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基于核转录因子-κB信号通路探讨花青素缓解反刍奶畜乳腺炎的作用机制
1
作者
卢琦
周迪
+1 位作者
班超
田兴舟
《动物营养学报》
北大核心
2025年第6期3510-3518,共9页
抑制宿主核转录因子-κB(NF-κB)信号通路活性、降低乳腺组织活性氧积聚是缓解反刍奶畜乳腺炎的可行方案。花青素是植物体内重要的次级代谢产物,不仅具有较高的自由基清除能力,且具有极强的抗炎症作用,是预防反刍奶畜乳腺炎的高效绿色...
抑制宿主核转录因子-κB(NF-κB)信号通路活性、降低乳腺组织活性氧积聚是缓解反刍奶畜乳腺炎的可行方案。花青素是植物体内重要的次级代谢产物,不仅具有较高的自由基清除能力,且具有极强的抗炎症作用,是预防反刍奶畜乳腺炎的高效绿色添加剂。基于此,本文主要综述了反刍动物常见饲料中花青素含量、NF-κB在乳腺炎中的作用机制及花青素介导NF-κB信号通路缓解反刍奶畜乳腺炎的作用机制,旨在为预防反刍奶畜乳腺炎提供科学依据,对绿色畜牧业的发展也有重要作用。
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关键词
花青素
抗炎性
乳腺炎
反刍奶畜
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职称材料
基于转录组测序的关岭牛肌肉生长发育关键基因筛选与鉴定
被引量：
1
2
作者
周迪
赵忠海
+7 位作者
王府
杨蓉
王燕
敖叶
谢玲玲
陈秋生
田兴舟
李波
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期611-622,共12页
【目的】基于转录组测序挖掘出贵州关岭牛肌肉生长发育关键基因,为后续培育贵州优质肉牛品种提供理论依据。【方法】选取3头健康且体重相近的24月龄成年关岭牛,屠宰后采集其心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、大腿肌及肩峰等组...
【目的】基于转录组测序挖掘出贵州关岭牛肌肉生长发育关键基因,为后续培育贵州优质肉牛品种提供理论依据。【方法】选取3头健康且体重相近的24月龄成年关岭牛,屠宰后采集其心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、大腿肌及肩峰等组织样品,采用TRIzol法提取各组织总RNA,构建cDNA文库后进行转录组测序,通过生物信息学手段筛选出不同样品间的差异表达基因(DEGs),结合GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析挖掘出关岭牛肌肉生长发育相关候选基因,再经实时荧光定量PCR对候选基因进行验证。【结果】测序样品有效序列(Clean reads)比对至参考基因组序列的平均比对率为90.76%,检测到26367个新转录本(有编码潜能的转录本19659个,非编码转录本6708个);在各组织中检测到共表达基因53912个,其中已知基因51688个、预测新基因2224个;GO功能注释分析发现这些共表达基因主要发挥生物调节、代谢过程、生物膜组成、催化活性和转录调节活性等功能。通过DEGseq检测,最终筛选获得16个与肌肉生长发育相关的DEGs(QKI、CHKB、MYBPC1、MBNL1、MYH11、MYLK2、TPM3、NEXN、EZH2、TNNT3、PPARGC1A、SGCA、DMPK、FOXP1、FLNB和TNS2),主要参与内吞作用、心肌收缩、癌症、代谢及MAPK信号通路。实时荧光定量PCR验证结果显示,筛选出的16个DEGs在关岭牛背最长肌或肩峰中高表达,与转录组测序结果一致。【结论】基于转录组测序从关岭牛各组织中筛选出16个与肌肉生长发育相关的DEGs,主要在生物调节、代谢过程、细胞成分、催化和转录调节等方面发挥功能作用,可作为开展关岭牛肌肉生长发育遗传机制研究的候选基因。
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关键词
关岭牛
肌肉生长发育
肌肉性状
差异表达基因(DEGs)
转录组测序
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职称材料
题名
基于核转录因子-κB信号通路探讨花青素缓解反刍奶畜乳腺炎的作用机制
1
作者
卢琦
周迪
班超
田兴舟
机构
贵州
大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
贵州
大学动物科学学院
贵州省种畜种质禽测定中心
泰国苏兰拉里理工大学动物生产与创新系
出处
《动物营养学报》
北大核心
2025年第6期3510-3518,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32302779,32260849)
贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2022]重点033)
+2 种基金
贵州省基础研究计划(自然科学)青年引导项目(黔科合基础-[2024]青年106)
贵州省教育厅高等学校自然科学研究项目(黔教技[2024]33号)
贵州大学基础研究项目(贵大基础[2023]16号)。
文摘
抑制宿主核转录因子-κB(NF-κB)信号通路活性、降低乳腺组织活性氧积聚是缓解反刍奶畜乳腺炎的可行方案。花青素是植物体内重要的次级代谢产物,不仅具有较高的自由基清除能力,且具有极强的抗炎症作用,是预防反刍奶畜乳腺炎的高效绿色添加剂。基于此,本文主要综述了反刍动物常见饲料中花青素含量、NF-κB在乳腺炎中的作用机制及花青素介导NF-κB信号通路缓解反刍奶畜乳腺炎的作用机制,旨在为预防反刍奶畜乳腺炎提供科学依据,对绿色畜牧业的发展也有重要作用。
关键词
花青素
抗炎性
乳腺炎
反刍奶畜
Keywords
anthocyanins
anti-inflammatory
mastitis
dairy ruminant
分类号
S816 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
基于转录组测序的关岭牛肌肉生长发育关键基因筛选与鉴定
被引量：
1
2
作者
周迪
赵忠海
王府
杨蓉
王燕
敖叶
谢玲玲
陈秋生
田兴舟
李波
机构
贵州省种畜种质禽测定中心
遵义市畜牧渔业站
贵州
大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
贵州省
畜
禽
遗传资源管理站
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期611-622,共12页
基金
贵州省高层次创新型人才培育项目(黔科合平台人才-GCC[2023]028)
贵州省农业生产发展项目(黔农牧[2024]010号)。
文摘
【目的】基于转录组测序挖掘出贵州关岭牛肌肉生长发育关键基因,为后续培育贵州优质肉牛品种提供理论依据。【方法】选取3头健康且体重相近的24月龄成年关岭牛,屠宰后采集其心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、大腿肌及肩峰等组织样品,采用TRIzol法提取各组织总RNA,构建cDNA文库后进行转录组测序,通过生物信息学手段筛选出不同样品间的差异表达基因(DEGs),结合GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析挖掘出关岭牛肌肉生长发育相关候选基因,再经实时荧光定量PCR对候选基因进行验证。【结果】测序样品有效序列(Clean reads)比对至参考基因组序列的平均比对率为90.76%,检测到26367个新转录本(有编码潜能的转录本19659个,非编码转录本6708个);在各组织中检测到共表达基因53912个,其中已知基因51688个、预测新基因2224个;GO功能注释分析发现这些共表达基因主要发挥生物调节、代谢过程、生物膜组成、催化活性和转录调节活性等功能。通过DEGseq检测,最终筛选获得16个与肌肉生长发育相关的DEGs(QKI、CHKB、MYBPC1、MBNL1、MYH11、MYLK2、TPM3、NEXN、EZH2、TNNT3、PPARGC1A、SGCA、DMPK、FOXP1、FLNB和TNS2),主要参与内吞作用、心肌收缩、癌症、代谢及MAPK信号通路。实时荧光定量PCR验证结果显示,筛选出的16个DEGs在关岭牛背最长肌或肩峰中高表达,与转录组测序结果一致。【结论】基于转录组测序从关岭牛各组织中筛选出16个与肌肉生长发育相关的DEGs,主要在生物调节、代谢过程、细胞成分、催化和转录调节等方面发挥功能作用,可作为开展关岭牛肌肉生长发育遗传机制研究的候选基因。
关键词
关岭牛
肌肉生长发育
肌肉性状
差异表达基因(DEGs)
转录组测序
Keywords
Guanling cattle
muscle growth and development
muscle traits
differentially expressed genes(DEGs)
transcriptome sequencing
分类号
S823.81 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于核转录因子-κB信号通路探讨花青素缓解反刍奶畜乳腺炎的作用机制
卢琦
周迪
班超
田兴舟
《动物营养学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于转录组测序的关岭牛肌肉生长发育关键基因筛选与鉴定
周迪
赵忠海
王府
杨蓉
王燕
敖叶
谢玲玲
陈秋生
田兴舟
李波
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
已选择
0
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