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单细胞与空间组学技术在缺血性脑卒中研究中的应用
1
作者
朱晓西
王成
余丽梅
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第11期1600-1609,共10页
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)研究因传统技术难以解析细胞异质性及时空动态而面临瓶颈。单细胞与空间组学技术的发展为突破这一局限提供了革命性工具。单细胞组学技术通过对数千个细胞进行高通量测序,揭示了IS后神经元、胶质细胞...
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)研究因传统技术难以解析细胞异质性及时空动态而面临瓶颈。单细胞与空间组学技术的发展为突破这一局限提供了革命性工具。单细胞组学技术通过对数千个细胞进行高通量测序,揭示了IS后神经元、胶质细胞、免疫细胞等的高度异质性和动态状态转变,例如小胶质细胞存在促炎与抗炎功能亚群,星形胶质细胞呈现不同的活化状态谱系。伪时间分析进一步重构了细胞在损伤修复过程中的命运轨迹。空间组学技术则通过原位捕获重构基因表达的空间图谱,阐明缺血核心区、半暗带和健康脑区之间的分子梯度差异,并能解析关键的细胞间相互作用网络。整合单细胞测序的深度分型与空间组学的原位定位信息是当前核心策略。这种多模态分析能将细胞亚群精准锚定至其空间微环境,揭示其分布规律与功能,并构建更精确的细胞通讯图谱,从而极大推动了对IS机制的精细解析。该策略已加速了潜在生物标志物和时空特异性治疗靶点的发现。尽管面临样本制备、数据整合与技术噪音等挑战,未来通过多学科交叉、多组学融合与人工智能的深度挖掘,单细胞与空间组学技术有望全面革新对IS的认知,最终促进其早期诊断、精准分型及个体化治疗策略的发展。
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关键词
缺血性脑卒中
单细胞组学
空间组学
生物标志物
精准治疗
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职称材料
单细胞测序与空间转录物组测序:揭秘间充质干细胞异质性与空间微环境的动态演变
2
作者
李刘佳钰
王成
余丽梅
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第11期1610-1621,共12页
间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)因其多向分化潜能和免疫调节特性,在再生医学中具有广阔应用前景,但其功能异质性和微环境依赖性仍是临床应用的重大挑战。近年来,单细胞转录物组测序(single-cell transcriptome sequencing,s...
间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)因其多向分化潜能和免疫调节特性,在再生医学中具有广阔应用前景,但其功能异质性和微环境依赖性仍是临床应用的重大挑战。近年来,单细胞转录物组测序(single-cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)与空间转录物组测序(spatial transcriptome sequencing,ST-seq)技术的结合,为系统解析MSCs的异质性、功能多样性及微环境相互作用提供了革命性工具。应用scRNA-seq技术,研究成功解析了MSCs的功能异质性,精准鉴定出促血管生成、免疫调节和基质重塑等关键功能亚群;而ST-seq技术则系统揭示了MSCs在组织中的特异性空间分布及其与微环境的动态相互作用网络。这2种技术整合应用不仅构建了MSCs“身份-定位-功能”的三维图谱,还揭示了特定亚群在组织修复中的时空动态调控机制。未来结合Xenium等人超高分辨率ST-seq、多组学联合及人工智能分析,将推动MSCs研究从描述性分析向精准干预转变,为功能亚群筛选和微环境编程治疗提供新策略。本文系统总结了scRNA-seq与ST-seq技术在MSCs研究中的最新进展,深入探讨了其在解析细胞异质性、空间微环境及临床转化中的应用,为再生医学的精准治疗提供了理论依据和技术方向。
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关键词
单细胞转录物组测序
空间转录物组测序
间充质干细胞
再生医学
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职称材料
题名
单细胞与空间组学技术在缺血性脑卒中研究中的应用
1
作者
朱晓西
王成
余丽梅
机构
遵义医科大学附属医院贵州省生物制造实验室
遵义
医科
大学
教育部组织损伤修复与再生医学协同创新中心
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第11期1600-1609,共10页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(No.82360047)
贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2023]一般326)
贵州省卫生健康委科学技术基金(No.gzwkj2025-010)资助。
文摘
缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)研究因传统技术难以解析细胞异质性及时空动态而面临瓶颈。单细胞与空间组学技术的发展为突破这一局限提供了革命性工具。单细胞组学技术通过对数千个细胞进行高通量测序,揭示了IS后神经元、胶质细胞、免疫细胞等的高度异质性和动态状态转变,例如小胶质细胞存在促炎与抗炎功能亚群,星形胶质细胞呈现不同的活化状态谱系。伪时间分析进一步重构了细胞在损伤修复过程中的命运轨迹。空间组学技术则通过原位捕获重构基因表达的空间图谱,阐明缺血核心区、半暗带和健康脑区之间的分子梯度差异,并能解析关键的细胞间相互作用网络。整合单细胞测序的深度分型与空间组学的原位定位信息是当前核心策略。这种多模态分析能将细胞亚群精准锚定至其空间微环境,揭示其分布规律与功能,并构建更精确的细胞通讯图谱,从而极大推动了对IS机制的精细解析。该策略已加速了潜在生物标志物和时空特异性治疗靶点的发现。尽管面临样本制备、数据整合与技术噪音等挑战,未来通过多学科交叉、多组学融合与人工智能的深度挖掘,单细胞与空间组学技术有望全面革新对IS的认知,最终促进其早期诊断、精准分型及个体化治疗策略的发展。
关键词
缺血性脑卒中
单细胞组学
空间组学
生物标志物
精准治疗
Keywords
ischemic stroke(IS)
single-cell omics
spatial omics
biomarkers
precision therapy
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
单细胞测序与空间转录物组测序:揭秘间充质干细胞异质性与空间微环境的动态演变
2
作者
李刘佳钰
王成
余丽梅
机构
遵义医科大学附属医院贵州省生物制造实验室
遵义
医科
大学
附属
医院
贵州省
细胞工程重点
实验室
遵义
医科
大学
教育部组织损伤修复与再生医学省部共建协同创新中心
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第11期1610-1621,共12页
基金
国家自然科学基金地区科学基金项目(No.82360047)
贵州茅台医院科研与人才培养资金资助(No.2022[MTYK 2022-10])资助。
文摘
间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)因其多向分化潜能和免疫调节特性,在再生医学中具有广阔应用前景,但其功能异质性和微环境依赖性仍是临床应用的重大挑战。近年来,单细胞转录物组测序(single-cell transcriptome sequencing,scRNA-seq)与空间转录物组测序(spatial transcriptome sequencing,ST-seq)技术的结合,为系统解析MSCs的异质性、功能多样性及微环境相互作用提供了革命性工具。应用scRNA-seq技术,研究成功解析了MSCs的功能异质性,精准鉴定出促血管生成、免疫调节和基质重塑等关键功能亚群;而ST-seq技术则系统揭示了MSCs在组织中的特异性空间分布及其与微环境的动态相互作用网络。这2种技术整合应用不仅构建了MSCs“身份-定位-功能”的三维图谱,还揭示了特定亚群在组织修复中的时空动态调控机制。未来结合Xenium等人超高分辨率ST-seq、多组学联合及人工智能分析,将推动MSCs研究从描述性分析向精准干预转变,为功能亚群筛选和微环境编程治疗提供新策略。本文系统总结了scRNA-seq与ST-seq技术在MSCs研究中的最新进展,深入探讨了其在解析细胞异质性、空间微环境及临床转化中的应用,为再生医学的精准治疗提供了理论依据和技术方向。
关键词
单细胞转录物组测序
空间转录物组测序
间充质干细胞
再生医学
Keywords
single-cell transcriptome sequencing(scRNA-seq)
spatial transcriptomics(ST-seq)
mesenchymal stem cells(MSCs)
regenerative medicine
分类号
Q812 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞与空间组学技术在缺血性脑卒中研究中的应用
朱晓西
王成
余丽梅
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
单细胞测序与空间转录物组测序:揭秘间充质干细胞异质性与空间微环境的动态演变
李刘佳钰
王成
余丽梅
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
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0
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