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保种场涪陵水牛及西南地区水牛品种间遗传结构与ROH分析 被引量:1
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作者 屠芸 曾雅楠 +8 位作者 张蒸豪 洪瑞 王震 吴平 周泽洋 叶艺茹 杜亚楠 左福元 张龚炜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1989-1998,共10页
旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地... 旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地区沼泽型水牛和7头河流型水牛的基因组重测序数据,基于所有的基因组数据获得的高质量单核苷酸多态性(SNPs)位点进行遗传结构、ROH以及近交系数的分析。全基因组重测序结果显示,涪陵水牛平均测序深度为10×,质量控制后共鉴定出14 326 437个SNPs。群体遗传结构分析显示,保种场内涪陵水牛与毗邻区域的宜宾水牛、贵州水牛、贵州白水牛、盐津水牛间具有明显的遗传结构差异,德宏水牛和滇东南水牛与上述5个品种区别均明显;当分群数量为K=6时,涪陵水牛可划分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构。涪陵水牛、宜宾水牛、贵州水牛这3个品种间共检测到2 722个ROHs,其中涪陵水牛检测到1 593个ROHs,且1~2 Mb的短ROH片段占比达78.15%;仅在涪陵水牛群体中检测到8个大于16 Mb的长ROH片段,最长为24.56 Mb。基于ROH计算的保种场涪陵水牛平均近交系数为0.056 8,其中7头个体近交系数较高(0.062 5~0.125 0);贵州水牛和宜宾水牛的平均近交系数分别为0.034 6和0.041 0。综上,涪陵水牛保种群可分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构;保种场内7头涪陵水牛个体存在近交风险,迫切需要加强涪陵水牛的资源保护与利用工作。 展开更多
关键词 涪陵水牛 群体遗传结构 SNP ROH 近交系数
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中华鳖卵黄蛋白原基因克隆与表达及外源E2的影响
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作者 姚苗 韦智梅 +6 位作者 BIZOZA 周针宇 李虹 王波 熊银林 刁晓明 翟旭亮 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2024年第4期102-112,共11页
为探究中华鳖(Pelodiscus sinensis)卵黄蛋白原Vtg基因的生物学信息与表达及其作为生理与毒理研究标志物的可行性,本实验克隆获得VtgAB1、VtgAB2、VtgAB3(GenBank登录号OK287927、OK287929、OK287928)基因序列,其cDNA长分别为5055、5537... 为探究中华鳖(Pelodiscus sinensis)卵黄蛋白原Vtg基因的生物学信息与表达及其作为生理与毒理研究标志物的可行性,本实验克隆获得VtgAB1、VtgAB2、VtgAB3(GenBank登录号OK287927、OK287929、OK287928)基因序列,其cDNA长分别为5055、5537、5306 bp,分别编码了1684、1760、1725个氨基酸。三种亚型Vtg蛋白均由脂蛋白N-末端(Vitellogenin_N)、1943DUF、1944DUF、PV、D型血管血友病因子(VWD)5个保守结构域构成,为完整型Vtg。同源性分析发现皆与龟鳖目具有更近的亲缘关系,同时在3种亚型中VtgAB2与VtgAB3更相似。荧光定量PCR显示,3种亚型Vtg只在雌性肝脏中强烈表达。在60日龄、2龄、4龄雌性个体肝脏中,Vtg表达量随年龄呈上升趋势,VtgAB1、VtgAB2为主要表达亚型。原位杂交结果显示,3种亚型Vtg在卵原细胞内未发现杂交信号;在生长期卵母细胞胞质和滤泡细胞中发现杂交信号;成熟期卵母细胞胞质中未发现杂交信号,在滤泡细胞和周围的网状组织中发现杂交信号。信号在初级卵母细胞的细胞质中分布较为均匀且表达最强,随着卵母细胞的发育信号聚集在核周区且信号逐渐减弱。以雄性中华鳖为对象,注射雌激素E2,3种亚型Vtg表达量表现出明显的时间和剂量相关性。研究结果表明,在中华鳖卵黄积累过程中Vtg发挥重要作用,首次证实其Vtg存在内源性合成,并发现其可以作为雌激素暴露的生物标志物。 展开更多
关键词 中华鳖(Pelodiscus sinensis) 卵黄蛋白原基因 克隆与表达 外源E2
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华南虎源产碱普罗威登斯菌的分离鉴定及致病性研究
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作者 李雨琪 朱智豪 +16 位作者 郑欣 许癸宗 蔡思思 周娴静 靳雨欣 刘璐 许静茹 陈芳婷 薛梦如 康娅莉 薛羽希 陈腾腾 林锡潘 林开雄 谭聪灵 张敏 范克伟 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1320-1328,共9页
【目的】分离鉴定导致华南虎急性死亡的病原菌,确定其致病性及药物敏感性,为今后该病的防控提供科学依据。【方法】利用形态学、分子生物学确定分离菌株种类,并对其进行小鼠致病性试验、药敏试验。【结果】从死亡华南虎幼虎肠道中分离到... 【目的】分离鉴定导致华南虎急性死亡的病原菌,确定其致病性及药物敏感性,为今后该病的防控提供科学依据。【方法】利用形态学、分子生物学确定分离菌株种类,并对其进行小鼠致病性试验、药敏试验。【结果】从死亡华南虎幼虎肠道中分离到1株细菌。分离菌在鲜血琼脂平板上呈现灰白色菌落,在麦康凯平板上呈现白色菌落;镜检为革兰阴性杆菌,命名为FJ/Tiger201802。结合16S rRNA测序结果,确定其为产碱普罗威登斯菌。遗传进化分析显示,FJ/Tiger201802与鱼源分离株HXM38(MZ734428.1)位于同一进化分支,亲缘关系较近,16S rRNA基因核苷酸相似性为99.5%。分离菌株接种试验小鼠,发病小鼠出现精神萎靡、被毛松乱、扎堆、眼角出现分泌物等症状,分离菌株对小鼠的半数致死量(LD50)为1×108.2CFU,病理剖检及病理组织学结果表明,FJ/Tiger201802的致病性较强,主要侵害小鼠的肝脏、肺脏、肠等组织器官。药敏试验结果表明,氨苄西林、氨曲南、头孢呋辛、头孢哌酮、头孢曲松、头孢吡肟、头孢他啶、头孢西叮、氧氟沙星、链霉素、妥布霉素和庆大霉素对分离菌株具有较强的体外生长抑制作用,对头孢唑林、头孢噻吩不敏感。【结论】本研究分离到1株华南虎源产碱普罗威登斯菌,可引起小鼠感染发病。研究结果可为产碱普罗威登斯菌病的临床诊断和治疗提供参考依据。 展开更多
关键词 华南虎 产碱普罗威登斯菌 分离鉴定 致病性
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2024年莫桑比克口蹄疫血清学调查与分析
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作者 韩俊伟 李熙 +1 位作者 肖仁荣 杜海燕 《中国动物保健》 2025年第4期23-24,共2页
为全面掌握莫桑比克2024年动物口蹄疫发生流行情况,本研究综合运用口蹄疫3ABC抗体快速检测、口蹄疫3ABC抗体阻断ELISA、抗原检测和血清分型ELISA 3种检测法,分别对834份血清样品和10份水泡液进行检测和血清分型。结果显示:检出口蹄疫阳... 为全面掌握莫桑比克2024年动物口蹄疫发生流行情况,本研究综合运用口蹄疫3ABC抗体快速检测、口蹄疫3ABC抗体阻断ELISA、抗原检测和血清分型ELISA 3种检测法,分别对834份血清样品和10份水泡液进行检测和血清分型。结果显示:检出口蹄疫阳性样品17份,阳性率为2.04%;阳性血清全部出自南部区域,感染动物均为牛,口蹄疫血清型为南非I型(SAT 1型)。通过对试验结果、发病原因和防控体系等环节深入分析,为该国口蹄疫科学防控提供重要参考。 展开更多
关键词 莫桑比克 口蹄疫 血清学调查
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