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基于深度特征融合的癌症病理图像分割网络 被引量:9
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作者 黄鸿 王涛 +2 位作者 李远 周凡琳 李昱 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第3期1-12,共12页
卷积神经网络在癌症病理图像分割中具有突出表现,但在临床应用上依然面临着切片染色多样、分辨率差异大等挑战。针对上述问题,提出了一种病灶分割网络HU-Net,提高了癌症病理图像的分割精度。HU-Net使用U-Net网络作为基本结构,利用经过... 卷积神经网络在癌症病理图像分割中具有突出表现,但在临床应用上依然面临着切片染色多样、分辨率差异大等挑战。针对上述问题,提出了一种病灶分割网络HU-Net,提高了癌症病理图像的分割精度。HU-Net使用U-Net网络作为基本结构,利用经过预训练的EfficientNet-B4作为网络特征编码器,解码器部分在U-Net网络上进行改进,将不同深度特征重新进行组合进行特征融合,提升了深层特征在预测中的作用。在此基础上,利用各深度层融合特征预测输出,构建多损失函数共同训练,使深层语义信息更具鉴别力。最后,采用改进的通道注意力模块对融合特征进行选择,使网络对不同分辨率图像的适应性增强,提升了模型筛选重要特征的能力。在BOT数据集和SEED数据集上分别进行癌症病灶分割实验,所提方法的DICE系数得分在两个数据集上分别达到77.99%和82.94%,准确度得分分别达到88.52%和87.42%。该方法相较于U-Net和DeepLabv3+等网络有效提升了癌症病理图像病灶分割精度,实现了更准确的癌症病灶定位和分割。 展开更多
关键词 计算机图像处理 分割算法 特征融合 癌症 病理图像 深度学习
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SELEX技术筛选乳腺癌亚型组织细胞的DNA适配子
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作者 潘先均 刘美 +1 位作者 李光新 徐发良 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期147-156,共10页
目的:获取结合于不同亚型乳腺癌组织细胞的DNA适配子。方法:采用PCR法建立随机双链DNA(double-stranded DNA,dsDNA)文库,用卵白素包被的琼脂糖珠从dsDNA库获取单链DNA(single-stranded DNA,ssDNA)文库;以消减细胞-指数富集的配体进化系... 目的:获取结合于不同亚型乳腺癌组织细胞的DNA适配子。方法:采用PCR法建立随机双链DNA(double-stranded DNA,dsDNA)文库,用卵白素包被的琼脂糖珠从dsDNA库获取单链DNA(single-stranded DNA,ssDNA)文库;以消减细胞-指数富集的配体进化系统(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术为基础,将体外培养的乳腺癌细胞MCF-7和MDA-MB-231交替作为靶标进行正筛选,以相同组织来源的乳腺上皮细胞MCF-10A进行负筛选,琼脂糖电泳法检测PCR扩增和适配子回收、温度梯度实验优化PCR条件、流式细胞术监测适配子与靶细胞的亲和力,采用常规分子生物学技术完成适配子的克隆和测序,通过序列分析初步筛选适配子;综合采用流式细胞术、激光共聚焦和免疫荧光染色等实验优选DNA适配子。结果:成功建立ssDNA文库,优化了SELEX筛选条件,通过20轮交叉串联的细胞-SELEX筛选获取了特异性结合乳腺癌MCF-7和MDA-MB-231细胞的DNA适配子,随机挑选100个阳性克隆测序,鉴定出72个DNA适配子,采用Blastn程序进行精确比对未发现相似序列。通过序列分析初步筛选出适配子5个,经优选实验获取了可结合乳腺癌亚型组织细胞的适配子2个。结论:采用交叉串联的细胞-SELEX技术,可在较短时间获取结合不同临床乳腺癌亚型组织细胞的DNA适配子,为乳腺癌靶向递药系统的探索研究提供了可能。 展开更多
关键词 乳腺癌 SELEX 适配子 交叉串联 广谱
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原发性膀胱平滑肌瘤合并子宫肌瘤1例报道 被引量:1
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作者 张艺薄 王德林 +4 位作者 罗生军 陈刚 程洪林 李小菊 贺小娟 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期626-628,共3页
膀胱肿瘤以恶性多见,绝大多数起源于尿路移行上皮,间叶组织来源罕见,小于5%,包括平滑肌瘤、纤维肌瘤、横纹肌瘤、纤维瘤和骨瘤[1]。其中,最常见组织学类型是平滑肌瘤。据1990至2021年文献统计,目前中文文献已报道膀胱平滑肌瘤约169例,... 膀胱肿瘤以恶性多见,绝大多数起源于尿路移行上皮,间叶组织来源罕见,小于5%,包括平滑肌瘤、纤维肌瘤、横纹肌瘤、纤维瘤和骨瘤[1]。其中,最常见组织学类型是平滑肌瘤。据1990至2021年文献统计,目前中文文献已报道膀胱平滑肌瘤约169例,外文文献已报道不足300例。本文报道原发性膀胱平滑肌瘤合并子宫肌瘤1例,对此病的发病率、病因病理、临床表现、诊断与治疗进行讨论,以提高临床对此病的认识和诊治水平。 展开更多
关键词 平滑肌瘤 横纹肌瘤 移行上皮 外文文献 组织学类型 文献统计 膀胱肿瘤 骨瘤
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不同月龄APP/PS1双转基因AD小鼠海马神经元线粒体的动态变化 被引量:2
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作者 李世杰 唐俐 +3 位作者 周凡琳 熊晓敏 张雄 李昱 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1141-1146,共6页
目的:检测不同月龄APP/PS1双转基因阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)模型小鼠海马神经元中线粒体自噬的动态变化,并探讨其意义。方法:选取20只雄性APP/PS1双转基因AD小鼠为研究对象,分为3月龄组、6月龄组、9月龄组和12月龄组,以C5... 目的:检测不同月龄APP/PS1双转基因阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)模型小鼠海马神经元中线粒体自噬的动态变化,并探讨其意义。方法:选取20只雄性APP/PS1双转基因AD小鼠为研究对象,分为3月龄组、6月龄组、9月龄组和12月龄组,以C57小鼠为对照组。获取海马组织,通过电镜观察海马区神经元中线粒体的形态变化,用Western blot检测自噬相关蛋白LC3和P62的表达水平;线粒体自噬相关蛋白PINK1、Parkin和Miro1的表达水平;线粒体外膜蛋白Tom20的表达水平。结果:电镜观察结果显示:随着月龄增大,APP/PS1双转基因AD小鼠海马区神经元中线粒体损伤的病理变化呈逐渐加重的过程,即线粒体明显水肿、透明,嵴排列不规则,断裂,甚至消失。Western blot结果显示,与野生小鼠组比较,LC3、P62、PINK1和Parkin蛋白表达水平在6月龄组、9月龄组和12月龄组小鼠中明显增高(P<0.05),而Miro1蛋白却明显降低(P<0.05),Tom20的表达水平无明显差异(P>0.05)。结论:随着APP/PS1双转基因AD小鼠月龄的增加,其海马区神经元线粒体病理改变呈动态,线粒体自噬呈动态增强但伴随线粒体清除障碍。 展开更多
关键词 AD小鼠 不同月龄 海马 线粒体
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EBV阳性小B细胞非霍奇金淋巴瘤的研究进展 被引量:1
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作者 李小菊 李昱 +1 位作者 周凡琳 张徽 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期192-194,共3页
EBV是人类最常见的病毒感染之一,大部分为潜伏感染;可导致多种恶性肿瘤的发生、发展,与多种淋巴瘤密切相关,尤其是B细胞谱系的淋巴瘤。目前研究主要集中于EBV相关的大B细胞淋巴瘤,而与EBV相关的小B细胞非霍奇金淋巴瘤鲜有报道。各类型的... EBV是人类最常见的病毒感染之一,大部分为潜伏感染;可导致多种恶性肿瘤的发生、发展,与多种淋巴瘤密切相关,尤其是B细胞谱系的淋巴瘤。目前研究主要集中于EBV相关的大B细胞淋巴瘤,而与EBV相关的小B细胞非霍奇金淋巴瘤鲜有报道。各类型的EBV阳性小B细胞非霍奇金淋巴瘤在发病因素、临床表现、病理组织学特征、免疫表型以及遗传学上均有差异,该文总结国内外相关文献对EBV阳性小B细胞非霍奇金淋巴瘤的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 淋巴瘤 小B细胞非霍奇金淋巴瘤 EB病毒 文献综述
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多参数磁共振VI-RADS系统对膀胱癌肌层浸润的预测价值 被引量:3
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作者 袁方 杨露 +7 位作者 王雨 姜青明 李俊 戴君勇 鲜鹏 袁刚军 李元 刘南 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第23期2512-2518,共7页
目的评估基于多参数磁共振的膀胱影像-报告和数据系统(vesical imaging-reporting and data system,VI-RADS)对膀胱癌肌层浸润与否的诊断预测价值。方法收集重庆大学附属肿瘤医院2017年1月至2021年3月行多参数磁共振检查并完成经尿道膀... 目的评估基于多参数磁共振的膀胱影像-报告和数据系统(vesical imaging-reporting and data system,VI-RADS)对膀胱癌肌层浸润与否的诊断预测价值。方法收集重庆大学附属肿瘤医院2017年1月至2021年3月行多参数磁共振检查并完成经尿道膀胱肿瘤切除术(transurethral resection of bladder tumor,TURBT)或根治性膀胱切除术的278例膀胱病变患者临床资料;不同影像学医师分别进行磁共振VI-RADS评分,Kappa检验其一致性;分析VI-RADS评分与病理结果的吻合度;采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析VI-RADS各评分诊断肌层浸润性膀胱癌的效能;比较不同手术方式获取的病理组织与VI-RADS评分吻合度。结果两位影像评估者VI-RADS评分一致性较好(符合率为79.86%,Kappa值=0.7508,P<0.001)。ROC曲线分析显示,VI-RADS评分≥3时预测肌层浸润性膀胱癌的曲线下面积为0.774,约登指数为54.78%,敏感度为96.16%,特异度为58.62%,阳性预测值(positive predictive value,PPV)为58.14%,阴性预测值(negative predictive value,NPV)为96.23%。根治性膀胱切除术获得的病理结果与VI-RADS评分吻合度高达92.85%,显著高于行TURBT术的79.81%(P<0.05)。结论术前多参数磁共振VI-RADS评分具有良好的一致性和稳定性,与术后病理吻合度高;VI-RADS评分≥3分对肌层浸润性膀胱癌的预测价值较好,可指导临床手术选择方式。 展开更多
关键词 肌层浸润性膀胱癌 多参数磁共振 经尿道膀胱肿瘤切除术 根治性膀胱切除术 膀胱影像-报告和数据系统 术前预测
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双能量CT定量参数预测实性肺腺癌气道播散 被引量:4
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作者 尹柯 巴文娟 +2 位作者 陶俊利 申丽丽 张久权 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2022年第10期1514-1518,共5页
目的观察双能量CT(DECT)定量参数术前预测实性肺腺癌气道播散(STAS)状态的价值。方法回顾性分析52例经手术病理确诊实性肺腺癌患者的DECT及病理学资料,评估其STAS状态(阳性或阴性);对比STAS阳性、阴性实性肺腺癌CT表现(最大径、周围不... 目的观察双能量CT(DECT)定量参数术前预测实性肺腺癌气道播散(STAS)状态的价值。方法回顾性分析52例经手术病理确诊实性肺腺癌患者的DECT及病理学资料,评估其STAS状态(阳性或阴性);对比STAS阳性、阴性实性肺腺癌CT表现(最大径、周围不透明影、空气支气管征、胸膜凹陷征)及DECT定量参数的差异。针对差异有统计学意义的DECT定量参数绘制受试者工作特征(ROC)曲线,计算曲线下面积(AUC),评估DECT定量参数单独及联合预测实性肺腺癌STAS的效能,并以二元logistic回归分析筛选实性肺腺癌STAS的独立预测因子。结果52例中,25例STAS阳性,27例STAS阴性,其间病灶CT表现差异均无统计学意义(P均>0.05),DECT定量参数中的动脉期碘浓度(IC_(A))、动脉期标准化碘浓度(NIC_(A))及静脉期碘浓度(IC_(V))差异均有统计学意义(P均<0.05)。IC_(A)、NIC_(A)及IC_(V)预测实性肺腺癌STAS的AUC为0.82、0.83及0.73;IC_(A)和NIC_(A)均为实性肺腺癌STAS的独立预测因子,其联合AUC为0.89。结论DECT定量参数可有效预测实性肺腺癌STAS。 展开更多
关键词 肺肿瘤 肿瘤转移 体层摄影术 X线计算机 CT双能量成像 气道播散
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原发鼻腔鼻窦肾细胞样腺癌1例
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作者 李小菊 周凡琳 张徽 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期754-755,共2页
患者男性,64岁,发现左侧鼻阻、脓涕半年,伴鼻出血3个月。鼻部CT示鼻窦炎或鼻道息肉可能。行功能性鼻内窥镜双侧筛窦开放术+右侧上颌窦开放术+鼻息肉切除术。病理检查眼观:灰白、灰红色碎组织一堆,大小2.5 cm×2 cm×1 cm,切面... 患者男性,64岁,发现左侧鼻阻、脓涕半年,伴鼻出血3个月。鼻部CT示鼻窦炎或鼻道息肉可能。行功能性鼻内窥镜双侧筛窦开放术+右侧上颌窦开放术+鼻息肉切除术。病理检查眼观:灰白、灰红色碎组织一堆,大小2.5 cm×2 cm×1 cm,切面质中。 展开更多
关键词 鼻肿瘤 肾细胞样腺癌 病例报道
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