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具核梭杆菌介导MUC1在结直肠癌中差异表达的验证
被引量：
1
1
作者
叶新力
李静
+6 位作者
唐彬
兰远志
罗华星
卢晓雪
向媛媛
张艳
曾冬竹
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期1501-1506,F0003,共7页
目的通过生物信息学分析具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F. nucleatum,Fn.)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)差异表达基因(differential expression genes,DEGs)的调控作用,鉴定关键基因在F. nucleatum感染结直肠癌细胞中的表达...
目的通过生物信息学分析具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F. nucleatum,Fn.)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)差异表达基因(differential expression genes,DEGs)的调控作用,鉴定关键基因在F. nucleatum感染结直肠癌细胞中的表达。方法利用GEO数据库高通量筛选F. nucleatum诱导的结直肠癌差异表达基因;基因本体论(GO),京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析差异表达基因数据集;Cytoscape软件构建差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);RT-qPCR和Western blot验证关键(Hub)基因MUC1在细胞模型中的转录水平和蛋白水平表达。结果共筛选出118个DEGs,其中20个表达上调,98个下调;GO分析显示DEGs在质膜和质膜的组成部分等细胞成分中富集最显著,KEGG分析发现其在PI3K-Akt、MAPK、Rap1和JAK-STAT等信号通路中有明显富集(P<0.05)。在PPI网络中,Hub基因MUC1具有较高的中心性得分,F. nucleatum感染与MUC1的差异表达显著相关。结论通过对关键基因的筛选和验证,F. nucleatum感染致CRC的机制可能与MUC1的过表达有关。
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关键词
结直肠癌
具核梭杆菌
MUC1
差异表达基因
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题名
具核梭杆菌介导MUC1在结直肠癌中差异表达的验证
被引量：
1
1
作者
叶新力
李静
唐彬
兰远志
罗华星
卢晓雪
向媛媛
张艳
曾冬竹
机构
重庆医科大学附属第三医院普外科
陆军军医
大学
(第三军医
大学
)药学与检验医学系临床微生物与免疫学教研室
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第15期1501-1506,F0003,共7页
基金
重庆市渝北区科技计划项目(2020-35)。
文摘
目的通过生物信息学分析具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F. nucleatum,Fn.)对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)差异表达基因(differential expression genes,DEGs)的调控作用,鉴定关键基因在F. nucleatum感染结直肠癌细胞中的表达。方法利用GEO数据库高通量筛选F. nucleatum诱导的结直肠癌差异表达基因;基因本体论(GO),京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析差异表达基因数据集;Cytoscape软件构建差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);RT-qPCR和Western blot验证关键(Hub)基因MUC1在细胞模型中的转录水平和蛋白水平表达。结果共筛选出118个DEGs,其中20个表达上调,98个下调;GO分析显示DEGs在质膜和质膜的组成部分等细胞成分中富集最显著,KEGG分析发现其在PI3K-Akt、MAPK、Rap1和JAK-STAT等信号通路中有明显富集(P<0.05)。在PPI网络中,Hub基因MUC1具有较高的中心性得分,F. nucleatum感染与MUC1的差异表达显著相关。结论通过对关键基因的筛选和验证,F. nucleatum感染致CRC的机制可能与MUC1的过表达有关。
关键词
结直肠癌
具核梭杆菌
MUC1
差异表达基因
Keywords
colorectal cancer
Fusobacterium nucleatum
MUC1
differential expression genes
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
具核梭杆菌介导MUC1在结直肠癌中差异表达的验证
叶新力
李静
唐彬
兰远志
罗华星
卢晓雪
向媛媛
张艳
曾冬竹
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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