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高等植物的花发育模型及其基因调控研究进展
被引量:
7
1
作者
田云芳
袁秀云
+2 位作者
蒋素华
马杰
崔波
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014年第11期23-28,共6页
花发育是高等植物生长发育过程中非常重要的事件之一。为了解花发育的分之机制,阐述了花器官决定同源异型基因作用模型的产生和发展过程,如经典的花发育ABC模型、随后发展起来的ABCD、ABCDE和四聚体模型,综述了花器官发育分子模型同源...
花发育是高等植物生长发育过程中非常重要的事件之一。为了解花发育的分之机制,阐述了花器官决定同源异型基因作用模型的产生和发展过程,如经典的花发育ABC模型、随后发展起来的ABCD、ABCDE和四聚体模型,综述了花器官发育分子模型同源基因的调控机理等方面的研究成果,并展望了研究方向。
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关键词
高等植物
花发育
同源基因
基因调控
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职称材料
蕙兰GAPDH基因的全长克隆及生物信息学分析
被引量:
2
2
作者
田云芳
蒋素华
+1 位作者
袁秀云
崔波
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期870-877,共8页
根据GenBank中已登陆的GAPDH基因的同源核苷酸保守序列,设计简并引物,采用RT-PCR的方法得到5个875 bp的片段,分别命名为CfGAPDH1-CfGAPDH5,GenBank登录号分别为JN177722-JN177726。同时结合RACE方法得到蕙兰GAPDH基因cDNA全长,命名为CfG...
根据GenBank中已登陆的GAPDH基因的同源核苷酸保守序列,设计简并引物,采用RT-PCR的方法得到5个875 bp的片段,分别命名为CfGAPDH1-CfGAPDH5,GenBank登录号分别为JN177722-JN177726。同时结合RACE方法得到蕙兰GAPDH基因cDNA全长,命名为CfGAPDH(JX560732),该序列cDNA全长为1 496 bp,具有完整的开放阅读框(ORF,173-1 195 bp),编码340个氨基酸,该基因编码的氨基酸序列与其他植物的GAPDH蛋白有较高的同源性(80%以上)。系统进化分析表明蕙兰CfGAPDH基因核苷酸序列与墨兰GAPDH1、GAPDH2和春兰GAPDH1的同源性最高(99%),所编码的氨基酸序列与墨兰GAPDH2的同源性达100%。生物信息学分析推测,该基因编码的蛋白残基主要有两个卷曲螺旋区域,分别位于25和250位点附近,属于不稳定蛋白,亲水性较强,初步推断CfGAPDH是一个胞质型GAPDH,二级结构中的β转角所占比例较高(41.2%),三级结构与春兰和小麦非常相似。
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关键词
蕙兰
GAPDH
RACE
生物信息学
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职称材料
蕙兰CfMADS1基因的克隆及其时空表达特性
被引量:
5
3
作者
田云芳
袁秀云
+3 位作者
蒋素华
马杰
苏金乐
崔波
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015年第7期143-149,154,共8页
【目的】对蕙兰CfMADS1基因cDNA全长进行克隆和时空表达特性研究,为研究成花相关基因的功能提供参考。【方法】以蕙兰萼片cDNA为模板,利用反转录RT-PCR和RACE的方法,克隆获得CfMADS1全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。以蕙兰各时...
【目的】对蕙兰CfMADS1基因cDNA全长进行克隆和时空表达特性研究,为研究成花相关基因的功能提供参考。【方法】以蕙兰萼片cDNA为模板,利用反转录RT-PCR和RACE的方法,克隆获得CfMADS1全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。以蕙兰各时期的器官组织为材料,利用荧光定量PCR进行该基因的时空表达分析。【结果】成功克隆了CfMADS1基因(GenBank登录号为KC148540),其cDNA序列全长1 061bp,开放阅读框长744bp,编码247个氨基酸,分子式为C1 244H2 040N370O377S9。其编码的氨基酸序列与AP1/FUL亚家族中金钗石斛MADS1具有较高的同源性(85.43%),与AP1/FUL转录因子亚家族中的蛋白聚为一类。该基因编码蛋白没有明显的信号肽和跨膜域,极可能位于细胞核内,具有MADS保守域(1-61aa)和相对保守的K区(87-178aa),而且在C末端具有AP1/FUL特征基序(LPPWML),二级结构中α-螺旋所占比例较高(55.63%),三级结构与月季、水稻和水仙MADS1蛋白结构非常相似。该基因在盛花期叶中表达最强烈,花蕾期叶、葶、蕾及营养期叶、盛花期葶中表达较为强烈,子房和营养期根中表达较弱,其余器官组织中表达痕量。【结论】从蕙兰萼片中克隆得到了CfMADS1cDNA全长序列,CfMADS1与蕙兰的成花诱导、花发育以及果实形成有关。
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关键词
蕙兰
AP1/FUL-like基因
时空表达
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职称材料
蕙兰α微管蛋白基因的克隆与序列分析
4
作者
田云芳
袁秀云
+1 位作者
崔波
苏金乐
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2014年第6期123-127,共5页
α微管蛋白(TUA)基因常作为研究其他功能基因表达的内参基因。以TUA作为候选内参基因之一,依据GenBank已经公布的同源TUA基因的核苷酸保守序列,设计简并性引物,以蕙兰花蕾期的花葶为材料,提取总RNA,利用RT-PCR的方法,克隆了4条TUA基因...
α微管蛋白(TUA)基因常作为研究其他功能基因表达的内参基因。以TUA作为候选内参基因之一,依据GenBank已经公布的同源TUA基因的核苷酸保守序列,设计简并性引物,以蕙兰花蕾期的花葶为材料,提取总RNA,利用RT-PCR的方法,克隆了4条TUA基因片段。序列分析结果表明,4条TUA基因片段长度均为1 205bp,编码401个氨基酸,具有TUA基因标记位点:Tubulin subunits alpha,beta,and gamma signature特征信号序列(GGGTGSG)。各序列之间同源性高达99.63%,经Blast分析,与水稻同源性可达86%。利用DNAMAN等生物软件推断的氨基酸,与月季、玉米、牛筋草、小麦、看麦娘和水稻TUA基因所编码的氨基酸序列同源性达98%。研究中所得到的4个基因序列是TUA基因的同源片段,依次命名为CfTUA1、CfTUA2、CfTUA3、CfTUA4,GenBank登录号分别为JN177709、JN177710、JN177711、JN177712。
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关键词
蕙兰
α微管蛋白基因
克隆
序列分析
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职称材料
题名
高等植物的花发育模型及其基因调控研究进展
被引量:
7
1
作者
田云芳
袁秀云
蒋素华
马杰
崔波
机构
郑州
师范学院
生命科学系
郑州师范学院生物研究所
出处
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014年第11期23-28,共6页
基金
河南省科技攻关项目"蝴蝶兰的分子育种"(092102110128)
河南省教育厅科学技术研究重点项目"蕙兰合适内参基因及开花相关基因的研究"(14A220005)
文摘
花发育是高等植物生长发育过程中非常重要的事件之一。为了解花发育的分之机制,阐述了花器官决定同源异型基因作用模型的产生和发展过程,如经典的花发育ABC模型、随后发展起来的ABCD、ABCDE和四聚体模型,综述了花器官发育分子模型同源基因的调控机理等方面的研究成果,并展望了研究方向。
关键词
高等植物
花发育
同源基因
基因调控
Keywords
higher plants
flower development
homeotic genes
gene regulation
分类号
S021 [农业科学]
Q944.58 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
蕙兰GAPDH基因的全长克隆及生物信息学分析
被引量:
2
2
作者
田云芳
蒋素华
袁秀云
崔波
机构
郑州师范学院生物研究所
出处
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期870-877,共8页
基金
河南省重点科技攻关项目(092102110128)
郑州市科技计划项目(112PPTGY250-3)
文摘
根据GenBank中已登陆的GAPDH基因的同源核苷酸保守序列,设计简并引物,采用RT-PCR的方法得到5个875 bp的片段,分别命名为CfGAPDH1-CfGAPDH5,GenBank登录号分别为JN177722-JN177726。同时结合RACE方法得到蕙兰GAPDH基因cDNA全长,命名为CfGAPDH(JX560732),该序列cDNA全长为1 496 bp,具有完整的开放阅读框(ORF,173-1 195 bp),编码340个氨基酸,该基因编码的氨基酸序列与其他植物的GAPDH蛋白有较高的同源性(80%以上)。系统进化分析表明蕙兰CfGAPDH基因核苷酸序列与墨兰GAPDH1、GAPDH2和春兰GAPDH1的同源性最高(99%),所编码的氨基酸序列与墨兰GAPDH2的同源性达100%。生物信息学分析推测,该基因编码的蛋白残基主要有两个卷曲螺旋区域,分别位于25和250位点附近,属于不稳定蛋白,亲水性较强,初步推断CfGAPDH是一个胞质型GAPDH,二级结构中的β转角所占比例较高(41.2%),三级结构与春兰和小麦非常相似。
关键词
蕙兰
GAPDH
RACE
生物信息学
Keywords
Cymbidium faberi
Glyceraldehyde - 3 - phosphatedehydrogenasegene
RACE
bioinformatics
分类号
S682.31 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
蕙兰CfMADS1基因的克隆及其时空表达特性
被引量:
5
3
作者
田云芳
袁秀云
蒋素华
马杰
苏金乐
崔波
机构
郑州
师范学院
生命科学
学院
河南农业大学林
学院
郑州师范学院生物研究所
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015年第7期143-149,154,共8页
基金
河南省科技攻关项目(092102110128)
河南省教育厅科学技术研究重点项目(14A22005)
文摘
【目的】对蕙兰CfMADS1基因cDNA全长进行克隆和时空表达特性研究,为研究成花相关基因的功能提供参考。【方法】以蕙兰萼片cDNA为模板,利用反转录RT-PCR和RACE的方法,克隆获得CfMADS1全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。以蕙兰各时期的器官组织为材料,利用荧光定量PCR进行该基因的时空表达分析。【结果】成功克隆了CfMADS1基因(GenBank登录号为KC148540),其cDNA序列全长1 061bp,开放阅读框长744bp,编码247个氨基酸,分子式为C1 244H2 040N370O377S9。其编码的氨基酸序列与AP1/FUL亚家族中金钗石斛MADS1具有较高的同源性(85.43%),与AP1/FUL转录因子亚家族中的蛋白聚为一类。该基因编码蛋白没有明显的信号肽和跨膜域,极可能位于细胞核内,具有MADS保守域(1-61aa)和相对保守的K区(87-178aa),而且在C末端具有AP1/FUL特征基序(LPPWML),二级结构中α-螺旋所占比例较高(55.63%),三级结构与月季、水稻和水仙MADS1蛋白结构非常相似。该基因在盛花期叶中表达最强烈,花蕾期叶、葶、蕾及营养期叶、盛花期葶中表达较为强烈,子房和营养期根中表达较弱,其余器官组织中表达痕量。【结论】从蕙兰萼片中克隆得到了CfMADS1cDNA全长序列,CfMADS1与蕙兰的成花诱导、花发育以及果实形成有关。
关键词
蕙兰
AP1/FUL-like基因
时空表达
Keywords
Cymbidium f aberi
AP1/ FUL-like gene
spatiotemporal expression
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
蕙兰α微管蛋白基因的克隆与序列分析
4
作者
田云芳
袁秀云
崔波
苏金乐
机构
郑州
师范学院
生命科学系
郑州师范学院生物研究所
河南农业大学林
学院
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2014年第6期123-127,共5页
基金
河南省科技攻关项目(092102110128)
河南省教育厅科学技术研究重点项目(14A220005)
文摘
α微管蛋白(TUA)基因常作为研究其他功能基因表达的内参基因。以TUA作为候选内参基因之一,依据GenBank已经公布的同源TUA基因的核苷酸保守序列,设计简并性引物,以蕙兰花蕾期的花葶为材料,提取总RNA,利用RT-PCR的方法,克隆了4条TUA基因片段。序列分析结果表明,4条TUA基因片段长度均为1 205bp,编码401个氨基酸,具有TUA基因标记位点:Tubulin subunits alpha,beta,and gamma signature特征信号序列(GGGTGSG)。各序列之间同源性高达99.63%,经Blast分析,与水稻同源性可达86%。利用DNAMAN等生物软件推断的氨基酸,与月季、玉米、牛筋草、小麦、看麦娘和水稻TUA基因所编码的氨基酸序列同源性达98%。研究中所得到的4个基因序列是TUA基因的同源片段,依次命名为CfTUA1、CfTUA2、CfTUA3、CfTUA4,GenBank登录号分别为JN177709、JN177710、JN177711、JN177712。
关键词
蕙兰
α微管蛋白基因
克隆
序列分析
Keywords
Cymbidium faberi
TUA gene
cloning
sequence analysis
分类号
S682.31 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高等植物的花发育模型及其基因调控研究进展
田云芳
袁秀云
蒋素华
马杰
崔波
《贵州农业科学》
CAS
北大核心
2014
7
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职称材料
2
蕙兰GAPDH基因的全长克隆及生物信息学分析
田云芳
蒋素华
袁秀云
崔波
《江西农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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下载PDF
职称材料
3
蕙兰CfMADS1基因的克隆及其时空表达特性
田云芳
袁秀云
蒋素华
马杰
苏金乐
崔波
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2015
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
蕙兰α微管蛋白基因的克隆与序列分析
田云芳
袁秀云
崔波
苏金乐
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2014
0
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