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绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析
被引量：
4
1
作者
萨初拉
吴铁成
+5 位作者
马跃军
何云梅
朱莉仙
何托雅
武玉平
刘斌
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1037-1047,共11页
【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔...
【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只,利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)、骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因多态性,并对不同SNP位点与绒山羊产羔数进行关联分析。【结果】通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点,其中BMPR 1 B、B 4 GALNT 2、BMP 15、GDF 9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个。GLM模型关联分析发现,10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关(P<0.05),进一步进行卡方检验发现,其中7个SNPs位点基因型与产羔数显著相关(P<0.05)。BMPR 1 B基因g.29893723 C>G、g.29897064 G>A、g.29897722 G>A、g.29897734 C>A和g.29938673 C>G位点的CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型(P<0.05);B 4 GALNT 2基因g.37072289 G>A位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05);GDF 9基因g.66027842 A>C位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05)。【结论】试验获得了内蒙古白绒山羊多胎性状相关基因GDF 9、BMP 15、BMPR 1 B和B 4 GALNT 2的SNPs位点序列特征,发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点,并揭示了不同基因型产羔数间的差异,从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点。
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关键词
绒山羊
GDF
9基因
BMP
15基因
BMPR
1
B基因
B
4
GALNT
2基因
产羔数
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职称材料
题名
绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析
被引量：
4
1
作者
萨初拉
吴铁成
马跃军
何云梅
朱莉仙
何托雅
武玉平
刘斌
机构
内蒙古自治区农牧业科学院
鄂托克旗农牧技术推广中心
阿拉善盟畜牧兽医技术推广中心
鄂尔多斯市立新实业有限公司
杭锦旗农牧技术推广中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1037-1047,共11页
基金
内蒙古创新基金项目(2020CXJJM01)
内蒙古自治区科技计划项目(2020GG0095)
+2 种基金
内蒙古自治区科技成果转化引导项目(2020CG0100)
鄂尔多斯市绒山羊重大专项(2019)
内蒙古自治区绒山羊重大专项(2017)。
文摘
【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析,深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只,利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)、骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein 15,BMP15)、骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2)基因多态性,并对不同SNP位点与绒山羊产羔数进行关联分析。【结果】通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点,其中BMPR 1 B、B 4 GALNT 2、BMP 15、GDF 9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个。GLM模型关联分析发现,10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关(P<0.05),进一步进行卡方检验发现,其中7个SNPs位点基因型与产羔数显著相关(P<0.05)。BMPR 1 B基因g.29893723 C>G、g.29897064 G>A、g.29897722 G>A、g.29897734 C>A和g.29938673 C>G位点的CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型(P<0.05);B 4 GALNT 2基因g.37072289 G>A位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05);GDF 9基因g.66027842 A>C位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型(P<0.05)。【结论】试验获得了内蒙古白绒山羊多胎性状相关基因GDF 9、BMP 15、BMPR 1 B和B 4 GALNT 2的SNPs位点序列特征,发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点,并揭示了不同基因型产羔数间的差异,从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点。
关键词
绒山羊
GDF
9基因
BMP
15基因
BMPR
1
B基因
B
4
GALNT
2基因
产羔数
Keywords
cashmere goats
GDF 9 gene
BMP15 gene
BMPR 1 B gene
B 4 GALNT 2 gene
litter size
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析
萨初拉
吴铁成
马跃军
何云梅
朱莉仙
何托雅
武玉平
刘斌
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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