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CRISPR/Cas13a在肺结核诊断中的效能研究
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作者 聂晓平 韩梅 +4 位作者 杨松 王乐乐 李同心 黄正谷 高雯琬 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第S02期35-37,共3页
目的:分析评价CRISPR/Cas13a对肺结核的检测诊断价值。方法:收集重庆市公共卫生医疗救治中心2023年2月至2023年5月收治住院的45例经病原学确诊(分枝杆菌培养阳性)的肺结核患者痰液标本作为结核病组,并收集同期收治入院的23例非结核病患... 目的:分析评价CRISPR/Cas13a对肺结核的检测诊断价值。方法:收集重庆市公共卫生医疗救治中心2023年2月至2023年5月收治住院的45例经病原学确诊(分枝杆菌培养阳性)的肺结核患者痰液标本作为结核病组,并收集同期收治入院的23例非结核病患者(包括社区获得性肺炎、慢性支气管炎、单纯疱疹病毒感染、细菌性肺炎、支气管扩张、慢性阻塞性肺疾病)痰液标本作为非结核病组。所有患者的标本均进行CRISPR-Cas13a检测,且至少进行一项分子检测:结核分枝杆菌复合群核酸扩增检测或Gene Xpert MTB/RIF检测。结果:以分枝杆菌培养结果作为参考,在结核病组中TB-DNA/Xpert检测方法检出阳性标本有42例,CRISPR/Cas13a检出阳性标本有43例;在非结核病组中TB-DNA/Xpert方法检出阳性1例,CRISPR/Cas13a检出均为阴性,差异均无统计学意义(P=1.0)。CRISPR/Cas13a检测肺结核的敏感度为95.6%,特异度为100%,阳性预测值为100%,阴性预测值为92.0%,Kappa值为0.94。结论:与传统的分子生物学方法相比,CRISPR/Cas13a在检测肺结核方面具有较高的敏感度和特异度,在实现对肺结核快速、高效检测具有巨大的潜力。 展开更多
关键词 肺结核 Gene Xpert MTB/RIF CRISPR/Cas13a
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结核性脑膜炎诊断方法研究进展 被引量:3
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作者 王乐乐 郭建琼 +1 位作者 杨松 唐神结 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第7期735-740,共6页
结核性脑膜炎(tuberculous meningitis,TBM)是最常见的中枢神经系统结核病类型,也是最严重的肺外结核,常以非特异性症状起病。目前,所有的TBM诊断技术均不完美,虽患者脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)指标变化明显,但不具有特异性;加之... 结核性脑膜炎(tuberculous meningitis,TBM)是最常见的中枢神经系统结核病类型,也是最严重的肺外结核,常以非特异性症状起病。目前,所有的TBM诊断技术均不完美,虽患者脑脊液(cerebrospinal fluid,CSF)指标变化明显,但不具有特异性;加之CSF中的细菌载量非常低,相关实验室检测技术诊断敏感度低、耗时长。笔者通过总结目前TBM诊断中存在的问题,对TBM的不同诊断方法的最新研究进展和利弊进行综述,为进一步提高TBM患者确诊率,避免患者治疗时机的延误提供参考。 展开更多
关键词 结核 脑膜 病原学诊断 诊断显像 综述文献(主题)
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采用宏基因组学分析肺结核患者与健康人群呼吸道微生物菌群的特征 被引量:6
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作者 邱倩 刘东鑫 +3 位作者 刘春法 邱捷 严晓峰 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第10期1100-1108,共9页
目的明确肺结核患者和健康人群的呼吸道微生物菌群组成的变化情况。方法时间限定为2010年1月至2019年12月,在英文数据库(PubMed、Embase and Ovid、Web of Science、Google Scholar、Cochrane Library)和中文数据库(中国知网、万方、中... 目的明确肺结核患者和健康人群的呼吸道微生物菌群组成的变化情况。方法时间限定为2010年1月至2019年12月,在英文数据库(PubMed、Embase and Ovid、Web of Science、Google Scholar、Cochrane Library)和中文数据库(中国知网、万方、中国生物医学文献服务系统与维普)检索所有包含结核和呼吸道菌群的文献,按照文献检索流程筛选文献并最终纳入。收集所有可用的下一代测序数据,统一处理参数,进行数据预处理和系统的宏基因组学分析及统计学处理。结果共纳入9篇英文文献。物种分析结果提示肺结核组和健康对照组在门水平相对丰度排在前10位的共有菌群有:厚壁菌门、OD1菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、梭杆菌门、蓝菌门。但两组呼吸道菌群群落结构组成差异有统计学意义,α多样性分析显示,肺结核组观测到的可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)数目(286.60±22.82)、Faith谱系多样性(phylogenetic diversity,PD)指数(Faith PD指数)(13.57±2.58)、Shannon指数(7.17±0.24)明显高于健康对照组(分别为42.88±2.49、6.52±0.22、4.42±0.07),差异均具有统计学意义(P值分别为0.00016、0.00056、0.00016)。肺结核组Chaol指数高于健康对照组(266.50±92.71和38.44±2.86),但差异无统计学意义(P>0.05)。门水平上两组丰度有差异的物种有6种,其中5种在健康对照组聚集,为厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门、梭杆菌门、变形菌门,另有OD1门在肺结核组聚集。F16科、丙型变形菌纲、梭杆菌门梭杆菌目、厚壁菌门下的明串珠菌科和芽孢杆菌科是肺结核特有的菌群种类。结论肺结核患者与健康人群比较,呼吸道菌群的多样性及物种组成均发生了较大变化,并具有特有的菌群种类。 展开更多
关键词 结核 呼吸道黏膜 微生物学 宏基因组 数据说明 统计
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治疗性药物监测在结核病治疗中的应用进展 被引量:6
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作者 王乐乐 杨松 唐神结 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第3期285-290,共6页
治疗性药物监测(therapeutic drug monitoring,TDM)是应用血液、尿液或唾液中的药品浓度确定药品剂量,为患者制定治疗方案,以获得最佳疗效,减少耐药及不良反应的检测技术。TDM是个体化治疗的重要策略,可为临床调整药品剂量提供参考。结... 治疗性药物监测(therapeutic drug monitoring,TDM)是应用血液、尿液或唾液中的药品浓度确定药品剂量,为患者制定治疗方案,以获得最佳疗效,减少耐药及不良反应的检测技术。TDM是个体化治疗的重要策略,可为临床调整药品剂量提供参考。结核病患者血药浓度个体差异大、不良反应多,常导致治疗失败、复发和耐药。目前在结核病治疗中TDM尚未实现标准化,也无任何官方指南。但最近国外的指南推荐对有药品暴露改变风险或预后不良的结核病患者,在治疗期间应行TDM。因此,作者分别就TDM的定义及临床意义、检测技术方法、抗结核药品治疗应用情况作一综述,为临床医师提供参考。 展开更多
关键词 药品监测 结核 血药浓度
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中国耐多药结核病发病危险因素的Meta分析 被引量:13
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作者 许金红 杨松 +2 位作者 张立新 钟颖 邱倩 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第12期1301-1309,共9页
目的系统评价中国发生耐多药结核病(MDR-TB)的主要危险因素并进行分析,为我国提供有效预防MDR-TB的措施,达到病因预防(一级预防)的目的.方法时间限定为2005年1月至2019年5月,在英文数据库(PubMed、Embase、Web of Science、Cochrane Lib... 目的系统评价中国发生耐多药结核病(MDR-TB)的主要危险因素并进行分析,为我国提供有效预防MDR-TB的措施,达到病因预防(一级预防)的目的.方法时间限定为2005年1月至2019年5月,在英文数据库(PubMed、Embase、Web of Science、Cochrane Library)和中文数据库(中国知网、万方、中国生物医学文献服务系统与维普)检索中国耐多药结核病发病危险因素的相关论文,经过对论文的筛选、提取资料和质量评价后进行Meta分析.结果根据检索结果、入选及排除标准,共纳入55篇论文,通过Meta分析,发现MDR-TB相关的危险因素有9种.结果显示外省户籍人口(OR=1.92;95%CI=1.48~2.51)、家庭收入低下(OR=2.12;95%CI=1.72~2.63)、患者分类为复治患者(OR=6.28;95%CI=4.72~8.36)、既往有抗结核药物治疗史(OR=5.73;95%CI=4.56~7.20)、既往抗结核药物治疗史次数≥2次(OR=4.41;95%CI=3.35~5.80)、药物不良反应(OR=4.89;95%CI=2.48~9.62)、中断治疗(OR=3.59;95%CI=2.02~6.38)、肺部空洞(OR=1.56;95%CI=1.25~1.93)和吸烟(OR=1.59;95%CI=1.12~2.25)与MDRTB的发病密切相关.结论中国MDR TB的发病危险因素可能为外地人口、家庭收入低下、复治患者、既往抗结核治疗史、既往抗结核治疗史次数≥2次、药物不良反应、中断治疗、肺部空洞和吸烟史. 展开更多
关键词 中国 结核 抗多种药物性 危险因素 Meta分析(主题)
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硫异维甲类化合物A2对结核分枝杆菌抗菌效果的观察
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作者 邱倩 杨松 +2 位作者 陈勇 徐小明 杨再兴 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第11期1155-1159,共5页
目的评价硫异维甲类化合物(SHetA2)在体内外对结核分枝杆菌(MTB)的抗菌效果。方法(1)采用试管法,将SHetA2(2.5μg/ml、5.0μg/ml、10.0μg/ml、20.0μg/ml)分别加入苏通培养基内后,加入等量MTB标准菌株H37RV菌液[1mg/ml,每支接种0.1ml,... 目的评价硫异维甲类化合物(SHetA2)在体内外对结核分枝杆菌(MTB)的抗菌效果。方法(1)采用试管法,将SHetA2(2.5μg/ml、5.0μg/ml、10.0μg/ml、20.0μg/ml)分别加入苏通培养基内后,加入等量MTB标准菌株H37RV菌液[1mg/ml,每支接种0.1ml,含106菌落形成单位(CFU)细菌],于37℃培养2周,测定SHetA2的最小抑菌浓度(MIC)。(2)将76只无特定病原体(SPF)级昆明小鼠采用雾化吸入感染装置构建肺结核感染模型,最终纳入60只建模成功的小鼠。采用数字表法随机将小鼠分为对照组、异烟肼组、SHetA2组,每组20只,分别采用生理盐水、异烟肼、SHetA2进行治疗。治疗45d后,观察各组小鼠体征及体质量变化、肺组织细菌载荷量计数及组织病理学变化。结果(1)体外实验结果显示,SHetA2对MTB标准菌株H37RV的MIC为10μg/ml。(2)体内抗结核实验显示,治疗45d后,对照组小鼠体质量为(27.21±2.85)g,明显低于异烟肼组[(37.98±3.09)g]和SHetA2组[(38.28±3.43)g],差异有统计学意义(F=4.05,P=0.023);异烟肼组与SHetA2组比较,小鼠体质量差异无统计学意义(q=0.10,P=0.998);对照组小鼠肺组织重度病变的构成比(80.0%,16/20)明显高于异烟肼组(15.0%,3/20)和SHetA2组(10.0%,2/20),差异有统计学意义(χ^2=32.18,P<0.01);对照组小鼠肺脏感染细菌数量[经对数转换(lg10CFU/ml)]为7.01±1.23,明显高于异烟肼组(2.59±0.87)和SHetA2组(2.25±0.94),差异有统计学意义(F=6.71,P=0.002);而异烟肼组与SHetA2组比较,差异无统计学意义(q=0.33,P=0.970)。结论SHetA2在体内外均对MTB有抗菌作用,或可成为新的抗结核化学药物的候选。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 药物评价 动物实验 硫异维甲类化合物
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