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题名大熊猫主食竹叶围微生物抗生素抗性基因
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作者
李健威
崔鑫月
蒋清松
袁施彬
洪明生
侯怡薇
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机构
栗子坪大熊猫生态与保护四川省野外科学观测研究站
四川栗子坪国家级自然保护区管理局
西华师范大学生命科学学院
野生动物营养生态与疾病防控南充市重点实验室
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出处
《四川林业科技》
2024年第4期38-44,共7页
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基金
2022年国家重点生态功能区转移支付禁止开发区补助资金项目
国家自然科学基金(31900337)
西华师范大学科研创新团队项目(KCXTD2022-7)。
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文摘
抗菌药物在为人类服务的同时,使其他生物体产生新的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs),严重危害人类和动物的健康。ARGs分布范围广泛,草食性动物主要通过采食而接触存在ARGs的植物微生物。大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)在进化过程中食性特化成以竹子为主食。研究在四川栗子坪国家级自然保护区展开,着眼于大熊猫主食竹叶围微生物,采用宏基因组测序,探讨大熊猫食物资源微生物ARGs的组成和多样性。分析发现大熊猫主食竹叶围细菌ARGs在Class水平上有抗四环素类(Tetracycline)、抗大环内酯-林可酰胺-链霉素类(MLS)、抗糖肽类(Glycopeptide)、抗多肽类(Peptide)等。峨热竹(Arundinaria spanostachya)叶围细菌ARGs的Sobs指数显著大于丰实箭竹(Fargesia ferax);而Shannon指数在三种大熊猫主食竹间没有显著差异。通过NMDS分析发现三种大熊猫主食竹间叶围细菌ARGs组成结构间具有明显差异。经过LEfSe寻找区别三种大熊猫主食竹细菌ARGs的重要种类,峨热竹中Glycopeptide、Phenicol和Bicyclomycin有最大作用;丰实箭竹中Aminocoumarin和Pleuromutilin有最大作用。Glycopeptide和Phenicol主要由Pseudomonas、Sphingomonas携带,而Aminocoumarin和Pleuromutilin主要由Sphingomonas、Lichenibacterium携带等。研究提示了大熊猫采食的竹叶叶围微生物含有丰富的ARGs,在日常监测中需重点监测携带区分三种大熊猫主食竹叶围细菌ARGs的细菌类群(如假单胞菌属、鞘脂单胞菌属等);此外,还需关注其他环境(土壤、溪流、乔木等)微生物ARGs的状况,以期全面了解环境微生物及其携带的ARGs对大熊猫的潜在影响。
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关键词
大熊猫
四川栗子坪国家级自然保护区
大熊猫主食竹
峨热竹
ARGs
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Keywords
giant panda
Sichuan Liziping National Nature Reserve
giant panda’s staple food bamboo
Arundinaria spanostachya
ARGs
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分类号
S865.3
[农业科学—野生动物驯养]
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