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辣椒基因组学研究进展 被引量:3
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作者 程蛟文 赖泽培 +9 位作者 董骥驰 覃成 吴智明 廖毅 陈长明 宋钊 陈木溪 崔竣杰 宋建文 胡开林 《广东农业科学》 CAS 2024年第7期1-12,共12页
辣椒是我国重要蔬菜作物和调味品之一。开展辣椒基因组学研究对于认识辣椒遗传与进化、挖掘辣椒重要功能基因以及利用生物技术开展品种遗传改良等具有重要意义。2014年辣椒基因组草图发布标志辣椒步入基因组学研究时代。近10年来,辣椒... 辣椒是我国重要蔬菜作物和调味品之一。开展辣椒基因组学研究对于认识辣椒遗传与进化、挖掘辣椒重要功能基因以及利用生物技术开展品种遗传改良等具有重要意义。2014年辣椒基因组草图发布标志辣椒步入基因组学研究时代。近10年来,辣椒基因组学研究取得显著进展,包括深入揭示辣椒基因组的基本特征,并初步构建辣椒泛基因组等。同时,辣椒基因组学还在探究辣椒种间分化和基因渗入、解析辣椒重要性状进化机制、阐明辣椒遗传多样性特征、揭示辣椒人工驯化特征、追溯辣椒全球扩张传播历史和挖掘辣椒重要性状控制基因等方面得到广泛应用。该文主要回顾和总结过去近10年辣椒基因组研究领域取得的进展,并对构建更高质量辣椒参考基因组和泛基因组以及完善辣椒功能基因组学研究平台进行展望,旨在为辣椒基因组学及其相关应用研究提供参考。 展开更多
关键词 辣椒 基因组学 种间分化 基因渗入 遗传多样性 人工驯化 扩张传播
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贵州省28个辣椒品种抗土壤连作障碍的效果分析 被引量:3
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作者 罗希榕 陀海燕 +5 位作者 李唐燕 李靖 郭娅 梁偲 邱宁宏 覃成 《辣椒杂志》 2022年第2期6-12,34,共8页
为筛选抗连作障碍能力强的辣椒品种,在前茬连作辣椒3年的土壤上连续2年(2019—2020年)种植28个辣椒品种,并测定其丰产性能和产量指标。结果发现,卓椒12号、卓椒18号、正椒9号、二荆条、辣珍珠、荣耀和单生朝天椒等7个品种的株高、开展... 为筛选抗连作障碍能力强的辣椒品种,在前茬连作辣椒3年的土壤上连续2年(2019—2020年)种植28个辣椒品种,并测定其丰产性能和产量指标。结果发现,卓椒12号、卓椒18号、正椒9号、二荆条、辣珍珠、荣耀和单生朝天椒等7个品种的株高、开展度、主茎高、主茎直茎、始花节位及有效分枝变化不显著,对连作障碍的响应程度较小;卓椒12号、二荆条、荣耀和单生朝天椒4个品种对不同连作土壤的响应相似,单株果实数减少,但单果鲜质量增加,最终产量(2020年)比上一年(2019年)略有增加;辣珍珠和卓椒18号对不同连作土壤的响应和上述4个品种相反,单株果实数均增加,但单果鲜质量降低,最终产量增加,也具备稳产的特性;正椒9号的单株果实数和单果鲜质量均有减少(4.14%),最终产量减少8.18%。结果表明,上述7个品种的丰产性能表现良好,产量较稳定,耐连作障碍抗性较强,可进行大面积示范推广。 展开更多
关键词 辣椒 土壤连作障碍 品种 丰产性能 产量
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辣椒CaSEP1和CaSEP4基因克隆及表达分析
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作者 吴诗琪 罗银 +3 位作者 罗希榕 杨良刚 胡美忠 覃成 《种子》 北大核心 2025年第3期42-51,共10页
SEPALLAT (SEP)基因在植物花器官发育中至关重要。采用PCR技术克隆辣椒CaSEP1和CaSEP4基因,并用生物信息学手段分析其蛋白结构、进化及基因调控关系,用qPCR技术检测CaSEP1和CaSEP4在花萌芽后不同时期及在低温中的表达量。蛋白结构分析表... SEPALLAT (SEP)基因在植物花器官发育中至关重要。采用PCR技术克隆辣椒CaSEP1和CaSEP4基因,并用生物信息学手段分析其蛋白结构、进化及基因调控关系,用qPCR技术检测CaSEP1和CaSEP4在花萌芽后不同时期及在低温中的表达量。蛋白结构分析表明,CaSEP1和CaSEP4编码区全长分别为702 bp和726 bp,分别编码232个和241个氨基酸,属于MADS-box基因家族。两个蛋白均为不跨膜的碱性亲水性蛋白,主要定位于细胞核中。系统发育树表明,与CaSEP1和CaSEP4亲缘关系最近的分别是马铃薯StSEP1和StAGL9基因。qPCR结果显示,二者在花萌芽后10 d的表达量最高,且受低温影响。低温促进了CaSEP1基因在萼片、花瓣和雄蕊中的发育,而抑制雌蕊的发育;同样,低温也促进了CaSEP4基因在花瓣和雄蕊中的表达,抑制了雌蕊的发育。顺式作用元件分析显示,两个基因的表达可能受到各种环境信号(如光、低温、厌氧和植物激素)的调控。CaSEP1和CaSEP4基因结构保守,在花发育中存在不同的表达模式。 展开更多
关键词 辣椒 MADS-box基因家族 CaSEP1基因 CaSEP4基因 生物信息学
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采用TMT技术解析辣椒雄性不育关键蛋白研究
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作者 覃成 杨仕梅 +6 位作者 罗希榕 李唐燕 李靖 郭娅 陀海燕 涂韦波 邱化荣 《种子》 北大核心 2022年第7期42-50,共9页
本研究通过对辣椒S 033-A保持系和S 033-B不育系的近等基因系辣椒进行蛋白质组学分析,揭示辣椒不育的关键蛋白。结果表明,保持系和不育系中蛋白总数为7667个,可定量蛋白为7629个,存在504个差异表达蛋白。保持系S 033-A有351个蛋白上调表... 本研究通过对辣椒S 033-A保持系和S 033-B不育系的近等基因系辣椒进行蛋白质组学分析,揭示辣椒不育的关键蛋白。结果表明,保持系和不育系中蛋白总数为7667个,可定量蛋白为7629个,存在504个差异表达蛋白。保持系S 033-A有351个蛋白上调表达,不育系S 033-B有153个蛋白上调表达。结合生物信息学对差异表达蛋白进行亚细胞定位、保守结构域、GO和KEGG富集等进行分析,发现亚细胞定位主要在细胞质、细胞核和叶绿体,421条差异表达蛋白存在保守结构域,主要为谷胱甘肽S-转移酶、过氧化物酶、UDP-葡萄糖苷和UDP葡萄糖苷转移酶,GO富集在叶绿体、质体、类囊体中,KEGG富集主要参与光合作用、细胞色素P 450、单萜生物合成、类黄酮生物合成生化途径等。本研究从蛋白质组学角度发现了辣椒雄性不育相关的关键蛋白和代谢途径,揭示了辣椒雄性不育可能的分子机制,并鉴定了相关候选蛋白,为辣椒遗传育种奠定了理论基础。 展开更多
关键词 辣椒 蛋白质组学 雄性不育 关键蛋白
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辣椒MIKC型MADS-box基因家族鉴定及胁迫响应 被引量:2
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作者 罗希榕 祝晓云 +4 位作者 杨仕梅 李唐燕 李靖 陀海燕 覃成 《种子》 北大核心 2024年第1期59-67,113,共10页
MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定... MADS-box家族在花的诱导和发育中作用广泛,有些基因在明显不相关的发育阶段具有多种功能。本研究通过生物信息学对辣椒MIKC型MADS-box家族系统发育树、保守结构、基因特征、GO和KEGG富集分析、时空表达等进行系统分析。在辣椒中共鉴定到25条MIKC_MADS基因,均具有MIKC_MADS的N端SRF-TF和C端K-box保守结构域,氨基酸数为122~278 aa,为两性亲水性蛋白。Motif分析发现,25条CaMADS-box基因均含有Motif1、Motif2、Motif4共3个保守基序。染色体定位发现,25条基因不均匀地分布在12条染色体上,其中染色体Chr02定位基因最多,共计5条基因。共线性分析发现MIKC_MADS在野生种Chiltepin中存在多个共线性区块。GO富集分析发现,MIKC_MADS主要参与植物生长初期发育过程,主要是花器官、胚乳发育过程,KEGG富集到甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢(ko00260),乙醛酸盐和二羧酸盐代谢(ko00630),碳代谢(ko01200)。顺式作用元件发现,与光响应元件、水杨酸、胚乳等元件相关。在时空表达过程中,MIKC_MADS在茎、叶、芽和花过程表达呈现上调表达趋势。 展开更多
关键词 辣椒 MADS-BOX基因 基因特征 时空表达特性
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