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人血清白蛋白与氯氰菊酯相互作用的分子模拟研究被引量：2: 1; 作者邓培渊王辉 +2 位作者袁洪哲王广军李长看《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期11-17,共7页; 运用分子对接、分子动力学、结合自由能计算和丙氨酸扫描等分子模拟方法,研究了人血清白蛋白（human serum albumin,HSA）与氯氰菊酯的结合模式。结果表明：氯氰菊酯与HSA结合形成了稳定的复合物,与其氨基酸残基Arg209形成1个氢键,结合... 展开更多; 关键词人血清白蛋白氯氰菊酯分子动力学分子力学泊松-波尔兹曼表面积法(MM-PBSA) 丙氨酸突变扫描; 在线阅读下载PDF 职称材料

家蚕性信息素结合蛋白与蚕蛾醛作用的分子模拟研究: 2; 作者邓培渊袁伟 +2 位作者李玉华王广军李长看《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期796-799,共4页; 为明确家蚕性信息素结合蛋白(pheromone binding protein,PBP)和蚕蛾醛作用的分子机制,运用分子对接、分子动力学、结合自由能的计算和能量分解等分子模拟方法分析二者结合的模式和关键氨基酸。结果表明蚕蛾醛与PBP的Trp59位点形成1个H... 展开更多; 关键词信息素结合蛋白蚕蛾醛分子对接分子动力学结合自由能能量分解; 在线阅读下载PDF 职称材料

甜菜夜蛾化学感受蛋白SexiCSP3结合特性分析被引量：2: 3; 作者邓培渊袁伟 +2 位作者李玉华王林青李长看《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期979-986,共8页; 本研究构建夜蛾科昆虫化学感受蛋白系统进化树,发现化学感受蛋白在种间保守性强,并与气味结合蛋白明显分为两类。运用反转录RT-PCR方法克隆了Sexi CSP3基因,并在大肠杆菌中正确表达,重组Sexi CSP3蛋白纯化后通过荧光竞争结合实验测定其... 展开更多; 关键词甜菜夜蛾化学感受蛋白荧光竞争结合实验解离常数; 在线阅读下载PDF 职称材料

不同沉淀方法对外源表达凝乳酶活性的影响被引量：1: 4; 作者邓培渊郭红玲 +1 位作者袁伟李玉华《江苏农业科学》北大核心 2015年第4期50-52,共3页; 从粗提重组凝乳酶的得率、保存活性2个方面比较了乙醇沉淀法和硫酸铵沉淀法的差别。结果表明,相对于硫酸铵沉淀法,乙醇沉淀法获得蛋白的量相差不是很大,但是乙醇沉淀法所获得蛋白的单位效价是硫酸铵沉淀法的1.27倍,且乙醇沉淀法所得产... 展开更多; 关键词重组凝乳酶活性乙醇沉淀法硫酸铵盐析; 在线阅读下载PDF 职称材料

防腐剂苯甲酸与人血清白蛋白相互作用被引量：5: 5; 作者邓培渊袁伟 +2 位作者李长看陈龙欣杨莹莹《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1014-1021,共8页; 为研究食品防腐剂苯甲酸在人体内的转运和降解机制,在人体血液的生理条件下运用荧光光谱法和分子对接、分子动力学模拟和丙氨酸突变扫描等方法研究了苯甲酸与人血清白蛋白(Human Serum Albumin,HSA)相互作用机理。结果表明:苯甲酸和HSA... 展开更多; 关键词苯甲酸人血清白蛋白荧光猝灭分子对接分子动力学模拟; 在线阅读下载PDF 职称材料

连翘脂苷A对乙酰胆碱酯酶的抑制作用被引量：3: 6; 作者邓培渊袁伟 +1 位作者陈龙欣杨莹莹《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第3期178-181,272,共5页; 连翘脂苷A(forsythiaside A,FTA)是连翘的主要活性成分,对阿尔茨海默症有一定的疗效。运用荧光竞争结合实验、分子对接、分子动力学模拟和丙氨酸突变扫描等方法分析了连翘脂苷A对乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE)的抑制作用和... 展开更多; 关键词连翘脂苷A 乙酰胆碱酯酶荧光竞争结合实验分子动力学丙氨酸突变扫描; 在线阅读下载PDF 职称材料

小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯作用的分子模拟被引量：2: 7; 作者赵奇邓培渊 +3 位作者李玉华杨玉珍杨宗渠雷志华《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2193-2197,共5页; 【目的】研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14∶Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据。【方法】运用YASARA对PxylPBP... 展开更多; 关键词小菜蛾性信息素结合蛋白(PxylPBP2) 性信息素分子动力学模拟能量分解; 在线阅读下载PDF 职称材料

地黄梓醇和乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟被引量：3: 8; 作者邓培渊袁伟 +1 位作者李长看徐欢欢《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2021年第1期27-31,共5页; 梓醇能有效的的改善阿茨海默尔症状,但与乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AchE)作用的分子机制尚不明晰.本文运用分子动力学模拟、结合自由能的计算和丙氨酸突变扫描的方法研究了两者的结合模式,结果表明:梓醇结合位点为乙酰胆碱酯... 展开更多; 关键词乙酰胆碱酯酶梓醇分子动力学结合自由能丙氨酸突变扫描; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名人血清白蛋白与氯氰菊酯相互作用的分子模拟研究被引量：2: 1; 作者邓培渊王辉袁洪哲王广军李长看; 机构郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室河南中医药大学第一附属医院脑病介入科; 出处《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期11-17,共7页; 基金河南省科技攻关重点项目(132102110175); 文摘运用分子对接、分子动力学、结合自由能计算和丙氨酸扫描等分子模拟方法,研究了人血清白蛋白（human serum albumin,HSA）与氯氰菊酯的结合模式。结果表明：氯氰菊酯与HSA结合形成了稳定的复合物,与其氨基酸残基Arg209形成1个氢键,结合自由能为–83.43 kJ/mol,其中范德华力是结合的主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力。丙氨酸突变扫描结果显示,氨基酸残基Lys199的ΔΔG_（bind）值为16.78 kJ/mol,是HSA和氯氰菊酯结合的关键氨基酸。该研究结果为阐明氯氰菊酯在人体内的代谢机制提供了理论参考。; 关键词人血清白蛋白氯氰菊酯分子动力学分子力学泊松-波尔兹曼表面积法(MM-PBSA) 丙氨酸突变扫描; Keywords human serum albumin cypermethrin molecular dynamics molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area alanine scanning mutagenesis; 分类号 S481.1 [农业科学—农药学] O641.3 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名家蚕性信息素结合蛋白与蚕蛾醛作用的分子模拟研究: 2; 作者邓培渊袁伟李玉华王广军李长看; 机构郑州师范学院华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期796-799,共4页; 基金河南省科技攻关重点项目(No.132102110175); 文摘为明确家蚕性信息素结合蛋白(pheromone binding protein,PBP)和蚕蛾醛作用的分子机制,运用分子对接、分子动力学、结合自由能的计算和能量分解等分子模拟方法分析二者结合的模式和关键氨基酸。结果表明蚕蛾醛与PBP的Trp59位点形成1个H键,结合自由能为-53. 87 k J/mol,范德华力和非极性溶剂化能是主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力,能量分解发现Leu30、Phe34、Ala95、Leu112和Phe130是二者结合的关键氨基酸残基。这些结果为阐明家蚕性信息素蚕蛾醛在家蚕识别性信息素过程中的作用机制提供了参考。; 关键词信息素结合蛋白蚕蛾醛分子对接分子动力学结合自由能能量分解; Keywords Pheromone binding protein Bombykal Molecular docking Molecular dynamics Binding free energy Energy decomposition; 分类号 O629.72 [理学—有机化学] S881.23 [农业科学—特种经济动物饲养]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名甜菜夜蛾化学感受蛋白SexiCSP3结合特性分析被引量：2: 3; 作者邓培渊袁伟李玉华王林青李长看; 机构郑州师范学院华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2015年第5期979-986,共8页; 基金河南省科技攻关重点项目(132102110175); 文摘本研究构建夜蛾科昆虫化学感受蛋白系统进化树,发现化学感受蛋白在种间保守性强,并与气味结合蛋白明显分为两类。运用反转录RT-PCR方法克隆了Sexi CSP3基因,并在大肠杆菌中正确表达,重组Sexi CSP3蛋白纯化后通过荧光竞争结合实验测定其与24种外源气味分子的结合特性。结果表明:Sexi CSP3与苯甲醛、苯乙酮、2-戊基-3-苯丙基-烯醛、1-苯基-1-丁酮、对甲氧基苯甲醛的结合能力较强,解离常数为0.76、1.39、2.23、3.23和5.30μmol/L,推测Sexi CSP3可能参与了甜菜夜蛾对这5种化学物质的识别过程。; 关键词甜菜夜蛾化学感受蛋白荧光竞争结合实验解离常数; Keywords Spodoptera exigua chemosensory protein fluorescence competitive binding assay the dissociation constant; 分类号 Q963 [生物学—昆虫学] S433.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名不同沉淀方法对外源表达凝乳酶活性的影响被引量：1: 4; 作者邓培渊郭红玲袁伟李玉华; 机构郑州师范学院/郑州市生物物种资源研究重点实验室华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《江苏农业科学》北大核心 2015年第4期50-52,共3页; 基金河南省基础与前沿技术研究计划(编号:102300410146); 文摘从粗提重组凝乳酶的得率、保存活性2个方面比较了乙醇沉淀法和硫酸铵沉淀法的差别。结果表明,相对于硫酸铵沉淀法,乙醇沉淀法获得蛋白的量相差不是很大,但是乙醇沉淀法所获得蛋白的单位效价是硫酸铵沉淀法的1.27倍,且乙醇沉淀法所得产物的比活性提高了16.78%。综合考虑重组凝乳酶的得率与活性,用乙醇沉淀的效果较好。; 关键词重组凝乳酶活性乙醇沉淀法硫酸铵盐析; 分类号 Q814.1 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名防腐剂苯甲酸与人血清白蛋白相互作用被引量：5: 5; 作者邓培渊袁伟李长看陈龙欣杨莹莹; 机构郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1014-1021,共8页; 基金国家自然科学基金(No.32071447) 河南省重点研发与推广专项(No.212102110462)资助。; 文摘为研究食品防腐剂苯甲酸在人体内的转运和降解机制,在人体血液的生理条件下运用荧光光谱法和分子对接、分子动力学模拟和丙氨酸突变扫描等方法研究了苯甲酸与人血清白蛋白(Human Serum Albumin,HSA)相互作用机理。结果表明:苯甲酸和HSA的结合为静态猝灭过程,不同条件下结合常数KA均大于1.0×10^(4 )L/mol,结合位点数约为1,结合位点为Site II;根据Van′t Hoff方程和分子动力学模拟发现两者结合主要促进作用力是静电作用力,抑制力是极性溶剂化能,且是自由能降低的自发反应;分子对接结果显示复合物中苯甲酸与ARG186形成1个氢键,丙氨酸突变扫描计算显示ASP108、GLN425和GLV459是结合的关键氨基酸。; 关键词苯甲酸人血清白蛋白荧光猝灭分子对接分子动力学模拟; Keywords Benzoic acid Human serum albumin Fluorescence quenching Molecular docking Molecular dynamics simulation; 分类号 O643.1 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名连翘脂苷A对乙酰胆碱酯酶的抑制作用被引量：3: 6; 作者邓培渊袁伟陈龙欣杨莹莹; 机构郑州师范学院华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第3期178-181,272,共5页; 基金国家自然科学基金(32071447) 河南省重点推广与研发项目(212102110462); 文摘连翘脂苷A(forsythiaside A,FTA)是连翘的主要活性成分,对阿尔茨海默症有一定的疗效。运用荧光竞争结合实验、分子对接、分子动力学模拟和丙氨酸突变扫描等方法分析了连翘脂苷A对乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE)的抑制作用和结合模式。结果显示:连翘脂苷A对AChE有一定抑制作用IC_(50)值为1.11×10^(-7)mol/L,解离常数Ki值为5.5×10^(-8)mol/L,连翘脂苷A经由H键作用结合于AChE的CAS区,两者结合自由能为-98.20 kJ/mol,静电作用力是结合的主要驱动力,Ser200,Phe120和Ser205为两者结合的关键氨基酸。; 关键词连翘脂苷A 乙酰胆碱酯酶荧光竞争结合实验分子动力学丙氨酸突变扫描; Keywords forsythiaside A acetylcholinesterase fluorescence competitive binding assay molecular dynamics alanine scanning mutagenesis; 分类号 R285 [医药卫生—中药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯作用的分子模拟被引量：2: 7; 作者赵奇邓培渊李玉华杨玉珍杨宗渠雷志华; 机构郑州师范学院生命科学学院郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2193-2197,共5页; 基金河南省科技攻关项目(182102310655) 河南省教育厅高等学校重点科研项目(19A180033) 郑州师范学院科技创新团队计划项目(702011); 文摘【目的】研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14∶Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据。【方法】运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14∶Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用MMPBSA.py模块计算PxylPBP2-Z9-14∶Ac复合物的结合自由能,以Amber12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14∶Ac的结合模式及相互作用力。【结果】同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14∶Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14∶Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43%。【结论】范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14∶Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上。; 关键词小菜蛾性信息素结合蛋白(PxylPBP2) 性信息素分子动力学模拟能量分解; Keywords Plutella xylostella sex pheromone binding protein(PxylPBP2) sex pheromone molecular dynamics simulation energy decomposition; 分类号 S433.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名地黄梓醇和乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟被引量：3: 8; 作者邓培渊袁伟李长看徐欢欢; 机构郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室华北水利水电大学环境与市政工程学院; 出处《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2021年第1期27-31,共5页; 文摘梓醇能有效的的改善阿茨海默尔症状,但与乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AchE)作用的分子机制尚不明晰.本文运用分子动力学模拟、结合自由能的计算和丙氨酸突变扫描的方法研究了两者的结合模式,结果表明:梓醇结合位点为乙酰胆碱酯酶的催化活性中心,并形成3个氢键,结合自由能为-60.59 k J/mol,结合的主要驱动力是范德华力和静电作用力,主要抑制力是极性溶剂化能,Tyr151和Gln176是两者结合的关键氨基酸.这些研究为开发高效的Ach E梓醇类似物抑制剂提供理论支持.; 关键词乙酰胆碱酯酶梓醇分子动力学结合自由能丙氨酸突变扫描; Keywords Acetylcholinesterase Catalpol Molecular dynamics Binding free energy Alanine scanning mutagenesis; 分类号 R91 [医药卫生—药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	人血清白蛋白与氯氰菊酯相互作用的分子模拟研究	邓培渊王辉袁洪哲王广军李长看	《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	家蚕性信息素结合蛋白与蚕蛾醛作用的分子模拟研究	邓培渊袁伟李玉华王广军李长看	《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心	2018	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	甜菜夜蛾化学感受蛋白SexiCSP3结合特性分析	邓培渊袁伟李玉华王林青李长看	《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心	2015	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	不同沉淀方法对外源表达凝乳酶活性的影响	邓培渊郭红玲袁伟李玉华	《江苏农业科学》北大核心	2015	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	防腐剂苯甲酸与人血清白蛋白相互作用	邓培渊袁伟李长看陈龙欣杨莹莹	《应用化学》 CAS CSCD 北大核心	2021	5	在线阅读下载PDF 职称材料
6	连翘脂苷A对乙酰胆碱酯酶的抑制作用	邓培渊袁伟陈龙欣杨莹莹	《中华中医药学刊》 CAS 北大核心	2022	3	在线阅读下载PDF 职称材料
7	小菜蛾性信息素结合蛋白与顺-9-十四碳烯酸酯作用的分子模拟	赵奇邓培渊李玉华杨玉珍杨宗渠雷志华	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
8	地黄梓醇和乙酰胆碱酯酶作用的分子动力学模拟	邓培渊袁伟李长看徐欢欢	《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心	2021	3	在线阅读下载PDF 职称材料