无规则卷曲、延伸链和α-螺旋,为弱碱不稳定亲水蛋白质;包括1个18个氨基酸的潜在信号肽,无跨膜区,形成5对二硫键,含有16个磷酸化位点;278~375位氨基酸为转化生长因子-β样结构域。贵州白山羊MSTN基因与绵羊、牛等牛科动物的亲缘关系较近,与鸡形目原鸡和绿头野鸭的亲缘关系较远。本研究可为贵州白山羊MSTN基因分子遗传学及其表达调控研究奠定理论基础。
关键词
贵州白山羊
肌肉生长抑制素基因
编码蛋白
比较基因组学
肌肉发育
Keywords
Guizhou white goat
MSTN gene
encoding protein
comparative genomics
muscle development
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
Q754 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州白山羊肌肉生长抑制素(MSTN)基因生物信息学预测与系统进化分析
宋兴超
孟金柱
赵园园
吴震洋
安清明
《特产研究》
2023
1
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