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LncRNA XLOC015132对山羊黑色素沉积的影响及其lncRNA-miRNA-mRNA轴的预测
1
作者 付琳 刘丽 +5 位作者 杨恒 王高富 任航行 周鹏 董贤文 张丽 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1329-1338,共10页
LncRNA在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的miRNA和靶基因促进黑色素瘤的侵袭和转移。为探究LncRNA XLOC_015132的组织表达谱及其与黑色素沉积之间的关系,以酉州乌羊和酉州本地白山羊为试验对象,检测LncRNA XLOC_015132在各... LncRNA在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的miRNA和靶基因促进黑色素瘤的侵袭和转移。为探究LncRNA XLOC_015132的组织表达谱及其与黑色素沉积之间的关系,以酉州乌羊和酉州本地白山羊为试验对象,检测LncRNA XLOC_015132在各组织中以及黑色素瘤细胞中的表达情况;同时,通过靶miRNA和靶基因预测,构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。qRT-PCR结果显示,LncRNA XLOC_015132在酉州乌羊脾脏、肺、肾脏、大脑、皮肤等组织中的表达量显著高于本地白山羊(P<0.05);LncRNA XLOC_015132在B16-F10黑色素瘤细胞中的定量分析结果显示,随着B16-F10细胞的增殖,LncRNA XLOC_015132表达量呈递增趋势;LncRNA XLOC_015132与互作分子的生物信息学分析结果显示,LncRNA XLOC_015132/miR-150-5p/CCND2轴可能通过激活PI3K-AKT、Wnt等信号通路,在黑色素沉积中发挥重要作用。综合上述结果,LncRNA XLOC_015132的表达与黑色素沉积可能存在正相关关系。本研究结果为深入探究山羊皮肤黑色素沉积的lncRNA调控理论研究提供了基础。 展开更多
关键词 长链非编码RNA(LncRNA) 黑色素沉积 组织表达 lncRNA-miRNA-mRNA轴
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成年酉州乌羊体尺长与体质量的关系 被引量：9
2
作者 王高富 刘良佳 +5 位作者 任航行 蒋婧 余琴 黎年富 夏元友 周鹏 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第21期165-168,共4页
为研究成年酉州乌羊体尺长与体质量的关系,测定16只酉州乌羊成年公羊和74只成年母羊的体斜长、体高、胸围、管围和体质量等指标,运用SPSS软件分别分析公母羊体尺长与体质量间的相关系数、体尺长对体质量的直接和间接影响以及对体质量的... 为研究成年酉州乌羊体尺长与体质量的关系,测定16只酉州乌羊成年公羊和74只成年母羊的体斜长、体高、胸围、管围和体质量等指标,运用SPSS软件分别分析公母羊体尺长与体质量间的相关系数、体尺长对体质量的直接和间接影响以及对体质量的决策程度,分别建立公羊和母羊体尺长与体质量的最优回归模型。结果表明,胸围和体斜长是酉州乌羊母羊体质量的最主要决策变量,胸围是公羊体质量的最主要决策变量。母羊和公羊体尺对体质量的最优回归模型分别是Y=-37.569+0.262X1+0.702X3,Y=-44.157+1.035X3,其中X1表示体斜长,X3表示胸围。 展开更多
关键词 酉州乌羊 体斜长 胸围 体质量 回归分析
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酉州乌羊MC1R基因的克隆鉴定、生物信息学及多态性分析 被引量：5
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作者 付琳 任航行 +5 位作者 王高富 周鹏 张丽 李杰 董贤文 蒋婧 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期31-40,共10页
MC1R是影响皮肤色素沉着中黑皮素系统的重要基因,通过信号分子的相互作用影响黑色素的生成。为探究酉州乌羊MC1R的生物学特性,本研究对酉州乌羊MC1R进行了分离鉴定、生物信息学分析。结果表明,酉州乌羊皮肤组织MC1R基因的CDS序列为954 ... MC1R是影响皮肤色素沉着中黑皮素系统的重要基因,通过信号分子的相互作用影响黑色素的生成。为探究酉州乌羊MC1R的生物学特性,本研究对酉州乌羊MC1R进行了分离鉴定、生物信息学分析。结果表明,酉州乌羊皮肤组织MC1R基因的CDS序列为954 bp,共编码317个氨基酸,酉州乌羊与各物种MC1R具有较高同源性。酉州乌羊MC1R编码蛋白的分子式是C_(1603)H_(2565)N_(411)O_(410)S_(22),其为疏水蛋白,有7个α-螺旋组成的跨膜结构域和3个保守功能结构域,MC1R氨基酸序列大部分都用于构成α-螺旋。此外,酉州乌羊MC1R基因c.676A>G突变,其编码的氨基酸由赖氨酸转变为谷氨酸,位于受光刺激和G蛋白配体结合的保守结构域上,氨基酸的异义替换还造成了酉州乌羊MC1R空间构象的差异。而对重庆市山羊群体多态性检测发现,山羊MC1R基因c.676A>G变异位点在重庆合川白山羊、巫溪白山羊、本地白山羊、酉州乌羊中共享,且c.676A>G位点的各基因型在皮肤白色和乌色山羊群体中的分布差异不显著(P>0.05)。本研究初步揭示酉州乌羊MC1R的序列特征和蛋白结构,为酉州乌羊MC1R影响皮肤色素沉积的分子机制研究提供了理论数据。 展开更多
关键词 MC1R基因 克隆 酉州乌羊 遗传多态性分析
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