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探索生命极限的模式生物——南极土壤自由生活线虫Plectus murrayi及其环境适应性特征 被引量:1
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作者 薛夏 王中华 +1 位作者 李绍建 姜瑛 《土壤》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期925-934,共10页
针对土壤自由生活线虫的环境适应性及其生态功能研究一直是土壤动物学和生态学的核心内容之一。前期研究表明南极土壤自由生活线虫能够在极端干旱的土壤中生存,尤其是线虫的优势种群之一——Plectus murrayi,在生理生态水平上均表现出... 针对土壤自由生活线虫的环境适应性及其生态功能研究一直是土壤动物学和生态学的核心内容之一。前期研究表明南极土壤自由生活线虫能够在极端干旱的土壤中生存,尤其是线虫的优势种群之一——Plectus murrayi,在生理生态水平上均表现出独特的适应性。土壤自由生活线虫Plectus murrayi是仅在南极麦克默多山谷(McMurdo Dry Valleys,MDV)发现的主要陆生生物之一,目前已在多领域成为研究极端环境下生态学以及生物学的模式生物。本文旨在综述其系统发育、分布、生命周期和实验室发育的最新研究,以及其在遗传水平上的耐冷冻和耐干燥性,结合南极沙漠土壤的特殊生态系统,阐述其对于探索生命极限的意义。基于P.murrayi在南极麦克默多山谷土壤的生境分布,与其他南极自由生活线虫相比,P.murrayi喜欢相对较高的湿度和较低的盐度土壤生境。由于全球气候变暖,南极麦克默多山谷的温度和湿度不断增加,P.murrayi极可能成为南极沙漠中的主要陆生动物。通过对P.murrayi的研究,能够探索其适应和功能基因之间的新联系,这些基因在理解细胞对极端微环境的抗逆性方面有着至关重要的作用,具有长远的农业以及医学利用价值。未来对南极麦克默多山谷土壤环境压力的短期和长期响应的研究,有助于揭示细胞对环境干旱、寒冷的耐受和修复作用,探明生物进化与生态系统复杂性之间的关系,以及不同微环境在塑造更复杂系统群落中的作用。 展开更多
关键词 南极麦克默多山谷沙漠 南极自由生活线虫 生态系统 干旱极寒
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基于生物信息学分析CSRP1基因在胃癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 被引量:2
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作者 郭晨旭 李发展 +3 位作者 刘斌 温慧娟 米阳 郑鹏远 《河南医学研究》 CAS 2022年第14期2506-2511,共6页
目的基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库探讨CSRP1基因在胃癌中的表达及其与预后的相关性,并且分析CSRP1与免疫细胞浸润的关系。方法采用生物信息学方法分析TCGA数据库中CSRP1在不同病理分期胃癌组织中的表达差异,使用Kaplan-Meier生存曲... 目的基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库探讨CSRP1基因在胃癌中的表达及其与预后的相关性,并且分析CSRP1与免疫细胞浸润的关系。方法采用生物信息学方法分析TCGA数据库中CSRP1在不同病理分期胃癌组织中的表达差异,使用Kaplan-Meier生存曲线分析其与胃癌患者预后的关系;将胃癌组织中与CSRP1共表达的基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并在STRING数据库中对其编码的蛋白质进行蛋白相互作用分析;并分析CSRP1与免疫细胞的相关性。结果CSRP1高表达胃癌患者的总体生存期较低表达患者短;随着肿瘤浸润程度的增加,T_(2)~T_(4)期胃癌患者CSRP1的表达增加,差异有统计学意义(P<0.05)。单因素和多因素Cox分析显示,CSRP1、年龄、肿瘤浸润程度、淋巴结转移可作为胃癌独立的预后指标;CSRP1表达水平与CD4^(+)T细胞、辅助T细胞、树突状细胞以及自然杀伤细胞的免疫浸润水平呈负相关(P<0.05)。结论CSRP1高表达胃癌患者的预后较差,可能和CSRP1影响肿瘤微环境中的免疫细胞浸润有关,表明CSRP1可能成为胃癌潜在的免疫治疗靶点。 展开更多
关键词 CSRP1 胃癌 肿瘤基因组图谱 免疫浸润 生存分析
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