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MRPL12在肺腺癌中的表达和预后分析 被引量:3
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作者 熊雷 易茜 +1 位作者 许明芳 陈健 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1033-1040,共8页
目的·分析线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能。方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库T... 目的·分析线粒体核糖体蛋白L12(mitochondrial ribosomal protein L12,MRPL12)在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和正常组织中的表达差异和对患者预后的影响,以及预测其生物学功能。方法·利用肿瘤浸润性免疫细胞分析数据库TIMER和GEPIA(gene expression profiling and interactive analyses)交互式网站服务器分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中MRPL12在不同癌组织中的表达情况的影响。利用Sangerbox生物信息分析平台对MRPL12差异表达的癌症类型进行Cox回归和Kaplan-Meier生存分析,评估风险比(hazard ratio,HR)、95%置信区间(confidence interval,CI)和Log-rank P值。采用UALCAN数据分析平台评估MRPL12蛋白表达与临床病理参数的关系。使用LinkedOmics数据库筛选与MRPL12表达相关的基因。采用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。定量聚合酶链反应验证MRPL12在细胞中的转录水平。结果·MRPL12在多种癌组织中显著高表达,但只有在LUAD中MRPL12的高表达与患者较差的总体生存期(overall suivival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;肿瘤分级程度越高的LUAD患者MRPL12蛋白表达水平越高;在LUAD基因表达数据集中与MRPL12负相关的基因富集到癌症通路(P=0.000)、癌症蛋白聚糖(P=0.000)、非小细胞肺癌(P=0.000)等癌症相关的通路。MRPL12在LUAD细胞(H1395、H1975和HCC827)中的mRNA表达水平高于正常细胞(Beas-2B),差异有统计学意义(P<0.05)。结论·MRPL12高表达的LUAD患者可能预后较差;MRPL12可以作为LUAD预后不良的潜在生物标志物和潜在的治疗新靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 线粒体核糖体蛋白L12 生存分析 预后 生物标志物 治疗靶点
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