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超氧化物歧化酶脂质体治疗大鼠实验性结肠炎的研究
被引量：
4
1
作者
陈香宇
段芳龄
+4 位作者
马军
高天慧
朱武凌
白经修
李建生
《山东医药》
CAS
北大核心
2002年第24期15-17,共3页
关键词
溃疡性结肠炎
UC
药理学
疗效
超氧化物歧化酶脂质体
在线阅读
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职称材料
TCGA数据库中不同种族肝细胞癌相关lncRNAs的筛选及功能预测
2
作者
马佳康
任凯凯
+6 位作者
李雨濛
李南
张玲
王健
孙金旗
周博
马军
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2019年第10期1037-1042,共6页
目的lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确。文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。方法通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和...
目的lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确。文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。方法通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和癌旁组织进行差异分析得到各自的差异的lncRNAs,并比较3个人种差异lncRNAs基因谱情况,用韦恩图找出3个人种共有的差异lncRNAs。并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、ceRNA网络构建和靶基因预测并对靶基因行GO、KEGG富集分析和转录因子预测,从而预测其调控机制。结果3个人种共有的肝细胞癌差异lncRNAs 49个,白色人种和黑色人种重叠基因21.5%,白色人种与黄色人种、黑色人种与黄色人种差异lncRNAs重叠率仅为7.8%和5.8%。3个人种共有的LINC01224可预测到靶基因,行GO富集分析显示,其功能和DNA复制、转位、基因表达调控、表观遗传、miRNAs基因沉默及RNA转录后基因沉默等有关;KEGG分析显示,LINC01224和细胞周期调控、DNA复制相关。白色人种生存相关的的11个lncRNAs基因中未预测到靶基因。黄色人种肝细胞癌生存相关的6个lncRNAs中,AC093609.1的靶基因通过GO富集后结果显示,其功能和离子通道活性如钙通道活性、被动跨膜转运蛋白活性有关;KEGG结果显示其参与心肌病、心肌细胞肾上腺素能等信号通路的调控;AC126118.1的靶基因通过GO富集后发现,其靶基因和多种代谢功能相关;KEGG结果也显示其参与脂肪酸降解、ABC转运蛋白、氨基酸代谢等信号通路。结论白色人种和黑色人种lncRNAs表达谱相似性较高,而黄色人种和白色人种、黑色人种差异较大,其中3个人种共有的LINC01224可能参与了调控肿瘤生长;黄色人种特有lncRNA(AC093609.1、AC126118.1)在肿瘤代谢等方面起了重要作用,为后续肝细胞癌的基因验证实验和功能研究奠定了基础。
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关键词
肝细胞癌
长链非编码RNA
TCGA
ceRNA
生存分析
人种
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职称材料
题名
超氧化物歧化酶脂质体治疗大鼠实验性结肠炎的研究
被引量：
4
1
作者
陈香宇
段芳龄
马军
高天慧
朱武凌
白经修
李建生
机构
郑州大学消化疾病研究所
郑州大学
第一附属医院
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2002年第24期15-17,共3页
基金
河南省科委资助项目 (NO.97462 160 0 )
关键词
溃疡性结肠炎
UC
药理学
疗效
超氧化物歧化酶脂质体
分类号
R574.62 [医药卫生—消化系统]
R965 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
TCGA数据库中不同种族肝细胞癌相关lncRNAs的筛选及功能预测
2
作者
马佳康
任凯凯
李雨濛
李南
张玲
王健
孙金旗
周博
马军
机构
郑州大学
第二附属医院肿瘤科
郑州大学
第二附属医院检验科
郑州大学消化疾病研究所
河南省肿瘤医院肝胆胰外科
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2019年第10期1037-1042,共6页
文摘
目的lncRNAs在不同种族肝细胞癌中的表达异同目前并不明确。文中旨在分析TCGA数据库中黄色人种、白色人种和黑色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。方法通过对黄色人种、白色人种和黑色人种的HCC患者的癌和癌旁组织进行差异分析得到各自的差异的lncRNAs,并比较3个人种差异lncRNAs基因谱情况,用韦恩图找出3个人种共有的差异lncRNAs。并对筛选出的差异lncRNAs进行生存分析、ceRNA网络构建和靶基因预测并对靶基因行GO、KEGG富集分析和转录因子预测,从而预测其调控机制。结果3个人种共有的肝细胞癌差异lncRNAs 49个,白色人种和黑色人种重叠基因21.5%,白色人种与黄色人种、黑色人种与黄色人种差异lncRNAs重叠率仅为7.8%和5.8%。3个人种共有的LINC01224可预测到靶基因,行GO富集分析显示,其功能和DNA复制、转位、基因表达调控、表观遗传、miRNAs基因沉默及RNA转录后基因沉默等有关;KEGG分析显示,LINC01224和细胞周期调控、DNA复制相关。白色人种生存相关的的11个lncRNAs基因中未预测到靶基因。黄色人种肝细胞癌生存相关的6个lncRNAs中,AC093609.1的靶基因通过GO富集后结果显示,其功能和离子通道活性如钙通道活性、被动跨膜转运蛋白活性有关;KEGG结果显示其参与心肌病、心肌细胞肾上腺素能等信号通路的调控;AC126118.1的靶基因通过GO富集后发现,其靶基因和多种代谢功能相关;KEGG结果也显示其参与脂肪酸降解、ABC转运蛋白、氨基酸代谢等信号通路。结论白色人种和黑色人种lncRNAs表达谱相似性较高,而黄色人种和白色人种、黑色人种差异较大,其中3个人种共有的LINC01224可能参与了调控肿瘤生长;黄色人种特有lncRNA(AC093609.1、AC126118.1)在肿瘤代谢等方面起了重要作用,为后续肝细胞癌的基因验证实验和功能研究奠定了基础。
关键词
肝细胞癌
长链非编码RNA
TCGA
ceRNA
生存分析
人种
Keywords
hepatocellular carcinoma
long non-coding RNAs(lncRNAs)
TCGA
ceRNA
overall survival
race
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
超氧化物歧化酶脂质体治疗大鼠实验性结肠炎的研究
陈香宇
段芳龄
马军
高天慧
朱武凌
白经修
李建生
《山东医药》
CAS
北大核心
2002
4
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职称材料
2
TCGA数据库中不同种族肝细胞癌相关lncRNAs的筛选及功能预测
马佳康
任凯凯
李雨濛
李南
张玲
王健
孙金旗
周博
马军
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2019
0
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