-
题名基于iTRAQ技术筛选肝癌转移相关差异蛋白
被引量：2
- 1
-
-
作者
宋琳岚
杨敏
蒋小燕
陈瑜
汤慧
颜亮
廖勇
-
机构
重庆医科大学病毒性肝炎研究所教育部感染性疾病分子生物学重点实验室重庆医科大学附属第二医院感染科
-
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期983-989,共7页
-
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:81172066
81472858)
-
文摘
目的:通过对不同转移潜能的肝癌细胞系的差异蛋白组学研究,以筛选鉴定出与肝癌转移相关的差异表达蛋白。方法:3株具有相同遗传背景、不同转移潜能的肝癌细胞系MHCC97-L、MHCC97-H及HCCLM3作为研究材料,经过收集胞质蛋白,浓缩、酶解、脱盐并用同位素标记相对和绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)对其进行标记,应用二维液相色谱串联质谱技术对肽段进行鉴定,得到的结果与数据库进行比对,对蛋白进行注释。基于Web Gestalt数据库对差异表达的蛋白进行GO(gene ontology)功能分析和通路分析以筛选与肝癌转移相关的目标蛋白。并用Western blot对3个关键蛋白(PLEC、SHMT2、LDHA)进行验证。结果:经过iTRAQ标记并质谱检测分析,共发现鉴定1 170个蛋白,其中在L/H(MHCC97-L/MHCC9-H)组鉴定发现47个差异表达蛋白,在M/H(HCCLM3/MHCC97-H)组鉴定发现65个差异表达蛋白。生物信息学分析显示L/H和M/H组差异表达的蛋白主要参与酶催化和细胞间粘附及细胞代谢的过程。应用Western blot在蛋白水平上的验证,PLEC在高转移细胞株MHCC97-H和HCCLM3中表达上调,SHMT2在HCCLM3中表达上调,LDHA在MHCC97-H中表达上调。结论:在本研究中应用iTRAQ标记高通量的蛋白质组学技术对3株不同转移潜能的肝癌细胞系的差异表达蛋白进行检测和鉴定分析,发现PLEC和SHMT2蛋白是两种新的与肝癌转移可能相关的蛋白。
-
关键词
肝细胞性肝癌
蛋白组学
同位素标记相对和绝对定量技术
转移
-
Keywords
hepatocellular carcinoma
proteomics
isobaric tags for relative and absolute quantitation
metastasis
-
分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
-
