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动物性中药材地龙DNA条形码初步研究
被引量:
19
1
作者
吕国庆
牛宪立
姬可平
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第17期114-116,共3页
利用通用引物对中药材地龙的COⅠ、16S rDNA片断进行PCR扩增、测序、分析,并构建系统进化树,将获得的中药材地龙COⅠ、16S rDNA片断序列提交到GenBank中的DNA Barcoding数据库进行分析。结果显示:(1)中药材地龙COⅠ片断的长度为682 bp,...
利用通用引物对中药材地龙的COⅠ、16S rDNA片断进行PCR扩增、测序、分析,并构建系统进化树,将获得的中药材地龙COⅠ、16S rDNA片断序列提交到GenBank中的DNA Barcoding数据库进行分析。结果显示:(1)中药材地龙COⅠ片断的长度为682 bp,其中变异位点(SNP多态位点)有179个,多态位点约占片断总长的26%,碱基A+T的含量为58.8%、G+C的含量为41.2%。16S rDNA片断的长度为503 bp,其中变异位点有70个,多态位点约占片断总长的14%,碱基A+T的含量为62.4%、G+C的含量为37.6%;(2)获得COⅠ序列的登录号为HQ405769-HQ405776,16S rDNA序列的登录号为HQ405777-HQ405783;(3)中药材地龙DNA中COⅠ序列的基因多态性比16S rDNA序列更显著,适合做为中药材地龙的DNA条形码。
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关键词
中药材
地龙
DNA条形码
线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)
16SrRNA基因(16SrDNA)
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职称材料
3种药用红树植物rDNA ITS序列初步研究
被引量:
5
2
作者
牛宪立
吴群
姬可平
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第17期109-110,116,共3页
应用改良CTAB法分别提取生长于珠海和海南的3种药用红树植物秋茄、老鼠簕和桐花树的基因组DNA,以真核生物rDNA ITS区的通用引物分别对其rDNA ITS区进行nPCR扩增及测序,并对测序结果进行对位排列。结果表明,不同来源的药用红树植物的rDNA...
应用改良CTAB法分别提取生长于珠海和海南的3种药用红树植物秋茄、老鼠簕和桐花树的基因组DNA,以真核生物rDNA ITS区的通用引物分别对其rDNA ITS区进行nPCR扩增及测序,并对测序结果进行对位排列。结果表明,不同来源的药用红树植物的rDNA ITS序列上存在扩增碱基差异,rDNA ITS测序结果可作为鉴定药用红树植物种质资源的分子标记之一。
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关键词
RDNA
红树植物
nPCR
测序
种质资源
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职称材料
改良消减杂交技术用以筛选差异表达非编码小RNA的应用初探
被引量:
1
3
作者
王燕
彭莉萍
+3 位作者
陈锦珍
刘星
罗镇明
周天会
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期146-150,共5页
旨在构建一种能快速、有效检测不同细胞中差异表达的非编码小RNA的方法。以乳腺癌细胞株MCF7和非癌乳腺上皮细胞HBL100为材料,用RNA分离试剂盒分离获得长度为18-100 nt的RNA片段,3'端添加poly(A)尾后利用smart技术进行反转录,在反...
旨在构建一种能快速、有效检测不同细胞中差异表达的非编码小RNA的方法。以乳腺癌细胞株MCF7和非癌乳腺上皮细胞HBL100为材料,用RNA分离试剂盒分离获得长度为18-100 nt的RNA片段,3'端添加poly(A)尾后利用smart技术进行反转录,在反转录体系中加入生物素标记的dATP,得到单链cDNA;结合生物素-磁珠分离技术将cDNA与待测RNA进行消减杂交并以U6为内参验证消减结果 ;最后利用巢式PCR扩增杂交产物,PCR产物插入T载体后,挑取阳性克隆进行测序。结果显示,总RNA按不同大小片段分离富集后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,于100 nt以下显示较亮条带;以U6为内参检测杂交效率,杂交后U6于33个循环时可见少量扩增条带;杂交产物经巢式PCR和电泳表明在100 nt范围内有明显条带,得到差异表达的非编码小RNA。经过改良的消减杂交方法可以快速、有效的检测不同标本中差异表达的非编码小RNA。
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关键词
非编码小RNA
消减杂交
乳腺癌细胞
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职称材料
中药材地龙DNA提取方法的比较分析
被引量:
1
4
作者
吕国庆
姬可平
+1 位作者
牛宪立
梅露露
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第5期2629-2630,共2页
以地龙为例,对中药材DNA的几种常用提取方法进行了比较分析,为中药的鉴定提供参考。
关键词
中药材
地龙
DNA提取
比较
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职称材料
题名
动物性中药材地龙DNA条形码初步研究
被引量:
19
1
作者
吕国庆
牛宪立
姬可平
机构
遵义
医学院
珠海
校
区
遵义医学院珠海校区生化与细胞分子生物学教研室
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第17期114-116,共3页
文摘
利用通用引物对中药材地龙的COⅠ、16S rDNA片断进行PCR扩增、测序、分析,并构建系统进化树,将获得的中药材地龙COⅠ、16S rDNA片断序列提交到GenBank中的DNA Barcoding数据库进行分析。结果显示:(1)中药材地龙COⅠ片断的长度为682 bp,其中变异位点(SNP多态位点)有179个,多态位点约占片断总长的26%,碱基A+T的含量为58.8%、G+C的含量为41.2%。16S rDNA片断的长度为503 bp,其中变异位点有70个,多态位点约占片断总长的14%,碱基A+T的含量为62.4%、G+C的含量为37.6%;(2)获得COⅠ序列的登录号为HQ405769-HQ405776,16S rDNA序列的登录号为HQ405777-HQ405783;(3)中药材地龙DNA中COⅠ序列的基因多态性比16S rDNA序列更显著,适合做为中药材地龙的DNA条形码。
关键词
中药材
地龙
DNA条形码
线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)
16SrRNA基因(16SrDNA)
分类号
R282.74 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
3种药用红树植物rDNA ITS序列初步研究
被引量:
5
2
作者
牛宪立
吴群
姬可平
机构
遵义医学院珠海校区生化与细胞分子生物学教研室
武汉市第二中西医结合医院检验科
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第17期109-110,116,共3页
文摘
应用改良CTAB法分别提取生长于珠海和海南的3种药用红树植物秋茄、老鼠簕和桐花树的基因组DNA,以真核生物rDNA ITS区的通用引物分别对其rDNA ITS区进行nPCR扩增及测序,并对测序结果进行对位排列。结果表明,不同来源的药用红树植物的rDNA ITS序列上存在扩增碱基差异,rDNA ITS测序结果可作为鉴定药用红树植物种质资源的分子标记之一。
关键词
RDNA
红树植物
nPCR
测序
种质资源
Keywords
rDNA
mangrove plants
nPCR
sequencing
germplasm resources
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
改良消减杂交技术用以筛选差异表达非编码小RNA的应用初探
被引量:
1
3
作者
王燕
彭莉萍
陈锦珍
刘星
罗镇明
周天会
机构
遵义医学院珠海校区生化与细胞分子生物学教研室
遵义
医学院
第五附属医院普外科
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期146-150,共5页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合OZ字[2009]2)
贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2008]2318号)
遵义医学院博士科研启动基金项目(贵州黔科合[2009]3070)
文摘
旨在构建一种能快速、有效检测不同细胞中差异表达的非编码小RNA的方法。以乳腺癌细胞株MCF7和非癌乳腺上皮细胞HBL100为材料,用RNA分离试剂盒分离获得长度为18-100 nt的RNA片段,3'端添加poly(A)尾后利用smart技术进行反转录,在反转录体系中加入生物素标记的dATP,得到单链cDNA;结合生物素-磁珠分离技术将cDNA与待测RNA进行消减杂交并以U6为内参验证消减结果 ;最后利用巢式PCR扩增杂交产物,PCR产物插入T载体后,挑取阳性克隆进行测序。结果显示,总RNA按不同大小片段分离富集后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,于100 nt以下显示较亮条带;以U6为内参检测杂交效率,杂交后U6于33个循环时可见少量扩增条带;杂交产物经巢式PCR和电泳表明在100 nt范围内有明显条带,得到差异表达的非编码小RNA。经过改良的消减杂交方法可以快速、有效的检测不同标本中差异表达的非编码小RNA。
关键词
非编码小RNA
消减杂交
乳腺癌细胞
Keywords
Small non-coding RNA Subtractive hybridization Breast cancer cell
分类号
Q522 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
中药材地龙DNA提取方法的比较分析
被引量:
1
4
作者
吕国庆
姬可平
牛宪立
梅露露
机构
遵义
医学院
遵义医学院珠海校区生化与细胞分子生物学教研室
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第5期2629-2630,共2页
文摘
以地龙为例,对中药材DNA的几种常用提取方法进行了比较分析,为中药的鉴定提供参考。
关键词
中药材
地龙
DNA提取
比较
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
动物性中药材地龙DNA条形码初步研究
吕国庆
牛宪立
姬可平
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
19
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
3种药用红树植物rDNA ITS序列初步研究
牛宪立
吴群
姬可平
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
改良消减杂交技术用以筛选差异表达非编码小RNA的应用初探
王燕
彭莉萍
陈锦珍
刘星
罗镇明
周天会
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
中药材地龙DNA提取方法的比较分析
吕国庆
姬可平
牛宪立
梅露露
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
1
在线阅读
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职称材料
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