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HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
被引量：
1
1
作者
梁立
刘嵬
+2 位作者
何红秋
苟小军
胡建平
《湖北农业科学》
2015年第13期3283-3288,3293,共7页
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular ...
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟优化了模建复合物,分子整体结构发生微幅调整,其中活性口袋区关键残基D116-Mg1-Mg2-E152有一定关联柔性摆动,这对于IN结合柔性较大的RLV分子较为有利。运动性分析表明,RLV分子围绕中心羟基嘧啶,两侧恶二唑和氟苯略微靠近。通过与晶体结构及对接结果对比发现,D116和N155可能是识别RLV抑制剂最为关键的两个残基。
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关键词
HIV-1整合酶
雷特格韦
同源模建
结构优化
分子动力学模拟
运动模式
分子识别
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职称材料
一种基于量子点检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法
被引量：
4
2
作者
郭利宁
何红秋
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期389-395,共7页
抗环瓜氨酸多肽(cyclic citrullinated peptide,CCP)抗体是类风湿关节炎(rheumatoidarthritis,RA)早期诊断的重要生物标志物.为了实现对RA的早期诊断,本研究建立了一种基于CdTe量子点标记技术检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法.将CCP多肽...
抗环瓜氨酸多肽(cyclic citrullinated peptide,CCP)抗体是类风湿关节炎(rheumatoidarthritis,RA)早期诊断的重要生物标志物.为了实现对RA的早期诊断,本研究建立了一种基于CdTe量子点标记技术检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法.将CCP多肽与小牛血清白蛋白(bovineserum albumin,BSA)连接,再将CCP-BSA和羊抗鼠IgG分别在硝酸纤维素膜(nitrocellulosemembrane,NC膜)上划线,作为检测线(test line,T线)和质控线(control line,C线).制备量子点并在量子点上标记鼠抗人IgG,喷在玻璃纤维上并烘干,最后组装大卡、切割并封装制成检测试纸条.应用该试纸条检测了RA患者及健康人血清临床样本200份,以酶联免疫吸附测定法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)为对照,计算免疫荧光层析法的检测灵敏度和特异性.结果显示,建立的量子点免疫荧光层析试纸条检测抗CCP抗体的灵敏度为97.5%,特异性为95.8%.该方法操作简单、快速,可实现床旁检测(point-of-care testing,POCT),能应用于RA的早期诊断.
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关键词
量子点
免疫层析法
类风湿关节炎
抗环瓜氨酸多肽抗体
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职称材料
题名
HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
被引量：
1
1
作者
梁立
刘嵬
何红秋
苟小军
胡建平
机构
成都大学药食同源植物资源开发重点实验室
重庆市科学技术研究院重庆生物医药与器械研究中心
乐山师范学院化学学院
出处
《湖北农业科学》
2015年第13期3283-3288,3293,共7页
基金
国家自然科学基金项目(11247018
11147175
+3 种基金
81202438)
四川省科技厅应用基础项目(2011JYZ007)
四川省教育厅重点项目(12ZA066)
乐山市科技计划项目(14GZD022)
文摘
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟优化了模建复合物,分子整体结构发生微幅调整,其中活性口袋区关键残基D116-Mg1-Mg2-E152有一定关联柔性摆动,这对于IN结合柔性较大的RLV分子较为有利。运动性分析表明,RLV分子围绕中心羟基嘧啶,两侧恶二唑和氟苯略微靠近。通过与晶体结构及对接结果对比发现,D116和N155可能是识别RLV抑制剂最为关键的两个残基。
关键词
HIV-1整合酶
雷特格韦
同源模建
结构优化
分子动力学模拟
运动模式
分子识别
Keywords
HIV-lintegrase
rahegravir
homology modeling
structure refine
molecular dynamics simulation
motion mode
molecular recognition
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
一种基于量子点检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法
被引量：
4
2
作者
郭利宁
何红秋
机构
重庆市科学技术研究院重庆生物医药与器械研究中心
上海凯赛
生物
技术
研发
中心
有限公司
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期389-395,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.81202438)资助~~
文摘
抗环瓜氨酸多肽(cyclic citrullinated peptide,CCP)抗体是类风湿关节炎(rheumatoidarthritis,RA)早期诊断的重要生物标志物.为了实现对RA的早期诊断,本研究建立了一种基于CdTe量子点标记技术检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法.将CCP多肽与小牛血清白蛋白(bovineserum albumin,BSA)连接,再将CCP-BSA和羊抗鼠IgG分别在硝酸纤维素膜(nitrocellulosemembrane,NC膜)上划线,作为检测线(test line,T线)和质控线(control line,C线).制备量子点并在量子点上标记鼠抗人IgG,喷在玻璃纤维上并烘干,最后组装大卡、切割并封装制成检测试纸条.应用该试纸条检测了RA患者及健康人血清临床样本200份,以酶联免疫吸附测定法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)为对照,计算免疫荧光层析法的检测灵敏度和特异性.结果显示,建立的量子点免疫荧光层析试纸条检测抗CCP抗体的灵敏度为97.5%,特异性为95.8%.该方法操作简单、快速,可实现床旁检测(point-of-care testing,POCT),能应用于RA的早期诊断.
关键词
量子点
免疫层析法
类风湿关节炎
抗环瓜氨酸多肽抗体
Keywords
citrullinatedquantum dots
immunoehromatographicpeptide （CCP） antibodiestest strip
rheumatoid arthritis
anti-cyclic
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
梁立
刘嵬
何红秋
苟小军
胡建平
《湖北农业科学》
2015
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一种基于量子点检测抗CCP抗体的免疫荧光层析法
郭利宁
何红秋
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
在线阅读
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职称材料
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引证文献
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