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孟德尔随机化分析乳糜泻与自身免疫性甲状腺疾病的因果关系
1
作者
闫军浩
郭晓磊
+2 位作者
罗昭锋
唐坚
王争
《上海交通大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第6期766-773,共8页
目的·通过两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探讨乳糜泻(celiac disease,CeD)与桥本甲状腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT)及格雷夫斯病(Graves disease,GD)之间的双向因果关系。方法·从公开的全基因组关联研...
目的·通过两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探讨乳糜泻(celiac disease,CeD)与桥本甲状腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT)及格雷夫斯病(Graves disease,GD)之间的双向因果关系。方法·从公开的全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)数据库中提取与CeD、HT和GD相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据,作为工具变量。以逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)作为主要分析方法,同时将MR-Egger法、加权中位数法(weighted median,WME)、加权模式法(weighted mode,WMO)3种方法的结果作为参考,评估CeD与HT及GD之间的因果关联。使用不同的GWAS数据进行重复分析,验证结果的稳健性。通过Cochran's Q检验判断异质性,通过MR-Egger截距检验评估多效性,采用留一法(leave-one-out)分析单个SNP对结果的影响程度。结果·IVW分析结果表明,遗传预测的CeD显著增加HT[试验组:OR=1.186(95%CI 1.114~1.262),P<0.001;验证组:OR=1.218(95%CI 1.090~1.361),P<0.001]和GD[试验组:OR=1.214(95%CI 1.155~1.276),P<0.001;验证组:OR=1.273(95%CI 1.161~1.396),P<0.001]的风险。反向MR分析中,HT对CeD不存在因果关系,而遗传预测的GD则显著增加CeD[试验组:OR=1.259(95%CI 1.006~1.576),P=0.044;验证组:OR=1.387(95%CI 1.233~1.560),P<0.001]的风险。敏感性分析表明,结果未受水平多效性的影响。结论·CeD可能增加HT和GD的发病风险,而GD可能增加CeD的发病风险,但HT对CeD不存在影响。
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关键词
乳糜泻
桥本甲状腺炎
格雷夫斯病
孟德尔随机化
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职称材料
GPR176 mRNA与胃癌预后及免疫治疗反应关系的生物信息学分析
2
作者
朱怡臻
王迎
汤有才
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2024年第2期181-186,共6页
目的:基于生物信息学技术探讨G蛋白偶联受体176(GPR176)在胃癌中的表达水平,挖掘其预测胃癌预后和免疫检查点阻断剂应答的潜力。方法:利用R软件比较TCGA-STAD和GEO数据集中胃癌组织和正常胃组织中GPR176 mRNA的表达,调取Human Protein A...
目的:基于生物信息学技术探讨G蛋白偶联受体176(GPR176)在胃癌中的表达水平,挖掘其预测胃癌预后和免疫检查点阻断剂应答的潜力。方法:利用R软件比较TCGA-STAD和GEO数据集中胃癌组织和正常胃组织中GPR176 mRNA的表达,调取Human Protein Atlas中免疫组化图谱,比较胃癌组织和正常胃组织中GPR176蛋白的表达。利用TCGA-STAD数据集分析不同临床特征胃癌患者GPR176 mRNA表达的差异。利用TCGA-STAD和GEO数据集分析GPR176 mRNA表达水平预测胃癌预后及免疫检查点阻断剂应答的价值。结果:与正常胃组织比较,胃癌组织中GPR176 mRNA和蛋白表达水平均上调,且与胃癌患者的不良临床特征有关。GPR176 mRNA高表达患者总生存期短于低表达者;ROC曲线分析表明,GPR176 mRNA对胃癌1、3、5 a生存率具有较高的预测价值。GPR176 mRNA高表达患者免疫细胞(未激活NK细胞和M2巨噬细胞)的浸润丰度高,免疫表型评分低。结论:GPR176在胃癌组织中高表达,可作为潜在的预测胃癌预后和免疫检查点阻断剂应答的新型分子标志物。
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关键词
G蛋白偶联受体176
胃癌
预后
免疫检查点阻断剂
生物信息学分析
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职称材料
题名
孟德尔随机化分析乳糜泻与自身免疫性甲状腺疾病的因果关系
1
作者
闫军浩
郭晓磊
罗昭锋
唐坚
王争
机构
郑州大学第五附属医院胃肠甲状腺外科
上海交通
大学
医学院
附属
仁济
医院
胃肠
外科
出处
《上海交通大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第6期766-773,共8页
基金
国家自然科学基金(82270552)。
文摘
目的·通过两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法探讨乳糜泻(celiac disease,CeD)与桥本甲状腺炎(Hashimoto thyroiditis,HT)及格雷夫斯病(Graves disease,GD)之间的双向因果关系。方法·从公开的全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)数据库中提取与CeD、HT和GD相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)数据,作为工具变量。以逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)作为主要分析方法,同时将MR-Egger法、加权中位数法(weighted median,WME)、加权模式法(weighted mode,WMO)3种方法的结果作为参考,评估CeD与HT及GD之间的因果关联。使用不同的GWAS数据进行重复分析,验证结果的稳健性。通过Cochran's Q检验判断异质性,通过MR-Egger截距检验评估多效性,采用留一法(leave-one-out)分析单个SNP对结果的影响程度。结果·IVW分析结果表明,遗传预测的CeD显著增加HT[试验组:OR=1.186(95%CI 1.114~1.262),P<0.001;验证组:OR=1.218(95%CI 1.090~1.361),P<0.001]和GD[试验组:OR=1.214(95%CI 1.155~1.276),P<0.001;验证组:OR=1.273(95%CI 1.161~1.396),P<0.001]的风险。反向MR分析中,HT对CeD不存在因果关系,而遗传预测的GD则显著增加CeD[试验组:OR=1.259(95%CI 1.006~1.576),P=0.044;验证组:OR=1.387(95%CI 1.233~1.560),P<0.001]的风险。敏感性分析表明,结果未受水平多效性的影响。结论·CeD可能增加HT和GD的发病风险,而GD可能增加CeD的发病风险,但HT对CeD不存在影响。
关键词
乳糜泻
桥本甲状腺炎
格雷夫斯病
孟德尔随机化
Keywords
celiac disease(CeD)
Hashimoto thyroiditis(HT)
Graves disease(GD)
Mendelian randomization(MR)
分类号
R574.5 [医药卫生—消化系统]
R581 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
GPR176 mRNA与胃癌预后及免疫治疗反应关系的生物信息学分析
2
作者
朱怡臻
王迎
汤有才
机构
郑州大学第五附属医院胃肠甲状腺外科
郑州大学第五附属医院
输血科
郑州大学第五附属医院
儿科
河南省康复医学重点实验室
河南省慢性肝损伤国际联合实验室
郑州
市代谢相关脂肪性肝病重点实验室
河南省慢性肝损伤杰出外籍科学家工作室
出处
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2024年第2期181-186,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(NSFC31471330)
国家重点研发计划(2020YFC2009006)
郑州大学学科重点专项(XKZDQY202001)。
文摘
目的:基于生物信息学技术探讨G蛋白偶联受体176(GPR176)在胃癌中的表达水平,挖掘其预测胃癌预后和免疫检查点阻断剂应答的潜力。方法:利用R软件比较TCGA-STAD和GEO数据集中胃癌组织和正常胃组织中GPR176 mRNA的表达,调取Human Protein Atlas中免疫组化图谱,比较胃癌组织和正常胃组织中GPR176蛋白的表达。利用TCGA-STAD数据集分析不同临床特征胃癌患者GPR176 mRNA表达的差异。利用TCGA-STAD和GEO数据集分析GPR176 mRNA表达水平预测胃癌预后及免疫检查点阻断剂应答的价值。结果:与正常胃组织比较,胃癌组织中GPR176 mRNA和蛋白表达水平均上调,且与胃癌患者的不良临床特征有关。GPR176 mRNA高表达患者总生存期短于低表达者;ROC曲线分析表明,GPR176 mRNA对胃癌1、3、5 a生存率具有较高的预测价值。GPR176 mRNA高表达患者免疫细胞(未激活NK细胞和M2巨噬细胞)的浸润丰度高,免疫表型评分低。结论:GPR176在胃癌组织中高表达,可作为潜在的预测胃癌预后和免疫检查点阻断剂应答的新型分子标志物。
关键词
G蛋白偶联受体176
胃癌
预后
免疫检查点阻断剂
生物信息学分析
Keywords
GPR176
gastric cancer
prognosis
immune checkpoint blocker
bioinformatics analysis
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
孟德尔随机化分析乳糜泻与自身免疫性甲状腺疾病的因果关系
闫军浩
郭晓磊
罗昭锋
唐坚
王争
《上海交通大学学报(医学版)》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
GPR176 mRNA与胃癌预后及免疫治疗反应关系的生物信息学分析
朱怡臻
王迎
汤有才
《郑州大学学报（医学版）》
CAS
北大核心
2024
0
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