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儿童结核病101例临床分离结核分枝杆菌多位点串联重复序列分型
被引量：
6
1
作者
王均
黄延风
+1 位作者
张爱华
许红梅
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第13期1408-1410,共3页
目的了解重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(variable numbertandem repeats,VNTR)的分布特征,寻找适合的VNTR位点组合。方法采用多位点串联重复序列(multiple locus VNTRanalysis,MLVA)分型方法,选择...
目的了解重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(variable numbertandem repeats,VNTR)的分布特征,寻找适合的VNTR位点组合。方法采用多位点串联重复序列(multiple locus VNTRanalysis,MLVA)分型方法,选择标化的24个VNTR位点,对101例结核分枝杆菌临床分离株DNA进行检测,结果采用BioNumerics 6.1数据库软件进行聚类分析和单位点Hunter-Gaston分辨率指数(Hunter-Gaston index,HGI)分析,并比较分析国际推荐的分组(12、15、24位点)的基因分型鉴定能力。结果 MLVA分析结果显示24个VNTR位点在不同菌株中存在明显的多态性,101例结核分枝杆菌临床分离株可分为1个基因群83种基因型,其中69种基因型只有1个菌株,占68.32%(69/101),另有32株临床分离株表现出14种基因型,占31.68%(32/101),成簇率为17.82%;24个VNTR位点的HGI具有较大差异(0.168～0.829),HGI能达到0.5以上的VNTR位点数有16个;24个VNTR位点进行不同的位点组合:12、15个和24个位点组合的HGI分别为0.995、0.996、0.996。结论 重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌存在基因多态性,国际推荐的15个VNTR位点组合的MLVA分型方法适用于其流行病学的研究。
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关键词
结核分枝杆菌
多位点可变数目串联重复序列
基因分型
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题名
儿童结核病101例临床分离结核分枝杆菌多位点串联重复序列分型
被引量：
6
1
作者
王均
黄延风
张爱华
许红梅
机构
重庆医科大学附属儿童医院
儿童
发育
疾病
研究
省
部
共建
教育部
重点实验室
重庆医科大学附属儿童医院儿童发育疾病研究省部共建教育部感染消化科
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第13期1408-1410,共3页
基金
重庆市科技计划项目(2008BB5389)~~
文摘
目的了解重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(variable numbertandem repeats,VNTR)的分布特征,寻找适合的VNTR位点组合。方法采用多位点串联重复序列(multiple locus VNTRanalysis,MLVA)分型方法,选择标化的24个VNTR位点,对101例结核分枝杆菌临床分离株DNA进行检测,结果采用BioNumerics 6.1数据库软件进行聚类分析和单位点Hunter-Gaston分辨率指数(Hunter-Gaston index,HGI)分析,并比较分析国际推荐的分组(12、15、24位点)的基因分型鉴定能力。结果 MLVA分析结果显示24个VNTR位点在不同菌株中存在明显的多态性,101例结核分枝杆菌临床分离株可分为1个基因群83种基因型,其中69种基因型只有1个菌株,占68.32%(69/101),另有32株临床分离株表现出14种基因型,占31.68%(32/101),成簇率为17.82%;24个VNTR位点的HGI具有较大差异(0.168～0.829),HGI能达到0.5以上的VNTR位点数有16个;24个VNTR位点进行不同的位点组合:12、15个和24个位点组合的HGI分别为0.995、0.996、0.996。结论 重庆地区儿童结核病中结核分枝杆菌存在基因多态性,国际推荐的15个VNTR位点组合的MLVA分型方法适用于其流行病学的研究。
关键词
结核分枝杆菌
多位点可变数目串联重复序列
基因分型
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
multiple locus variable number tandem repeats analysis
genotyping
分类号
R372 [医药卫生—病原生物学]
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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1
儿童结核病101例临床分离结核分枝杆菌多位点串联重复序列分型
王均
黄延风
张爱华
许红梅
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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