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越南北部6省2020年~2021年非洲猪瘟病毒的遗传演化分析
1
作者
阮氏璧凤
李标
+4 位作者
袁海峰
胡庭俊
邓武黄
长英德
韦英益
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025年第5期452-457,479,共7页
非洲猪瘟病毒(ASFV)自2019年在越南被发现以来,迅速在越南全国范围内传播。为了解ASFV在越南北部的流行及其流行株的遗传变异情况,本研究采集越南北部6省的250份疑似ASFV感染病死猪的组织病料样品,采用荧光定量PCR(qPCR)方法检测ASFV,...
非洲猪瘟病毒(ASFV)自2019年在越南被发现以来,迅速在越南全国范围内传播。为了解ASFV在越南北部的流行及其流行株的遗传变异情况,本研究采集越南北部6省的250份疑似ASFV感染病死猪的组织病料样品,采用荧光定量PCR(qPCR)方法检测ASFV,进一步采用PCR扩增ASFV阳性组织样品中的B646L(p72)基因、EP402R(CD2v)基因和I73R~I329L基因的IGR区域,并测序后采用DNAStar 7.0的MegAlign软件比对分析上述3种基因序列的同源性;每个省均选取10份阳性样品的B646L基因和EP402R基因序列分别构建系统进化树,并对I73R~I329L基因的IGR区进行核苷酸差异分析。结果显示,250份组织样品均为ASFV阳性,本研究获得的所有B646L基因和EP402R基因之间的同源性均达100%,与GenBank中ASFV相应基因序列的同源性分别为95.1%~100%、66.9%~99.7%,其中B646L基因与中国ASFV分离株相应基因序列的同源性最高,与2012年乌干达ASFV分离株该基因序列的同源性最低,而与EP402R基因序列的同源性最高的是格鲁吉亚、俄罗斯ASFV分离株,同源性最低的是葡萄牙ASFV分离株。基于B646L和EP402R基因构建的遗传进化树结果均显示,本研究获得的上述基因均与中国、格鲁吉亚ASFV分离株相应基因的亲缘性更近,属于基因型II,血清型SG8。对IGR区的I73R~I329L基因进行核苷酸差异分析结果显示,在2020年采集的ASFV阳性样品属于ASFV的IGR II型变异体,至少有IGR I和IGR II型2种ASFV在越南传播。本研究揭示了越南早期ASFV的变化,对预防ASFV的传播具有重要的参考意义。
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关键词
非洲猪瘟
B646L基因
EP402R基因
I73R~I329L基因
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题名
越南北部6省2020年~2021年非洲猪瘟病毒的遗传演化分析
1
作者
阮氏璧凤
李标
袁海峰
胡庭俊
邓武黄
长英德
韦英益
机构
广西大学动物科学技术学院/广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室
越南
凉山省畜牧
兽医
分局疾病控制办公室
越南国家兽医研究所
出处
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025年第5期452-457,479,共7页
基金
越南科技部资助课题“越南非洲猪瘟流行病学研究及防控措施建议”
南宁市科学研究与技术开发计划项目(20232039)“规模猪场核心种猪群主要疫病净化关键技术研究与示范”。
文摘
非洲猪瘟病毒(ASFV)自2019年在越南被发现以来,迅速在越南全国范围内传播。为了解ASFV在越南北部的流行及其流行株的遗传变异情况,本研究采集越南北部6省的250份疑似ASFV感染病死猪的组织病料样品,采用荧光定量PCR(qPCR)方法检测ASFV,进一步采用PCR扩增ASFV阳性组织样品中的B646L(p72)基因、EP402R(CD2v)基因和I73R~I329L基因的IGR区域,并测序后采用DNAStar 7.0的MegAlign软件比对分析上述3种基因序列的同源性;每个省均选取10份阳性样品的B646L基因和EP402R基因序列分别构建系统进化树,并对I73R~I329L基因的IGR区进行核苷酸差异分析。结果显示,250份组织样品均为ASFV阳性,本研究获得的所有B646L基因和EP402R基因之间的同源性均达100%,与GenBank中ASFV相应基因序列的同源性分别为95.1%~100%、66.9%~99.7%,其中B646L基因与中国ASFV分离株相应基因序列的同源性最高,与2012年乌干达ASFV分离株该基因序列的同源性最低,而与EP402R基因序列的同源性最高的是格鲁吉亚、俄罗斯ASFV分离株,同源性最低的是葡萄牙ASFV分离株。基于B646L和EP402R基因构建的遗传进化树结果均显示,本研究获得的上述基因均与中国、格鲁吉亚ASFV分离株相应基因的亲缘性更近,属于基因型II,血清型SG8。对IGR区的I73R~I329L基因进行核苷酸差异分析结果显示,在2020年采集的ASFV阳性样品属于ASFV的IGR II型变异体,至少有IGR I和IGR II型2种ASFV在越南传播。本研究揭示了越南早期ASFV的变化,对预防ASFV的传播具有重要的参考意义。
关键词
非洲猪瘟
B646L基因
EP402R基因
I73R~I329L基因
Keywords
African swine fever
B646L gene
EP402R gene
I73R-I329L gene
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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1
越南北部6省2020年~2021年非洲猪瘟病毒的遗传演化分析
阮氏璧凤
李标
袁海峰
胡庭俊
邓武黄
长英德
韦英益
《中国预防兽医学报》
北大核心
2025
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