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5种经济海胆线粒体16S rRNA基因片段的序列分析
被引量：
8
1
作者
刘晓慧
黄佳琪
+1 位作者
周遵春
董颖
《水产科学》
CAS
北大核心
2007年第6期331-334,共4页
对光棘球海胆、中间球海胆、马粪海胆,海刺猬和紫海胆线粒体DNA 16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到395 bp的可信片段。通过ClustalX 1.83和Mega 3.0软件对所得线粒体16SrRNA片段序列进行比较,共检测到118个碱基变异,其中简约信...
对光棘球海胆、中间球海胆、马粪海胆,海刺猬和紫海胆线粒体DNA 16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到395 bp的可信片段。通过ClustalX 1.83和Mega 3.0软件对所得线粒体16SrRNA片段序列进行比较,共检测到118个碱基变异,其中简约信息位点为33个。应用Mega 3.0计算各种间的相对遗传距离,以糙海参为外类群,得到NJ系统树和MP系统树,系统树各分支的置信度由“Bootstrap”1000次循环检验。结果表明,马粪海胆与光棘球海胆的亲缘关系较近,其次为中间球海胆,而紫海胆、海刺猬与这3种海胆的关系相对较远。
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关键词
光棘球海胆
中间球海胆
海刺猬
马粪海胆
紫海胆
线粒体DNA
16S
RRNA基因
序列分析
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职称材料
题名
5种经济海胆线粒体16S rRNA基因片段的序列分析
被引量：
8
1
作者
刘晓慧
黄佳琪
周遵春
董颖
机构
辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室辽宁省应用海洋生物技术开放实验室辽宁
青岛市城阳区
海洋
与渔业局
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2007年第6期331-334,共4页
基金
辽宁省自然科学基金资助项目(20042127)
大连市优秀青年科技人才基金资助项目(S2006J23JH029)
文摘
对光棘球海胆、中间球海胆、马粪海胆,海刺猬和紫海胆线粒体DNA 16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到395 bp的可信片段。通过ClustalX 1.83和Mega 3.0软件对所得线粒体16SrRNA片段序列进行比较,共检测到118个碱基变异,其中简约信息位点为33个。应用Mega 3.0计算各种间的相对遗传距离,以糙海参为外类群,得到NJ系统树和MP系统树,系统树各分支的置信度由“Bootstrap”1000次循环检验。结果表明,马粪海胆与光棘球海胆的亲缘关系较近,其次为中间球海胆,而紫海胆、海刺猬与这3种海胆的关系相对较远。
关键词
光棘球海胆
中间球海胆
海刺猬
马粪海胆
紫海胆
线粒体DNA
16S
RRNA基因
序列分析
Keywords
Strongylocentrotus nudus
S. intermedius
Glyptaidaris crenularis
mtDNA
16S rRNA
sequence analysis
分类号
S968.9 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
5种经济海胆线粒体16S rRNA基因片段的序列分析
刘晓慧
黄佳琪
周遵春
董颖
《水产科学》
CAS
北大核心
2007
8
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