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基于暴露组-脂质组关联研究的代谢相关脂肪性肝病血清中外源性化学物质的风险分析被引量：2: 1; 作者陈倩倩由蕾 +4 位作者管朋维方成男秦望舒刘心昱许国旺《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期164-175,共12页; 代谢相关脂肪性肝病是当前常见的一种肝脏疾病,在世界范围内的患病率高达25%,严重危害人类健康并对社会造成巨大的经济负担。越来越多的研究表明慢性非传染性疾病的发生是环境暴露与遗传因素共同作用的结果,环境污染是其不可小觑的健康... 展开更多; 关键词代谢相关脂肪性肝病暴露组学脂质组学组学关联研究; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于色谱-质谱联用的暴露组学分析方法和研究范式的新进展被引量：2: 2; 作者由蕾孙国皓 +2 位作者于迪刘心昱许国旺《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期109-119,共11页; 人类疾病的发生、发展受环境因素和遗传因素的共同影响,仅从遗传基因角度开展研究,不能有效地揭示疾病的发生机制,因而近年来环境因素对疾病发生、发展的影响受到了学界的广泛关注。暴露组学关注个体一生中所有暴露因素的测量,以及这些... 展开更多; 关键词色谱-质谱暴露组学代谢组学多组学关联研究综述; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于修饰组和探针分子的重要途径代谢物筛选和注释新方法: 3; 作者李在芳郑福建 +6 位作者夏悦怡张秀琼王鑫欣赵春霞赵欣捷路鑫许国旺《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期788-796,共9页; 植物次生代谢物在抵御生物/非生物胁迫、生物间互作以及信息传递等方面发挥重要作用,次生代谢途径解析对植物分子育种、天然产物合成等方面具有重要意义。液相色谱-高分辨串联质谱(LC-HRMS/MS)为次生代谢物鉴定及途径表征提供了技术手... 展开更多; 关键词液相色谱-高分辨串联质谱修饰代谢组次生代谢物探针分子注释; 在线阅读下载PDF 职称材料

深度学习在质谱成像数据分析中的应用研究进展被引量：2: 4; 作者黄冬冬刘心昱许国旺《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期669-680,共12页; 质谱成像(MSI)是一种用于表征化合物空间分布特征的方法。随着采集方式的多样化发展和灵敏度等的不断提高,该方法产生的数据总量和分析复杂度呈指数增长,给数据后处理带来了诸多挑战。深度学习(DL)是一种在数据分析和图像识别中广泛应... 展开更多; 关键词质谱成像深度学习神经网络数据分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于质谱的单细胞分析技术研究新进展: 5; 作者尤穆英楠刘心昱 +1 位作者石先哲许国旺《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期316-331,I0001,共17页; 细胞是生物体最基本的结构和功能单位。近年来,人们对细胞异质性的关注越来越多。为了分析细胞的这种异质性,避免单细胞信息被群体细胞的平均值所淹没,单细胞分析技术不断发展起来。由于单细胞的体积小,内含物质含量低且种类繁多,某些... 展开更多; 关键词单细胞电喷雾电离质谱(ESI-MS) 激光解吸电离质谱(LDI-MS) 二次离子质谱(SIMS) 电感耦合等离子体质谱(ICP-MS); 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于暴露组-脂质组关联研究的代谢相关脂肪性肝病血清中外源性化学物质的风险分析被引量：2: 1; 作者陈倩倩由蕾管朋维方成男秦望舒刘心昱许国旺; 机构中国科学院大连化学物理研究所中国科学院大学中国医科大学; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期164-175,共12页; 基金中国科学院青年创新促进会(2021186) 中国科学院大连化学物理研究所创新研究青年基金(DICP I202225) 国家自然科学基金项目(32100626)。; 文摘代谢相关脂肪性肝病是当前常见的一种肝脏疾病,在世界范围内的患病率高达25%,严重危害人类健康并对社会造成巨大的经济负担。越来越多的研究表明慢性非传染性疾病的发生是环境暴露与遗传因素共同作用的结果,环境污染是其不可小觑的健康风险因素。为了探究环境暴露对代谢相关脂肪性肝病风险及暴露效应,本研究利用超高效液相色谱-串联质谱(UHPLC-MS/MS)的靶向暴露组学和超高效液相色谱-高分辨质谱(UHPLC-HRMS)的非靶向脂质组学技术分别分析了代谢相关脂肪性肝病患者血清中外源性化学物质的暴露特征和内源性脂质代谢物的扰动,结合暴露组-脂质组关联分析,在脂代谢水平上探究环境暴露引起的代谢相关脂肪性肝病的风险及暴露效应。研究发现,代谢相关脂肪性肝病患者体内外源性化学物质与代谢相关脂肪性肝病的风险增加有关,其中氟虫腈砜(fipronil sulphone)、马拉硫磷二羧酸(malathion dicarboxylic acid)和邻苯二甲酸单环己酯(monocyclohexyl phthalate)与单纯性脂肪肝风险呈正相关,氟虫腈砜(fipronil sulphone)、安赛蜜(acesulfame potassium)、全氟辛酸(PFOA)、全氟壬酸(PFNA)、全氟十一酸(PFUnDA)和4-羟基二苯甲酮(4-hydroxybenzophenone)以及3,5-二叔丁基-4-羟基苯甲酸(DBPOB)与合并代谢性疾病的脂肪肝风险呈正相关。单纯性脂肪肝患者和合并代谢性疾病的脂肪肝患者的脂代谢发生了显著的改变,神经酰胺(Cer)、甘油三酯(TG)和甘油二酯(DG)显著升高,这些DG和TG的酰基碳数分别为32~40和35~60,且两者均表现为多不饱和的脂质分子的变化为主。大多数的脂质效应标志物与外源性化学物质残留呈正相关,并与疾病风险增加有关。本研究可以为环境化学物质暴露与代谢相关脂肪性肝病的关联与机制研究提供科学依据。; 关键词代谢相关脂肪性肝病暴露组学脂质组学组学关联研究; Keywords metabolic associated fatty liver disease(MAFLD) exposomics lipidomics omics-wide association study; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于色谱-质谱联用的暴露组学分析方法和研究范式的新进展被引量：2: 2; 作者由蕾孙国皓于迪刘心昱许国旺; 机构中国科学院大连化学物理研究所中国科学院大学; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期109-119,共11页; 基金中国科学院青年创新促进会(2021186) 中国科学院大连化学物理研究所创新研究青年基金(DICP I202225)。; 文摘人类疾病的发生、发展受环境因素和遗传因素的共同影响,仅从遗传基因角度开展研究,不能有效地揭示疾病的发生机制,因而近年来环境因素对疾病发生、发展的影响受到了学界的广泛关注。暴露组学关注个体一生中所有暴露因素的测量,以及这些暴露因素与疾病建立联系的机制,为推动人类健康与环境因素之间的关系研究提供了新思路。由于外源性化学物质具有数量众多、理化性质各异、在体内含量极低等特性,对其进行测量会面临诸多挑战。基于色谱-质谱联用的暴露组分析技术兼具色谱的高效分离能力和质谱的高分辨率、高灵敏度特性,可以实现暴露组的高覆盖、高通量、高灵敏度检测,已成为暴露组学研究的主要分析技术。基于色谱-质谱联用的暴露组学分析方法主要包括靶向定量分析、可疑物筛查和非靶向筛查。除此之外,为了探究环境暴露与疾病发生、发展的关系,研究者发展了包括暴露组关联研究、混合暴露研究以及暴露组学与多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)关联研究等的多种研究范式,这些方法的出现为暴露组学研究带来了空前的发展前景。本文综述了基于色谱-质谱联用技术的暴露组学分析方法和暴露组学研究范式,并对暴露组学的未来发展进行了展望。; 关键词色谱-质谱暴露组学代谢组学多组学关联研究综述; Keywords chromatography-mass spectrometry exposomics metabolomics multi-omics association study review; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于修饰组和探针分子的重要途径代谢物筛选和注释新方法: 3; 作者李在芳郑福建夏悦怡张秀琼王鑫欣赵春霞赵欣捷路鑫许国旺; 机构中国科学院大连化学物理研究所中国科学院大学; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期788-796,共9页; 基金国家自然科学基金项目(21874132,22074145) 中国科学院大连化学物理研究所科研创新基金项目(DICP I202004).; 文摘植物次生代谢物在抵御生物/非生物胁迫、生物间互作以及信息传递等方面发挥重要作用,次生代谢途径解析对植物分子育种、天然产物合成等方面具有重要意义。液相色谱-高分辨串联质谱(LC-HRMS/MS)为次生代谢物鉴定及途径表征提供了技术手段。非靶向LC-HRMS/MS方法可获得丰富的质谱信号,包括一级质谱和二级质谱(MS,MS/MS),但受质谱数据库规模以及次生代谢物复杂性的制约,次生代谢物注释十分困难。该研究以玉米叶片中苯丙烷途径代谢物为例,发展用于非靶向代谢组数据中重要途径代谢物的高效筛选和注释新方法。首先,利用公共代谢途径数据库及文献获取参与苯丙烷代谢途径的61种修饰反应类型,进而从非靶向实验数据中筛选出修饰代谢组。其次,获取开源串联质谱数据中的苯丙烷类化合物作为探针分子,构建探针分子质谱数据库。将探针分子与修饰代谢组共建分子网络,锁定目标途径代谢物并注释结构。该方法在正、负离子模式下分别筛选出玉米叶片中392个和417个苯丙烷途径候选代谢物,去冗余后共注释出129个代谢物,涉及苯丙烷代谢的主要分支途径,如黄酮途径的8个类黄酮、19个氧苷类黄酮和32个碳苷类黄酮,31个羟基肉桂酸途径代谢物以及22个木脂素途径代谢物;其中26个在PubChem和SciFinder数据库中未见收录。该研究利用探针分子结合修饰组可快速锁定途径代谢物,且有助于快速、准确的网络传播注释,可显著提高目标途径代谢物筛选与注释效率,为植物次生代谢途径的深入解析提供分析手段。; 关键词液相色谱-高分辨串联质谱修饰代谢组次生代谢物探针分子注释; Keywords liquid chromatography-high resolution tandem mass spectrometry(LC-HRMS/MS) modified metabolome secondary metabolites probe molecule annotation; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名深度学习在质谱成像数据分析中的应用研究进展被引量：2: 4; 作者黄冬冬刘心昱许国旺; 机构中国科学院大连化学物理研究所大连理工大学化学学院; 出处《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期669-680,共12页; 基金中国科学院青年创新促进会基金(2021186).; 文摘质谱成像(MSI)是一种用于表征化合物空间分布特征的方法。随着采集方式的多样化发展和灵敏度等的不断提高,该方法产生的数据总量和分析复杂度呈指数增长,给数据后处理带来了诸多挑战。深度学习(DL)是一种在数据分析和图像识别中广泛应用的强大工具,对于质谱成像数据分析具有巨大潜力。本文综述了深度学习在质谱成像数据分析中的研究现状、应用进展和面临的挑战,重点涵盖数据预处理、图像重构、聚类分析和多模式融合4个核心阶段;还列举说明了深度学习与质谱成像技术相结合在肿瘤区域划分和亚型诊断等研究中的高效应用。本综述对该研究方向未来的发展趋势进行了展望,旨在促进人工智能与质谱分析更好的结合。; 关键词质谱成像深度学习神经网络数据分析; Keywords mass spectrometry imaging(MSI) deep learning neural network data analysis; 分类号 O658 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于质谱的单细胞分析技术研究新进展: 5; 作者尤穆英楠刘心昱石先哲许国旺; 机构中国科学院大连化学物理研究所辽宁省代谢组学重点实验室中国科学院大学; 出处《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期316-331,I0001,共17页; 基金国家重点研发计划项目(2022YFC3401200) 国家自然科学基金项目(22274156)。; 文摘细胞是生物体最基本的结构和功能单位。近年来,人们对细胞异质性的关注越来越多。为了分析细胞的这种异质性,避免单细胞信息被群体细胞的平均值所淹没,单细胞分析技术不断发展起来。由于单细胞的体积小,内含物质含量低且种类繁多,某些物质在细胞内的变化迅速,分析过程中不同物质之间相互干扰,造成了单细胞分析极具挑战性。基于质谱的单细胞分析技术具有通用性强、无需标记、高灵敏度、高分辨率、高选择性的优点,已逐渐在单细胞分析技术中脱颖而出,成为单细胞分析的理想工具。本文系统地总结了近5年来基于质谱的单细胞分析技术的最新进展,包括电喷雾电离质谱、激光解吸电离质谱、二次离子质谱、电感耦合等离子体质谱,并对未来的研究和技术方向进行展望,希望为单细胞质谱分析技术的研究提供参考。; 关键词单细胞电喷雾电离质谱(ESI-MS) 激光解吸电离质谱(LDI-MS) 二次离子质谱(SIMS) 电感耦合等离子体质谱(ICP-MS); Keywords single-cell electrospray ionization mass spectrometry(ESI-MS) laser desorption ionization mass spectrometry(LDI-MS) secondary ion mass spectrometry(SIMS) inductively coupled plasma mass spectrometry(ICP-MS); 分类号 O657.63 [理学—分析化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于暴露组-脂质组关联研究的代谢相关脂肪性肝病血清中外源性化学物质的风险分析	陈倩倩由蕾管朋维方成男秦望舒刘心昱许国旺	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	基于色谱-质谱联用的暴露组学分析方法和研究范式的新进展	由蕾孙国皓于迪刘心昱许国旺	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	基于修饰组和探针分子的重要途径代谢物筛选和注释新方法	李在芳郑福建夏悦怡张秀琼王鑫欣赵春霞赵欣捷路鑫许国旺	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2022	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	深度学习在质谱成像数据分析中的应用研究进展	黄冬冬刘心昱许国旺	《色谱》 CAS CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基于质谱的单细胞分析技术研究新进展	尤穆英楠刘心昱石先哲许国旺	《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料