郑州市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性分布 被引量：26

1

作者 崔会玲 鲁衍强 +4 位作者 马少杰 薛琰 王婷 段歌红 杨琦 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期710-714,共5页

目的:探讨郑州市汉族女性5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因多态性的频率特征。方法:以郑州市1 253例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T,A1298C和MTRR A66G的基因分型。分析基因多态性的频率特征,并... 目的:探讨郑州市汉族女性5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)、甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)基因多态性的频率特征。方法:以郑州市1 253例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T,A1298C和MTRR A66G的基因分型。分析基因多态性的频率特征,并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较。结果:郑州市汉族女性的MTHFR 1298CC纯合突变基因型频率(1.3%)低于湘潭(4.8%)、延边(3.8%)、镇江(3.5%)、荆州(3.2%)、昆明(2.7%)、德阳(6.3%)、惠州(7.2%)和乌鲁木齐(3.4%)等地(均P<0.05),等位基因与烟台、延边、乌鲁木齐、镇江、荆州、昆明、德州、湘潭、惠州等地差异有统计学意义(均P<0.05)。MTRR 66GG纯合突变基因型频率(5.4%)低于德阳(8.2%)(P<0.01),等位基因与德阳差异有统计学意义(P<0.05)。结论:郑州市汉族女性MTHFR A1298C和MTRR A66G基因多态性频率不同于其他地区,具有地域特异性。 展开更多

关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性

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子痫前期风险预测基因的筛选

2

作者 刘惠娜 王一鸣 +5 位作者 杨明磊 沈岩 袁文静 陈彦杞 石如婷 马军 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2024年第6期816-820,共5页

目的:探索对子痫前期(PE)有预测价值的基因。方法:应用高通量测序技术检测3例PE及3例正常孕妇脐带组织来源的间充质干细胞(MSC)的基因表达谱,利用DESeq2进行差异性分析,进行GO、KEGG通路分析,结合相关文献,筛选出关键基因。收集29例PE... 目的:探索对子痫前期(PE)有预测价值的基因。方法:应用高通量测序技术检测3例PE及3例正常孕妇脐带组织来源的间充质干细胞(MSC)的基因表达谱,利用DESeq2进行差异性分析,进行GO、KEGG通路分析,结合相关文献,筛选出关键基因。收集29例PE和28名正常孕妇的静脉血标本,应用RT-qPCR技术检测关键基因的表达情况。结果:共检出1130个差异表达基因,其中458个高表达,672个低表达;共筛选出3个关键基因[CXC基序趋化因子配体2(CXCL2)、糖蛋白非转移性黑色素蛋白B(GPNMB)、胸苷磷酸化酶(TYMP)],均为表达下调。RT-qPCR结果显示3个基因在PE孕妇静脉血中的表达均低于正常孕妇(P<0.05)。结论:CXCL2、GPNMB和TYMP或可作为预测PE的新分子标志物。 展开更多

关键词 子痫前期 风险预测基因 CXCL2 GPNMB TYMP

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基于RNA-seq的杜氏盐藻全转录组测序与分析 被引量：7

3

作者 朱立强 李庆华 +3 位作者 张彦婷 朱相展 关方霞 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2016年第3期289-293,共5页

目的:利用RNA-seq技术对杜氏盐藻细胞的全部转录本进行测序、功能分析。方法:提取杜氏盐藻总RNA,反转录得c DNA,在Illumina平台上进行测序,经拼接、组装、聚类后获得全部unigene,并将所得unigene与数据库比对,对其进行功能注释和分类。... 目的:利用RNA-seq技术对杜氏盐藻细胞的全部转录本进行测序、功能分析。方法:提取杜氏盐藻总RNA,反转录得c DNA,在Illumina平台上进行测序,经拼接、组装、聚类后获得全部unigene,并将所得unigene与数据库比对,对其进行功能注释和分类。结果与结论:共得到197 295个unigene,将获得的unigene与NR、SWISSPROT、CDD、KEGG和TREMBI数据库进行比对,有89 800个unigene获得注释。其中95 767个unigene映射到GO的不同功能节点;5 710个unigene获得COG注释,并分为22个功能分类;9 497个unigene获得了KEGG注释,映射到282条信号通路。所得杜氏盐藻的转录组信息为今后相关研究与应用提供了丰富的资源和线索。 展开更多

关键词 杜氏盐藻 转录组 RNA-SEQ

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食管鳞癌和腺癌转录组差异基因综合分析 被引量：4

4

作者 李雨濛 马佳康 +5 位作者 任凯凯 李南 王健 孙金旗 张亚丽 马军 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第7期715-719,共5页

目的食管鳞癌和腺癌在分组特征方面有多大的差异目前并不明确。文中旨在分析食管鳞癌、食管腺癌转录组分子特征的差异性。方法下载TCGA数据库中食管鳞癌和腺癌转录组数据,筛选癌及癌旁组织差异表达的RNA(mRNA、lncRNA、miRNA),构建食管... 目的食管鳞癌和腺癌在分组特征方面有多大的差异目前并不明确。文中旨在分析食管鳞癌、食管腺癌转录组分子特征的差异性。方法下载TCGA数据库中食管鳞癌和腺癌转录组数据,筛选癌及癌旁组织差异表达的RNA(mRNA、lncRNA、miRNA),构建食管鳞癌和腺癌相关的竞争性内源RNA(ceRNA)网络,对重要miRNA进行靶基因预测及GO、KEGG分析,利用生存分析显示食管鳞癌和腺癌共有差异基因。结果ceRNA网络显示:PVT1、LINC00524、miR-204、miR-383、HOXC8、NTRK2等在食管鳞癌和腺癌中均起重要调控作用。miR-204-5p经miRWalk共预测到13227个调控靶基因,在targetscan,miRDB数据库共筛选出232个靶基因。GO功能分析显示38个富集,主要参与细胞-基质粘附的调节、细胞膜投射形态发生、β-连环蛋白结合等过程。KEGG分析显示4个相关通路:Hedgehog信号通路、寿命调节通路、雌激素信号通路、松弛素信号通路。生存分析结果显示,食管鳞癌中与患者生存相关的差异lncRNA包括LINC00261、MLIP-IT1、LINC00504,差异miRNA包括hsa-mir-338,未发现与生存相关的mRNA。食管腺癌中与生存相关的差异lncRNA包括CYP1B1-AS1、HOTAIR,差异mRNA包括IL11、NTRK2、ANGPT2、PBK。食管鳞癌和腺癌共有的差异lncRNA上调占15.4%(150个),下调占26.8%(158个);miRNA上调占24.2%(22个),下调占27.6%(8个);mRNA上调占20.5%(234个),下调占23.7%(418个)。结论食管鳞癌和腺癌存在明显的分子差异,lncRNA、miRNA及mRNA有望为食管癌的治疗和预后预测提供新的靶点与分子标志物。 展开更多

关键词 食管鳞癌 食管腺癌 转录组 分子特征 ceRNA网络 生存分析

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杜氏盐藻S腺苷高半胱氨酸水解酶酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活和毒性检测 被引量：2

5

作者 柴丹丹 李庆华 +4 位作者 阎赟梦 毛丽红 李靓 朱立强 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2012年第1期16-20,共5页

目的:构建杜氏盐藻S腺苷高半胱氨酸水解酶(SAHH)的酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-SAHH,并检测其对酵母细胞的毒性和自激活作用。方法:应用RT-PCR扩增杜氏盐藻的SAHHcDNA,测序分析后与酵母双杂交诱饵载体pGBKT7连接,构建诱饵载体pGBKT7-SAHH... 目的:构建杜氏盐藻S腺苷高半胱氨酸水解酶(SAHH)的酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-SAHH,并检测其对酵母细胞的毒性和自激活作用。方法:应用RT-PCR扩增杜氏盐藻的SAHHcDNA,测序分析后与酵母双杂交诱饵载体pGBKT7连接,构建诱饵载体pGBKT7-SAHH。用PEG/LiAc法将诱饵载体转入AH109和Y187酵母中,通过表型筛选检测诱饵蛋白对酵母有无毒性和自激活作用。结果:成功构建了诱饵载体pGBKT7-SAHH并成功转化到酵母细胞AH109和Y187中,表达的融合蛋白对宿主酵母细胞无毒性。在AH109和Y187酵母细胞中诱饵载体均未激活报告基因HIS3和ADE2,但是激活了报告基因MEL1。结论:诱饵载体pGBKT7-SAHH可用酵母双杂交方法筛选与SAHH相互作用的蛋白。 展开更多

关键词 S腺苷高半胱氨酸水解酶 酵母双杂交 诱饵载体 自激活 杜氏盐藻

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胃腺癌中ceRNA网络的构建和miR-204-5p、HOXC8基因的表达及其相关性检测 被引量：3

6

作者 王蕾 任凯凯 +5 位作者 马佳康 陈小华 张萌迪 李丹丹 李晓娜 马军 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2019年第5期737-740,共4页

目的:构建胃腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)网络,并观察miR-204-5p和HOXC8 mRNA之间的相关性。方法:利用生物信息学方法和TCGA转录组数据库筛选胃腺癌差异基因,构建ceRNA网络,检测了miR-204-5p和HOXC8 mRNA在胃腺癌组织和SGC7901细胞株中的表... 目的:构建胃腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)网络,并观察miR-204-5p和HOXC8 mRNA之间的相关性。方法:利用生物信息学方法和TCGA转录组数据库筛选胃腺癌差异基因,构建ceRNA网络,检测了miR-204-5p和HOXC8 mRNA在胃腺癌组织和SGC7901细胞株中的表达,并分析了两基因间的相互关系。结果:成功构建胃腺癌ceRNA网络,miR-204-5p是重要节点基因,并预测到其靶基因HOXC8;在32例胃腺癌中检测到miR-204-5p低表达,HOXC8高表达,两者呈负相关关系;上调胃腺癌SGC7901细胞中miR-204-5p的表达可以抑制HOXC8 mRNA的表达。结论:miR-204-5p和HOXC8可能是潜在的胃腺癌诊断指标,两者可能存在ceRNA调控关系。 展开更多

关键词 胃腺癌 竞争性内源RNA网络 miR-204-5p HOXC8

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四项指标联合检测在急性脑梗死患者诊断中的临床效果分析 被引量：3

7

作者 高娅 王婷 《世界中医药》 CAS 2017年第A01期511-511,共1页

目的探讨四项指标［血清胱抑素C、脂蛋白(a)、血栓前体蛋白、超敏C反应蛋白］联合检测在诊断急性脑梗死中的应用效果。方法选取我院于2014年1月~2016年7月间收治的急性脑梗死患者102例，将其作为观察组，随机选取同期收治的102例非急性... 目的探讨四项指标［血清胱抑素C、脂蛋白(a)、血栓前体蛋白、超敏C反应蛋白］联合检测在诊断急性脑梗死中的应用效果。方法选取我院于2014年1月~2016年7月间收治的急性脑梗死患者102例，将其作为观察组，随机选取同期收治的102例非急性脑梗死患者作为对照组，比较2组患者的血清胱抑素C(CysC)、脂蛋白(a)［LP(a)］、血栓前体蛋白(TpP)、超敏C反应蛋白(hs-CRP)四项指标。结果①观察组的LP(a)、CysC、hs-CRP、TpP水平均高于对照组，对比具有统计学意义(P<0.05)；②在轻度、中度、重度急性脑梗死患者中，轻度患者的四项指标水平显著低于其他2组(P<0.05)。结论TpP、CysC、LP(a)、hs-CRP四项指标检测能为急性脑梗死诊断提供依据，尽早确诊患者病情。 展开更多

关键词 急性脑梗死 诊断 超敏C反应蛋白 血清胱抑素C

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Smac过表达对食管鳞癌细胞Warburg效应和细胞凋亡的影响 被引量：1

8

作者 朱立强 张乐 +4 位作者 李庆华 张彦婷 张璐玉 刘腾飞 关方霞 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2019年第6期789-793,共5页

目的:探究Smac过表达对食管鳞癌细胞Warburg效应和细胞凋亡的影响。方法:以含Smac过表达载体的慢病毒感染食管鳞癌细胞EC1和Eca109(Smac过表达组),以感染含空载体的慢病毒为阴性对照,以未感染细胞为空白对照。采用Western blot法检测3... 目的:探究Smac过表达对食管鳞癌细胞Warburg效应和细胞凋亡的影响。方法:以含Smac过表达载体的慢病毒感染食管鳞癌细胞EC1和Eca109(Smac过表达组),以感染含空载体的慢病毒为阴性对照,以未感染细胞为空白对照。采用Western blot法检测3组细胞Smac蛋白的表达情况。用过氧化氢刺激Smac过表达组和阴性对照组细胞,利用线粒体膜电位检测试剂盒和Annexin V-FITC/PI双染法检测细胞线粒体膜电位和细胞凋亡情况,并用Western blot法检测细胞中凋亡信号通路相关蛋白[细胞色素C(Cyt-C)、Bcl-2、Caspase-3前体]以及Warburg效应关键蛋白[己糖激酶Ⅱ(HK2)和乳酸脱氢酶(LDH)]的表达。结果:EC1和Eca109 Smac过表达组Smac蛋白表达水平升高,提示成功构建了Smac过表达细胞株。经过氧化氢刺激后,与阴性对照组相比,Smac过表达组HK2和LDH表达水平下降,细胞线粒体膜电位降低,细胞凋亡率升高,Cyt-C的表达水平升高,Bcl-2和Caspase-3前体蛋白的表达水平下降(P<0.05)。结论:氧化应激刺激下,Smac过表达可抑制食管鳞癌细胞的Warburg效应,促进食管鳞癌细胞凋亡。 展开更多

关键词 SMAC蛋白 食管鳞癌 EC1细胞 ECA109细胞 Warburg效应 细胞凋亡

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酵母双杂交技术筛选杜氏盐藻cDNA文库中与S-腺苷高半胱氨酸水解酶相互作用的蛋白

9

作者 李庆华 张彦婷 +3 位作者 朱立强 柴丹丹 关方霞 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2016年第1期5-9,共5页

目的:应用酵母双杂交技术筛选杜氏盐藻c DNA文库中能与S-腺苷高半胱氨酸水解酶(ds SAHH)相互作用的蛋白。方法:将构建好的p GBKT7-ds SAHH诱饵载体转化至酵母细胞Y187,与转化有杜氏盐藻c DNA文库的酵母细胞AH109杂交,从杜氏盐藻c DNA文... 目的:应用酵母双杂交技术筛选杜氏盐藻c DNA文库中能与S-腺苷高半胱氨酸水解酶(ds SAHH)相互作用的蛋白。方法:将构建好的p GBKT7-ds SAHH诱饵载体转化至酵母细胞Y187,与转化有杜氏盐藻c DNA文库的酵母细胞AH109杂交,从杜氏盐藻c DNA文库中筛选出能与ds SAHH相互作用的蛋白质。扩增所得基因片段全长,并在原核内表达该融合蛋白。随后采用Far-western blot、His pull-down及免疫共沉淀方法验证ds SAHH与目的蛋白在体内、外的相互作用。结果:以ds SAHH为诱饵筛选出3个阳性克隆,扩增得到dsRACK1、ds Met AP1和dse EF1α3个新基因。His pull-down和免疫共沉淀体内外实验证实dsRACK1能与ds SAHH相互作用。结论:dsRACK1是ds SAHH的相互作用蛋白。 展开更多

关键词 S-腺苷高半胱氨酸水解酶 酵母双杂交 蛋白相互作用 免疫共沉淀

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慢性阻塞性肺疾病大鼠气道炎症细胞及黏蛋白检测

10

作者 何燕霞 巨春荣 +2 位作者 宋改芳 王俊萍 李良臣 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2007年第1期123-126,共4页

目的:制备大鼠慢性阻塞性肺疾病(COPD)模型,对支气管肺泡灌洗液(BALF)进行细胞学检查,并观察黏蛋白(Mucin5AC)的表达。方法:20只Wistar大鼠随机均分为健康对照组和COPD组。以气管内注射药物和吸烟方法制备COPD模型,6周后收集BALF进行细... 目的:制备大鼠慢性阻塞性肺疾病(COPD)模型,对支气管肺泡灌洗液(BALF)进行细胞学检查,并观察黏蛋白(Mucin5AC)的表达。方法:20只Wistar大鼠随机均分为健康对照组和COPD组。以气管内注射药物和吸烟方法制备COPD模型,6周后收集BALF进行细胞学检查,以免疫组化方法观察呼吸道杯状细胞肥大情况及Mu-cin5AC的表达。结果:①BALF检查:健康对照组中性粒细胞数为(17.58±3.72)×106L-1,COPD组为(251.10±42.76)×106L-1,2组差异有统计学意义。②气道炎症病理学评分:健康对照组为(18.56±2.46)分,COPD组为(69.30±4.99)分,2组差异有统计学意义。③肺泡腔直径:健康对照组为(47.22±12.95)μm,COPD组为(92.58±4.32)μm,2组差异有统计学意义。④杯状细胞化生指数:健康对照组为(5.12±3.07)个/mm2,COPD组为(51.20±9.23)个/mm2,2组差异有统计学意义;⑤Mucin5AC阳性染色面积:健康对照组为(3.12±2.60)%,COPD组为(34.50±6.52)%,差异有统计学意义。BALF中的中性粒细胞计数与气道炎症病理学评分呈正相关。结论:多种炎症细胞参与了COPD发生及发展。 展开更多

关键词 慢性阻塞性肺疾病 大鼠 中性粒细胞 黏蛋白 杯状细胞

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猪等孢球虫感染仔猪血液生理生化指标动态变化

11

作者 宁长申 王芳 +5 位作者 张龙现 崔会玲 朱静静 姚雷 菅复春 李祥瑞 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期306-312,共7页

应用纯种猪等孢球虫（Isospora suis）孢子化卵囊人工感染9头6日龄仔猪，检测了感染前1d和感染后1，3，6，9，11d时血液生理生化指标、结果表明，仔猪感染I．suis后，白细胞数在感染后1d开始增多，11d达最高；红细胞在感染后3d开始减少... 应用纯种猪等孢球虫（Isospora suis）孢子化卵囊人工感染9头6日龄仔猪，检测了感染前1d和感染后1，3，6，9，11d时血液生理生化指标、结果表明，仔猪感染I．suis后，白细胞数在感染后1d开始增多，11d达最高；红细胞在感染后3d开始减少，9d最低，11d时恢复到感染前水平．血清丙氨酸氨基转移酶活性逐渐升高，感染后11d时达最高值；天冬氨酸转氨酶感染后6d升高并达到最高；感染后1d碱性磷酸酶活性下降，11d最低；血清乳酸脱氢酶、γ-谷氨酰转肽酶、α-羟丁酸脱氢酶活性均呈下降趋势，但无显著差异、感染后1d时白蛋白含量下降，至11d恢复到正常水平；球蛋白含量持续下降，但差异不显著．血清葡萄糖含量升高但无显著变化．感染后1～3d时血清尿素氮含量降低，之后逐渐升高，至11d时达最高；尿酸在感染后1～3d升高，之后持续下降，至11d时最低、血清总胆固醇持续降低；甘油三酯在感染后1～9d升高，11d时恢复到感染前水平．血清K^＋含量在感染后持续降低，但差异不显著．嗜中性白细胞，单核细胞，血红蛋白含量，红细胞压积，总蛋白含量，Na^＋，Cl^-，Ga^2＋，Mg^2＋含量均无明显变化． 展开更多

关键词 猪等孢球虫 生理生化指标 仔猪

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TGF-β1通过调节HMGA1表达抑制人滋养层HTR-8/SVneo细胞侵袭 被引量：6

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作者 刘昕 李鹏云 +4 位作者 高峻峻 李爱萍 冷茂东 张琳琳 张展 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第10期1584-1589,共6页

目的研究HMGA1在转化生长因子β1(TGF-β1)抑制人滋养层HTR-8/SVneo细胞侵袭过程中的作用。方法①培养HTR-8/SVneo细胞株,以5 ng/ml TGF-β1作用0、6、12、24、36 h,采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)及Western blot法检测HMGA1的表... 目的研究HMGA1在转化生长因子β1(TGF-β1)抑制人滋养层HTR-8/SVneo细胞侵袭过程中的作用。方法①培养HTR-8/SVneo细胞株,以5 ng/ml TGF-β1作用0、6、12、24、36 h,采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)及Western blot法检测HMGA1的表达情况。②培养HTR-8/SVneo细胞株,先经PI3K/AKT信号通路抑制剂Wortmannin(0.1μmol/L)预处理或不处理1 h,再用5 ng/ml TGF-β1处理或不处理24 h,采用Real-time PCR及Western blot法检测HMGA1、P-Akt、Akt的表达情况。③培养HTR-8/SVneo细胞株,按分组转染沉默HMGA1的siRNA和TGF-β1 5 ng/ml处理或不处理24 h,使用Transwell侵袭实验检测各组侵袭力的变化。结果各时间点5 ng/ml浓度的TGF-β1均能够促进HTR-8/SVneo细胞表达HMGA1,而处理24 h后HMGA1的表达量最高。5 ng/ml的TGF-β1处理HTR-8/SVneo细胞24 h后,TGF-β1明显上调了Akt、P-Akt、HMGA1的蛋白表达水平,而加入PI3K/AKT通路抑制剂Wortmannin(0.1μmol/L)后,TGF-β1对Akt、P-Akt、HMGA1蛋白表达水平的上调作用受到抑制(P<0.05)。Transwell实验结果表明,与TGF-β1 5 ng/ml处理组比较,TGF-β1 5 ng/ml+siHMGA1组侵袭细胞数明显增多(P<0.05)。结论TGF-β1上调HTR-8/SVneo细胞中HMGA1表达,可能通过PI3K/AKT信号通路。TGF-β1通过调节HMGA1表达抑制人滋养层HTR-8/SVneo细胞侵袭。 展开更多

关键词 高迁移率族蛋白A1 HTR-8/SVneo TGF-Β1

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DZNep对裸鼠食管鳞癌移植瘤生长的抑制作用 被引量：2

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作者 张乐 李庆华 +3 位作者 杨璐 朱立强 张彦婷 关方霞 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2018年第1期17-21,共5页

目的:探讨EZH2抑制剂DZNep对裸鼠Eca109细胞移植瘤生长及mTOR/p70S6K信号通路的影响。方法:将Eca109细胞接种于15只裸鼠右侧背部皮下构建裸鼠移植瘤模型后分为3组,每组5只,其中2组分别腹腔注射5-氟尿嘧啶(5-FU)、DZNep治疗2周,另外1组... 目的:探讨EZH2抑制剂DZNep对裸鼠Eca109细胞移植瘤生长及mTOR/p70S6K信号通路的影响。方法:将Eca109细胞接种于15只裸鼠右侧背部皮下构建裸鼠移植瘤模型后分为3组,每组5只,其中2组分别腹腔注射5-氟尿嘧啶(5-FU)、DZNep治疗2周,另外1组腹腔注射生理盐水作为对照组。观察肿瘤生长情况,采用Western blot检测肿瘤组织中EZH2、SAHH、组蛋白甲基化相关蛋白及mTOR/p70S6K信号通路相关蛋白、Caspase-3、E-cadherin的表达情况,并通过TUNEL法检测肿瘤组织中细胞的凋亡,计算细胞凋亡率。结果:DZNep组肿瘤块质量小于对照组(P<0.05)。与对照组比较,DZNep组肿瘤组织中Caspase-3和E-cadherin表达水平增高,细胞凋亡率升高(P<0.05)。另外,与对照组相比,DZNep组H3K27me3表达降低,PTEN表达升高,mTOR和p-p70S6K表达均下降(P<0.05)。结论:DZNep可抑制食管鳞癌移植瘤增长,并诱导肿瘤细胞凋亡;其机制可能是通过对EZH2的抑制增强PTEN的表达,从而抑制mTOR/p70S6K信号通路的激活。 展开更多

关键词 食管鳞癌 EZH2抑制剂 DZNep 裸鼠 mTOR/p70S6K信号通路

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TCGA数据库中不同种族肝细胞癌相关lncRNAs的筛选及功能预测

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作者 马佳康 任凯凯 +6 位作者 李雨濛 李南 张玲 王健 孙金旗 周博 马军 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2019年第10期1037-1042,共6页

目的lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确。文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。方法通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和... 目的lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确。文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。方法通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和癌旁组织进行差异分析得到各自的差异的lncRNAs,并比较3个人种差异lncRNAs基因谱情况,用韦恩图找出3个人种共有的差异lncRNAs。并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、ceRNA网络构建和靶基因预测并对靶基因行GO、KEGG富集分析和转录因子预测,从而预测其调控机制。结果3个人种共有的肝细胞癌差异lncRNAs 49个,白色人种和黑色人种重叠基因21.5%,白色人种与黄色人种、黑色人种与黄色人种差异lncRNAs重叠率仅为7.8%和5.8%。3个人种共有的LINC01224可预测到靶基因,行GO富集分析显示,其功能和DNA复制、转位、基因表达调控、表观遗传、miRNAs基因沉默及RNA转录后基因沉默等有关;KEGG分析显示,LINC01224和细胞周期调控、DNA复制相关。白色人种生存相关的的11个lncRNAs基因中未预测到靶基因。黄色人种肝细胞癌生存相关的6个lncRNAs中,AC093609.1的靶基因通过GO富集后结果显示,其功能和离子通道活性如钙通道活性、被动跨膜转运蛋白活性有关;KEGG结果显示其参与心肌病、心肌细胞肾上腺素能等信号通路的调控;AC126118.1的靶基因通过GO富集后发现,其靶基因和多种代谢功能相关;KEGG结果也显示其参与脂肪酸降解、ABC转运蛋白、氨基酸代谢等信号通路。结论白色人种和黑色人种lncRNAs表达谱相似性较高,而黄色人种和白色人种、黑色人种差异较大,其中3个人种共有的LINC01224可能参与了调控肿瘤生长;黄色人种特有lncRNA(AC093609.1、AC126118.1)在肿瘤代谢等方面起了重要作用,为后续肝细胞癌的基因验证实验和功能研究奠定了基础。 展开更多

关键词 肝细胞癌 长链非编码RNA TCGA ceRNA 生存分析 人种

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