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题名肿瘤患者T细胞受体多样性和克隆性的高通量测序分析
被引量：1
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作者
杨黎
张茹
黄建敏
宋亚东
张志新
张毅
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机构
郑州大学第一附属医院生物细胞治疗中心
郑州大学第一附属医院妇科放疗科
健康管理中心/健康管理研究所
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出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期55-64,共10页
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基金
国家重点研发计划项目(编号:2021YFE0110600)
国家自然科学基金项目(编号:82072578、91942314、U1804281)
河南省中青年卫生健康科技创新杰出青年人才项目(编号:YXK2020027)资助。
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文摘
目的:探讨肺癌和食管癌患者外周血T细胞受体(T cell receptor,TCR)多样性和克隆分布,以及食管癌外周血和肿瘤浸润淋巴细胞中T细胞TCR的差异情况。方法:收集自2019年4月至2021年5月郑州大学第一附属医院未行放、化疗,并排除严重感染性疾病、自身免疫性疾病以及近期使用免疫抑制剂治疗史的8例食管癌、8例肺癌患者的外周血标本,选取其中1例食管癌患者肿瘤组织标本进行TCR测序。17例健康人外周血标本作为对照组。分析肿瘤患者与健康人之间以及早期、晚期肿瘤患者之间TCR多样性指数(D50)、VJ基因使用频率以及CDR3序列克隆型频率的差异。结果:食管癌、肺癌患者外周血TCR CDR3序列的D50值[分别为(0.031±0.028)和(0.077±0.034)],均低于健康人[(0.145±0.057),P<0.000 1和P=0.005 3]。食管癌、肺癌外周血TCR CDR3最大克隆比例[分别为(10.640±7.640)%和(8.334±5.575)%],均高于健康人[(4.070±2.341)%, P=0.003 1和P=0.011 9]。且TCR CDR3序列的最大克隆比例与D50值呈负相关。食管癌和肺癌患者早期外周血T细胞TCR多样性(D50)[分别为(0.057±0.028)和(0.106±0.007)]明显高于晚期患者[分别为(0.015±0.014,P=0.028 5)和(0.059±0.030,P=0.041 7)]。随着疾病进展,肺癌和食管癌患者外周血TCR CDR3中TRBV和TRBJ基因组合使用减少,单个或多个TCR克隆型占比明显增高,存在明显的单一性。结论:肺癌和食管癌中外周血TCR谱多样性低于健康人,且存在克隆性增殖。在肿瘤发展中,TCR谱多样性降低,提示TCR谱为肿瘤的诊断、免疫评估提供了潜在的生物标志物,具有重要的临床指导意义。
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关键词
T细胞受体
高通量测序
多样性
克隆性
生物标志物
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Keywords
T cell receptor(TCR)
high-throughput sequencing
diversity
clonality
biomarker
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分类号
R734.2
[医药卫生—肿瘤]
R735.1
[医药卫生—肿瘤]
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