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基于网络药理学和细胞实验探索山奈酚治疗阿尔茨海默病的作用机制
1
作者
李慧红
刘嘉
《山西医科大学学报》
CAS
2024年第9期1184-1190,共7页
目的 基于网络药理学和细胞实验探讨山奈酚治疗阿尔茨海默症的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取山奈酚相关靶点,基因表达综合数据库(GEO)获取阿尔茨海默病(GSE5281)的差异表达基因。使用DAVID数据库进行...
目的 基于网络药理学和细胞实验探讨山奈酚治疗阿尔茨海默症的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取山奈酚相关靶点,基因表达综合数据库(GEO)获取阿尔茨海默病(GSE5281)的差异表达基因。使用DAVID数据库进行两者交集靶点的基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Vina实现分子对接。将SH-SY5Y细胞分为对照组、Aβ组和山奈酚组。对照组未经任何处理,Aβ组使用10μmol/L Aβ1-42干预处理,山奈酚组使用10μmol/Aβ1-42处理后再使用10μmol/L山奈酚干预处理。AnnexinⅤ-PI双染色法检测细胞凋亡,实时定量PCR和Western blot检测细胞中钙调蛋白1(CALM1)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体M1(CHRM1)和蛋白磷酸酶3催化亚基α(PPP3CA)的表达水平。结果 共得到山奈酚相关靶点60个,阿尔茨海默病差异表达基因2 155个,山奈酚治疗阿尔茨海默病的潜在作用靶点6个。山奈酚治疗阿尔茨海默病潜在作用靶点的GO功能富集分析主要涉及磷蛋白磷酸酶活性的正向调节,突触后膜电位的调节,对钙离子的反应和G蛋白偶联受体信号通路的生物过程。KEGG通路富集分析主要包括钙信号通路,阿尔茨海默病和神经退行性疾病等。分子对接结果显示,山奈酚与CHRM1,CALM1和PPP3CA的结合能均<-5.0 kcal/mol。与对照组相比,Aβ组细胞凋亡增加(P<0.05);与Aβ组相比,山奈酚组细胞凋亡减少(P<0.05)。与Aβ组相比,山奈酚组细胞中CHRM1,CALM1和PPP3CA的mRNA和蛋白表达显著上调(P<0.05)。结论 山奈酚可能通过调节钙信号通路中的关键基因(CHRM1,CALM1和PPP3CA)改善SH-SY5Y细胞凋亡,从而发挥治疗阿尔茨海默病的作用。
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关键词
山奈酚
阿尔茨海默病
钙信号通路
网络药理学
分子对接
细胞凋亡
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题名
基于网络药理学和细胞实验探索山奈酚治疗阿尔茨海默病的作用机制
1
作者
李慧红
刘嘉
机构
郑州大学
附属
郑州
中心医院
转化医学
中心
郑州大学附属郑州中心医院药学部
出处
《山西医科大学学报》
CAS
2024年第9期1184-1190,共7页
基金
河南省高等学校重点科研项目(23A310025)。
文摘
目的 基于网络药理学和细胞实验探讨山奈酚治疗阿尔茨海默症的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取山奈酚相关靶点,基因表达综合数据库(GEO)获取阿尔茨海默病(GSE5281)的差异表达基因。使用DAVID数据库进行两者交集靶点的基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Vina实现分子对接。将SH-SY5Y细胞分为对照组、Aβ组和山奈酚组。对照组未经任何处理,Aβ组使用10μmol/L Aβ1-42干预处理,山奈酚组使用10μmol/Aβ1-42处理后再使用10μmol/L山奈酚干预处理。AnnexinⅤ-PI双染色法检测细胞凋亡,实时定量PCR和Western blot检测细胞中钙调蛋白1(CALM1)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体M1(CHRM1)和蛋白磷酸酶3催化亚基α(PPP3CA)的表达水平。结果 共得到山奈酚相关靶点60个,阿尔茨海默病差异表达基因2 155个,山奈酚治疗阿尔茨海默病的潜在作用靶点6个。山奈酚治疗阿尔茨海默病潜在作用靶点的GO功能富集分析主要涉及磷蛋白磷酸酶活性的正向调节,突触后膜电位的调节,对钙离子的反应和G蛋白偶联受体信号通路的生物过程。KEGG通路富集分析主要包括钙信号通路,阿尔茨海默病和神经退行性疾病等。分子对接结果显示,山奈酚与CHRM1,CALM1和PPP3CA的结合能均<-5.0 kcal/mol。与对照组相比,Aβ组细胞凋亡增加(P<0.05);与Aβ组相比,山奈酚组细胞凋亡减少(P<0.05)。与Aβ组相比,山奈酚组细胞中CHRM1,CALM1和PPP3CA的mRNA和蛋白表达显著上调(P<0.05)。结论 山奈酚可能通过调节钙信号通路中的关键基因(CHRM1,CALM1和PPP3CA)改善SH-SY5Y细胞凋亡,从而发挥治疗阿尔茨海默病的作用。
关键词
山奈酚
阿尔茨海默病
钙信号通路
网络药理学
分子对接
细胞凋亡
Keywords
kaempferol
Alzheimer's disease
calcium signaling pathway
network pharmacology
molecular docking
apoptosis
分类号
R741 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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出处
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1
基于网络药理学和细胞实验探索山奈酚治疗阿尔茨海默病的作用机制
李慧红
刘嘉
《山西医科大学学报》
CAS
2024
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