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应用随机寡核苷酸文库修饰磁性颗粒提高血浆蛋白质的鉴定覆盖度
1
作者
邓楠
梁振
+4 位作者
边阳阳
张明建
张柯
张丽华
张玉奎
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期280-285,共6页
基于随机寡核苷酸与蛋白质之间的离子、亲和、疏水、氢键等相互作用力及多种空间结构作用,发展了一种基于随机寡核苷酸文库作为配基的新型血浆样品处理方法。采用寡核苷酸文库修饰的磁性颗粒(MNP@ssDNA)材料,在生理缓冲体系条件下捕获...
基于随机寡核苷酸与蛋白质之间的离子、亲和、疏水、氢键等相互作用力及多种空间结构作用,发展了一种基于随机寡核苷酸文库作为配基的新型血浆样品处理方法。采用寡核苷酸文库修饰的磁性颗粒(MNP@ssDNA)材料,在生理缓冲体系条件下捕获血浆样品中的蛋白质。比较了两种洗脱体系的洗脱效果,并利用nano-RPLC-ESIMS/MS对获得的蛋白质酶解液组分进行分析。结果表明,MNP@ssDNA材料处理后的血浆蛋白质鉴定数量提升了约29.5%,两种洗脱体系呈现良好的互补性(26.7%)。血浆中前10种高丰度蛋白质的谱图占有率从处理前的31.82%降低到21.31%(洗脱体系1)和26.20%(洗脱体系2)。在鉴定到的蛋白质中,丰度最低的蛋白质在血浆中的质量浓度约为0.29 ng/mL,该蛋白质仅在MNP@ssDNA材料处理后被鉴定到。结果证明MNP@ssDNA策略不仅能有效降低血浆中高丰度蛋白质的丰度,也为低丰度蛋白质的深度挖掘提供了新的思路。
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关键词
随机寡核苷酸文库
血浆
蛋白质
高丰度
低丰度
谱图数量
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职称材料
固定化β-葡萄糖醛酸酶反应器的制备及其在4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇的O-糖苷化合物分析中的应用
被引量：
3
2
作者
王婷
姚二民
+5 位作者
邓楠
边阳阳
刘萍萍
张柯
陈千思
李斌
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期245-252,共8页
采用溶胶-凝胶法,以丙烯酰胺作为单体,制备了基于有机-硅胶杂化整体柱的β-葡萄糖醛酸酶反应器。优化了硅酸甲酯和γ-(甲基丙烯酰氧)丙基三甲氧基硅的物质的量的比、丙烯酰胺和聚乙二醇的用量,以及水浴温度等制备条件,获得了孔隙均匀、...
采用溶胶-凝胶法,以丙烯酰胺作为单体,制备了基于有机-硅胶杂化整体柱的β-葡萄糖醛酸酶反应器。优化了硅酸甲酯和γ-(甲基丙烯酰氧)丙基三甲氧基硅的物质的量的比、丙烯酰胺和聚乙二醇的用量,以及水浴温度等制备条件,获得了孔隙均匀、通透性良好、机械强度高的有机-硅胶杂化整体柱。采用光学显微镜和扫描电镜表征杂化整体柱。进一步将β-葡萄糖醛酸酶共价键合在整体柱上,以4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇(NNAL)的O-糖苷化合物(NNAL-O-Gluc)为底物研究酶反应器的水解效果,实验结果证明酶反应器在室温条件下的水解效率大大提高,实现了NNAL-O-Gluc高效水解与分析,解决了目前NNAL-O-Gluc分析中前处理水解效率低的问题。
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关键词
有机-硅胶杂化整体柱
6-葡萄糖醛酸酶
固定化酶反应器
4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇的0-糖苷化合物
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职称材料
题名
应用随机寡核苷酸文库修饰磁性颗粒提高血浆蛋白质的鉴定覆盖度
1
作者
邓楠
梁振
边阳阳
张明建
张柯
张丽华
张玉奎
机构
中国烟草总公司
郑州
烟草
研究
院
中国科学院大连化学物理
研究
所
郑州大学第一附属医院医学研究中心
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期280-285,共6页
基金
国家自然科学基金项目(21505158,81600046)~~
文摘
基于随机寡核苷酸与蛋白质之间的离子、亲和、疏水、氢键等相互作用力及多种空间结构作用,发展了一种基于随机寡核苷酸文库作为配基的新型血浆样品处理方法。采用寡核苷酸文库修饰的磁性颗粒(MNP@ssDNA)材料,在生理缓冲体系条件下捕获血浆样品中的蛋白质。比较了两种洗脱体系的洗脱效果,并利用nano-RPLC-ESIMS/MS对获得的蛋白质酶解液组分进行分析。结果表明,MNP@ssDNA材料处理后的血浆蛋白质鉴定数量提升了约29.5%,两种洗脱体系呈现良好的互补性(26.7%)。血浆中前10种高丰度蛋白质的谱图占有率从处理前的31.82%降低到21.31%(洗脱体系1)和26.20%(洗脱体系2)。在鉴定到的蛋白质中,丰度最低的蛋白质在血浆中的质量浓度约为0.29 ng/mL,该蛋白质仅在MNP@ssDNA材料处理后被鉴定到。结果证明MNP@ssDNA策略不仅能有效降低血浆中高丰度蛋白质的丰度,也为低丰度蛋白质的深度挖掘提供了新的思路。
关键词
随机寡核苷酸文库
血浆
蛋白质
高丰度
低丰度
谱图数量
Keywords
random oligonucleotide library
plasma
protein
high abundance
low abundance
spectral count
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
固定化β-葡萄糖醛酸酶反应器的制备及其在4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇的O-糖苷化合物分析中的应用
被引量：
3
2
作者
王婷
姚二民
邓楠
边阳阳
刘萍萍
张柯
陈千思
李斌
机构
中国烟草总公司
郑州
烟草
研究
院
郑州
轻工业学院
郑州大学第一附属医院医学研究中心
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期245-252,共8页
基金
国家自然科学基金项目(21505158,81600046).
文摘
采用溶胶-凝胶法,以丙烯酰胺作为单体,制备了基于有机-硅胶杂化整体柱的β-葡萄糖醛酸酶反应器。优化了硅酸甲酯和γ-(甲基丙烯酰氧)丙基三甲氧基硅的物质的量的比、丙烯酰胺和聚乙二醇的用量,以及水浴温度等制备条件,获得了孔隙均匀、通透性良好、机械强度高的有机-硅胶杂化整体柱。采用光学显微镜和扫描电镜表征杂化整体柱。进一步将β-葡萄糖醛酸酶共价键合在整体柱上,以4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇(NNAL)的O-糖苷化合物(NNAL-O-Gluc)为底物研究酶反应器的水解效果,实验结果证明酶反应器在室温条件下的水解效率大大提高,实现了NNAL-O-Gluc高效水解与分析,解决了目前NNAL-O-Gluc分析中前处理水解效率低的问题。
关键词
有机-硅胶杂化整体柱
6-葡萄糖醛酸酶
固定化酶反应器
4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇的0-糖苷化合物
Keywords
organic silica hybrid monolithic column
^S-glucuronidase
immobilized enzyme reactor(IMER)
O-glucuronides of 4-(methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanol(NNAL-O-Gluc)
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用随机寡核苷酸文库修饰磁性颗粒提高血浆蛋白质的鉴定覆盖度
邓楠
梁振
边阳阳
张明建
张柯
张丽华
张玉奎
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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职称材料
2
固定化β-葡萄糖醛酸酶反应器的制备及其在4-甲基亚硝胺基-1-(3-吡啶)-1-丁醇的O-糖苷化合物分析中的应用
王婷
姚二民
邓楠
边阳阳
刘萍萍
张柯
陈千思
李斌
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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