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基于高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱的股骨头缺血性坏死患者尿液的代谢轮廓分析
被引量：
4
1
作者
高四川
周爱国
+4 位作者
白浩波
陈婷梅
丁世家
郭延磊
张健
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期611-616,共6页
目的:运用代谢组学的分析研究方法,对股骨头缺血性坏死(osteonecrosis of the femoral head,ONFH)患者尿液进行代谢轮廓分析,从而探索 ONFH 的分子机制及诊断性生物标志物。方法:运用高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱技术对 26 例 O...
目的:运用代谢组学的分析研究方法,对股骨头缺血性坏死(osteonecrosis of the femoral head,ONFH)患者尿液进行代谢轮廓分析,从而探索 ONFH 的分子机制及诊断性生物标志物。方法:运用高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱技术对 26 例 ONFH 患者的尿液(实验组)和 26 例正常人的尿液(对照组)进行检测,结合主成分分析法(PCA)和正交偏最小二乘法分析(OPLS_DA)对差异代谢物进行模式识别分析并观察组间差异。结果:实验组和对照组的代谢谱得到明显区分,发现并鉴定出 28 种与 ONFH 相关的差异代谢物,差异具有统计学意义(P<0.05),其中筛选出二丙基二硫化物、三甲基硒和氨基甲酸作为ONFH 潜在的诊断性生物标志物;此外,嘌呤代谢、酪氨酸代谢、果糖和甘露糖代谢的紊乱可能与 ONFH 发生发展密切相关。生物信息学分析结果显示 ONFH 患者的骨骼发育、能量代谢、骨代谢、矿物质代谢、脂质代谢、脂质氧化、血管通透性和氧化应激均受到干扰。结论:基于高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱联合多变量数据统计分析成功运用于 ONFH 尿液的代谢轮廓分析。
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关键词
代谢组学
高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱
股骨头缺血性坏死
尿液
生物标志物
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职称材料
股骨头坏死患者基因表达的转录组学高通量分析
被引量：
4
2
作者
白浩波
朱卫文
+1 位作者
路倩
张健
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期1149-1154,共6页
目的:通过转录组方法,探索股骨头缺血性坏死发生发展过程中骨小梁改变的分子机制及预测股骨头坏死的诊断性生物标志物。方法:取4例股骨头坏死患者骨小梁组织(实验组)和4例股骨颈骨折患者骨小梁(对照组),通过转录组测序筛选差异基因;将...
目的:通过转录组方法,探索股骨头缺血性坏死发生发展过程中骨小梁改变的分子机制及预测股骨头坏死的诊断性生物标志物。方法:取4例股骨头坏死患者骨小梁组织(实验组)和4例股骨颈骨折患者骨小梁(对照组),通过转录组测序筛选差异基因;将筛选出的差异基因通过生物信息学软件分析,预测其可能参与的生物过程及信号通路。结果:高通量测序发现1527个差异基因(696个基因上调,831个基因下调),其中脂质运载蛋白2(lipocalin 2,LCN2)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferators-activated receptorγ,PPARγ)在坏死患者骨小梁组织的表达明显降低。差异表达基因在基因本体论(gene ontology,GO)分析中主要富集于细胞外基质组织、细胞外结构组织等。差异基因在京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析主要富集于细胞外基质受体相互作用(extracellular matrix-receptor-interaction,ECM-receptor-interaction)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptors,PPARs)信号通路。结论:本研究发现脂质运载蛋白2通过调节脂质代谢和成骨分化影响股骨头坏死的产生。对探索股骨头缺血性坏死的分子机制及诊断性生物标志物提供了线索。
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关键词
转录组测序
骨小梁
股骨头缺血性坏死
脂代谢
脂质运载蛋白2
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职称材料
题名
基于高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱的股骨头缺血性坏死患者尿液的代谢轮廓分析
被引量：
4
1
作者
高四川
周爱国
白浩波
陈婷梅
丁世家
郭延磊
张健
机构
重庆医科大学附属第一医院关节外科
重庆医科大学
检验医学院诊断医学实验室教育部重点实验室
重庆医科大学
检验医学院中国教育部临床实验室诊断重点实验室
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期611-616,共6页
文摘
目的:运用代谢组学的分析研究方法,对股骨头缺血性坏死(osteonecrosis of the femoral head,ONFH)患者尿液进行代谢轮廓分析,从而探索 ONFH 的分子机制及诊断性生物标志物。方法:运用高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱技术对 26 例 ONFH 患者的尿液(实验组)和 26 例正常人的尿液(对照组)进行检测,结合主成分分析法(PCA)和正交偏最小二乘法分析(OPLS_DA)对差异代谢物进行模式识别分析并观察组间差异。结果:实验组和对照组的代谢谱得到明显区分,发现并鉴定出 28 种与 ONFH 相关的差异代谢物,差异具有统计学意义(P<0.05),其中筛选出二丙基二硫化物、三甲基硒和氨基甲酸作为ONFH 潜在的诊断性生物标志物;此外,嘌呤代谢、酪氨酸代谢、果糖和甘露糖代谢的紊乱可能与 ONFH 发生发展密切相关。生物信息学分析结果显示 ONFH 患者的骨骼发育、能量代谢、骨代谢、矿物质代谢、脂质代谢、脂质氧化、血管通透性和氧化应激均受到干扰。结论:基于高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱联合多变量数据统计分析成功运用于 ONFH 尿液的代谢轮廓分析。
关键词
代谢组学
高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱
股骨头缺血性坏死
尿液
生物标志物
Keywords
metabolomics
High performance liquid chromatography-quadrupole-time of flight tandem mass spectrometry
osteonecrosis of the femoral head
urine
biomarkers
分类号
R681.6 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
股骨头坏死患者基因表达的转录组学高通量分析
被引量：
4
2
作者
白浩波
朱卫文
路倩
张健
机构
重庆医科大学附属第一医院关节外科
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期1149-1154,共6页
基金
重庆市渝中区科委科学技术资助项目(编号:20150121)
文摘
目的:通过转录组方法,探索股骨头缺血性坏死发生发展过程中骨小梁改变的分子机制及预测股骨头坏死的诊断性生物标志物。方法:取4例股骨头坏死患者骨小梁组织(实验组)和4例股骨颈骨折患者骨小梁(对照组),通过转录组测序筛选差异基因;将筛选出的差异基因通过生物信息学软件分析,预测其可能参与的生物过程及信号通路。结果:高通量测序发现1527个差异基因(696个基因上调,831个基因下调),其中脂质运载蛋白2(lipocalin 2,LCN2)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(peroxisome proliferators-activated receptorγ,PPARγ)在坏死患者骨小梁组织的表达明显降低。差异表达基因在基因本体论(gene ontology,GO)分析中主要富集于细胞外基质组织、细胞外结构组织等。差异基因在京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析主要富集于细胞外基质受体相互作用(extracellular matrix-receptor-interaction,ECM-receptor-interaction)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptors,PPARs)信号通路。结论:本研究发现脂质运载蛋白2通过调节脂质代谢和成骨分化影响股骨头坏死的产生。对探索股骨头缺血性坏死的分子机制及诊断性生物标志物提供了线索。
关键词
转录组测序
骨小梁
股骨头缺血性坏死
脂代谢
脂质运载蛋白2
Keywords
transcriptome sequencing
bone trabeculae
osteonecrosis of the femoral head
lipid metabolism
lipocalin 2
分类号
R681.6 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高效液相色谱-四级杆飞行时间串联质谱的股骨头缺血性坏死患者尿液的代谢轮廓分析
高四川
周爱国
白浩波
陈婷梅
丁世家
郭延磊
张健
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
股骨头坏死患者基因表达的转录组学高通量分析
白浩波
朱卫文
路倩
张健
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
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