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Ⅰ型蓝舌病毒NS4基因的克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
赵瑶
徐栋
+7 位作者
马三立
马鲜平
王芝英
张德志
李前勇
谢成华
杨发辉
易华山
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期77-86,共10页
为研究蓝舌病毒NS4基因分子特征,本研究从重庆分离的蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)感染细胞提取总RNA,采用RT-PCR方法对蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)NS4基因进行克隆与序列分析.结果表明:所获得的NS4基因ORF长234 bp,编码77个氨基酸.通过DN...
为研究蓝舌病毒NS4基因分子特征,本研究从重庆分离的蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)感染细胞提取总RNA,采用RT-PCR方法对蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)NS4基因进行克隆与序列分析.结果表明:所获得的NS4基因ORF长234 bp,编码77个氨基酸.通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的NS4基因与BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-4/Italy/2003,BTV-4/Israel/2010,BTV-8/Israel/2010/03,BTV-1/France/2007/18,BTV-1/France/2008/24,BTV-1/Algeria/2006/01,BTV-2/Sudan/1983/05,BTV-14/Cameroon/1982/04株相似性为100%,与BTV-2/South Africa/RSA vaccine strain,BTV-9/South Africa/RSA vaccine strain株及BTV-1/Libya/2007,BTV-2/Italy/2000等25株参考毒株的相似性为98.7%,而与BTV-1/Australia/2003/01和BTV-16/Indonesia/1998相似性最低,为90.8%;突变主要发生在5~6位、17~18位、35~36位、39~40位、53~54位、65位及73~74位.系统进化分析表明:BTV-1/China/2017株NS4基因与欧洲源BTV-4/Italy/2003,BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-2/France/2001,BTV-15/Israel/2006,BTV-4/Israel/2010,BTV-1/France/2008/24,BTV-4/Spain/2005株聚为一类,同BTV-4/Italy/2003株亲源关系最近.通过在线软件预测发现NS4蛋白存在2个α-螺旋区,无跨膜区,具有亮氨酸拉链(bZIP)典型结构;存在典型的核定位信号并具有线粒体亚细胞定位特征.
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关键词
蓝舌病毒
NS4基因
序列分析
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职称材料
题名
Ⅰ型蓝舌病毒NS4基因的克隆及序列分析
被引量：
4
1
作者
赵瑶
徐栋
马三立
马鲜平
王芝英
张德志
李前勇
谢成华
杨发辉
易华山
机构
西南大学动物医学院
重庆市
兽医科学工程研究
中心
重庆市城口县职业教育中心
重庆市
荣昌区农业技术推广站
出处
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期77-86,共10页
基金
中央高校基本科研业务专项基金项目(XDJK2018C059,XDJK2018C060)
重庆市基础研究与前沿探索专项基金项目(cstc2018jcyjAX0615).
文摘
为研究蓝舌病毒NS4基因分子特征,本研究从重庆分离的蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)感染细胞提取总RNA,采用RT-PCR方法对蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)NS4基因进行克隆与序列分析.结果表明:所获得的NS4基因ORF长234 bp,编码77个氨基酸.通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的NS4基因与BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-4/Italy/2003,BTV-4/Israel/2010,BTV-8/Israel/2010/03,BTV-1/France/2007/18,BTV-1/France/2008/24,BTV-1/Algeria/2006/01,BTV-2/Sudan/1983/05,BTV-14/Cameroon/1982/04株相似性为100%,与BTV-2/South Africa/RSA vaccine strain,BTV-9/South Africa/RSA vaccine strain株及BTV-1/Libya/2007,BTV-2/Italy/2000等25株参考毒株的相似性为98.7%,而与BTV-1/Australia/2003/01和BTV-16/Indonesia/1998相似性最低,为90.8%;突变主要发生在5~6位、17~18位、35~36位、39~40位、53~54位、65位及73~74位.系统进化分析表明:BTV-1/China/2017株NS4基因与欧洲源BTV-4/Italy/2003,BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-2/France/2001,BTV-15/Israel/2006,BTV-4/Israel/2010,BTV-1/France/2008/24,BTV-4/Spain/2005株聚为一类,同BTV-4/Italy/2003株亲源关系最近.通过在线软件预测发现NS4蛋白存在2个α-螺旋区,无跨膜区,具有亮氨酸拉链(bZIP)典型结构;存在典型的核定位信号并具有线粒体亚细胞定位特征.
关键词
蓝舌病毒
NS4基因
序列分析
Keywords
bluetongue virus
NS4 gene
sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Ⅰ型蓝舌病毒NS4基因的克隆及序列分析
赵瑶
徐栋
马三立
马鲜平
王芝英
张德志
李前勇
谢成华
杨发辉
易华山
《西南大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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