基于SNP分子标记分析国内地方晒晾烟遗传多样性

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作者 万菊芬 徐腾航 +7 位作者 曹领改 张吉顺 刘杰 张洁 王仁刚 任民 杨志晓 余世洲 《中国烟草学报》 北大核心 2025年第5期60-70,共11页

【目的】探究国内地方晒晾烟品种之间的亲缘关系及遗传多样性,促进烟草种质的创新和高效利用。【方法】利用烟草20K SNP芯片(Ta-LD-SC)对118份国内晒晾烟种质,7份国外晒烟种质和10份代表性烤烟品种进行基因分型,并通过Plink、Admixture... 【目的】探究国内地方晒晾烟品种之间的亲缘关系及遗传多样性,促进烟草种质的创新和高效利用。【方法】利用烟草20K SNP芯片(Ta-LD-SC)对118份国内晒晾烟种质,7份国外晒烟种质和10份代表性烤烟品种进行基因分型,并通过Plink、Admixture、Genodiv等软件开展群体结构和遗传多样性分析。【结果】筛选出的15806个高质量多态性SNP位点覆盖烟草基因组约90%区域,且分布相对均匀,各SNP位点的多态性信息含量(PIC)平均值为0.285,变幅为0.022~0.375,平均最小等位基因频率(MAF)为0.257。依据群体结构、进化树和主成分分析,135份供试烟草材料可分为5个亚群(G1~G5),其中G1~G3为国内地方晒晾烟,G4主要为美国选育晒烟品种,G5全部为烤烟品种。各种质间平均状态同源系数(IBS)为0.643,所有种质整体有效等位基因数目(Ne)为1.294,观察杂合度(Ho)为0.005,亚群内杂合度(Hs)为0.238,近交系数(Gis)为0.977,遗传多样性指数(Diu)为0.922,校正香农指数(Shu)为1.28。各亚群间Nei's遗传距离(Nei's D)范围为0.062~1.253,其中G1~G3亚群间遗传距离均小于0.18,但这3个亚群与G4、G5亚群的遗传距离都大于0.30,特别是G1与G5的遗传距离为1.253。【结论】国内晾晒烟(G1~G3)与美国选育晒烟材料(G4)及当前代表主栽烤烟品种及其骨干亲本(G5)比较,具有相对较大的遗传多样性,但因地理分离原因,在遗传基础上出现了明显分化,后期可在G1亚群中选择优良代表性种质作为烟草育种的亲本材料,以拓宽我国主栽烤烟品种的遗传背景及保护濒危的晒晾烟种质基因资源。 展开更多

关键词 晒晾烟 亲缘关系 遗传多样性 遗传结构 SNP标记

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烟草转基因研究常用遗传元件筛查策略 被引量：2

2

作者 余婧 张孝廉 +2 位作者 赵丹 邹颉 赵杰宏 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期78-83,共6页

通过检索国内外近10年烟草转基因研究的相关文献,建立了转基因烟草常用转化遗传元件的数据库,统计了每个遗传元件及组合元件的使用频率后,发现利用7种遗传元件,包括:启动子P-35S、标记基因NPT II、HPT、Bar和aadA、报告基因GUS及终止子T... 通过检索国内外近10年烟草转基因研究的相关文献,建立了转基因烟草常用转化遗传元件的数据库,统计了每个遗传元件及组合元件的使用频率后,发现利用7种遗传元件,包括:启动子P-35S、标记基因NPT II、HPT、Bar和aadA、报告基因GUS及终止子T-NOS作为靶标元件组合,能使目前烟草转基因事件的理论筛查率达到100%,从而构建出转基因烟草的优化筛查策略。 展开更多

关键词 转基因烟草 遗传元件 转基因筛查

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烟草碳氮代谢及其与烟草品质、抗逆性的关系研究进展 被引量：7

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作者 赵会纳 高少凡 +5 位作者 陈鹏 吴伟 顾勇 张思聂 许本波 夏海乾 《江西农业学报》 CAS 2023年第6期10-15,共6页

综述了烤烟碳氮代谢途径和关键酶的研究进展,研究了移栽期、光温、施肥、外源小分子有机物对碳氮代谢及烟叶品质的影响,分析了碳氮代谢与烟草抗逆性的关系,并展望了碳氮代谢的重点研究方向。阐明了碳氮代谢协调平衡分子机理机制、筛选... 综述了烤烟碳氮代谢途径和关键酶的研究进展,研究了移栽期、光温、施肥、外源小分子有机物对碳氮代谢及烟叶品质的影响,分析了碳氮代谢与烟草抗逆性的关系,并展望了碳氮代谢的重点研究方向。阐明了碳氮代谢协调平衡分子机理机制、筛选碳氮代谢关键基因以及应用碳氮代谢及抗逆性的关系,以期推动碳高效、氮高效的高光合效能、高品质的烤烟新品种选育,达到降本增效,实现烤烟生产可持续发展。 展开更多

关键词 烤烟 碳氮代谢 关键酶 品质 抗逆性

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NtSPX4基因敲除对烟草苗期磷吸收和生长发育的影响研究 被引量：1

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作者 单玉静 王召军 +5 位作者 程泽华 余婧 雷波 闫筱筱 张洪映 崔红 《中国烟草学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期78-85,共8页

【目的】为探究NtSPX4基因在烟草磷吸收转运中的作用。【方法】同源克隆了烟草(Nicotiana tabacum L.)K326中NtSPX4基因,通过CRISPR/Cas9技术获得了NtSPX4-1和NtSPX4-2均发生纯合突变的K326株系S_(42),在不同磷浓度的Hoagland溶液培养... 【目的】为探究NtSPX4基因在烟草磷吸收转运中的作用。【方法】同源克隆了烟草(Nicotiana tabacum L.)K326中NtSPX4基因,通过CRISPR/Cas9技术获得了NtSPX4-1和NtSPX4-2均发生纯合突变的K326株系S_(42),在不同磷浓度的Hoagland溶液培养条件下,对S_(42)株系的生长发育、物质积累、磷吸收相关基因表达及有效磷含量变化进行研究。【结果】烟草基因组中存在两个NtSPX4同源基因,分别命名为NtSPX4-1和NtSPX4-2。其中NtSPX4-1 CDS全长为924 bp,编码氨基酸序列与祖先种林烟草NsylSPX4相同;NtSPX4-2 CDS全长为933 bp,编码氨基酸序列与祖先种绒毛烟草NtomSPX4相同。S_(42)株系中NtSPX4-1和NtSPX4-2均在第52 bp处插入一个碱基T,导致NtSPX4蛋白翻译提前终止。在标准Hoagland溶液培养条件下,S_(42)株系的生长发育与对照无明显差异;在高磷条件下,S_(42)株系生长发育受到抑制,生物量较对照降低了约45%;在低磷条件下,S_(42)株系生长势优于对照,生物量较对照提高了约39%。RT-PCR分析表明,在正常磷条件下,S_(42)株系中磷转运蛋白基因NtPT1和NtPT2的表达水平与对照基本一致,在高磷和低磷条件下,S_(42)株系中NtPT1和NtPT2基因表达水平均显著高于对照K326。有效磷检测分析表明,不同磷浓度条件下,S_(42)株系中有效磷含量均极显著高于对照K326。【结论】NtSPX4基因敲除在低磷条件下可以促进烟株的生长发育,在高磷条件下对烟株生长发育有一定的抑制作用,NtSPX4在烟草磷吸收转运中具有负向调控作用。 展开更多

关键词 烟草 NtSPX4 基因编辑 磷胁迫 磷转运蛋白

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不同海拔高度烟草叶片组织结构和质体色素特性研究 被引量：4

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作者 杨志晓 李雨 +7 位作者 王志红 赵二卫 刘红峰 杨乘 殷强 王轶 任学良 王仁刚 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第11期133-136,共4页

以红花大金元为试验材料,采用大田试验研究烟叶的组织结构和质体色素在不同海拔高度下的变化特征。结果显示,叶片在达到长度20 cm前,高、低海拔烟叶的组织学厚度和栅栏细胞密度差异均不明显;但在达到叶长20 cm后,高海拔烟叶的组织厚度较... 以红花大金元为试验材料,采用大田试验研究烟叶的组织结构和质体色素在不同海拔高度下的变化特征。结果显示,叶片在达到长度20 cm前,高、低海拔烟叶的组织学厚度和栅栏细胞密度差异均不明显;但在达到叶长20 cm后,高海拔烟叶的组织厚度较薄,而栅栏细胞较密。高海拔烟叶的叶绿素a、叶绿素b含量和叶绿素总量在叶长50 cm前均较低,但烟叶在高海拔条件下具有较高含量的类胡萝卜素,且叶绿素a/叶绿素b、类胡萝卜素/叶绿素比值也较大。研究表明,高、低海拔高度条件下烟叶的组织结构和质体色素含量明显不同,造成细胞结构和光合作用差异明显,从而导致不同海拔高度烟叶的内在质量风格出现差异。 展开更多

关键词 烟草 叶片 海拔高度 组织结构 质体色素 烟叶质量 风格特色

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水杨酸对打顶后烟草根系钾吸收的调控作用研究 被引量：1

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作者 杨亚 赵杰宏 +2 位作者 姜骁 母应春 苏伟 《山地农业生物学报》 2016年第1期45-50,共6页

为探索打顶后烟草根系钾素的分配和转移规律,试验研究了打顶及施用不同浓度水杨酸对根系钾吸收及钾运输相关基因表达水平的影响。结果发现,打顶减少烟草根系对钾的吸收,而打顶同时施加水杨酸会影响根系吸收钾,其中5μmol/L的水杨酸能提... 为探索打顶后烟草根系钾素的分配和转移规律,试验研究了打顶及施用不同浓度水杨酸对根系钾吸收及钾运输相关基因表达水平的影响。结果发现,打顶减少烟草根系对钾的吸收,而打顶同时施加水杨酸会影响根系吸收钾,其中5μmol/L的水杨酸能提高打顶后根系钾吸收,而施加较高浓度水杨酸则效果相反。另外,各处理前后根中钾运输基因"NTORK1/HAK1"表达比值差异和根系钾吸收能力差异基本一致,可能受水杨酸的调控,可用作打顶后烟草钾素的分配和转移的间接评价指标。 展开更多

关键词 烟草 钾 打顶 水杨酸

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烟草白粉病抗性连锁分子标记开发及育种利用 被引量：2

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作者 张孝廉 张吉顺 +2 位作者 贾蒙骜 张莉莉 曹领改 《中国烟草学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期45-51,共7页

【目的】提高烟草白粉病抗病育种效率,有效防止抗性丢失。【方法】通过烟草种质资源白粉病抗性鉴定获得抗源材料,利用F2和BCF1分离群体进行白粉病抗性遗传规律和分子标记连锁分析,开发与烟草白粉病抗性紧密连锁的分子标记。【结果】获... 【目的】提高烟草白粉病抗病育种效率,有效防止抗性丢失。【方法】通过烟草种质资源白粉病抗性鉴定获得抗源材料,利用F2和BCF1分离群体进行白粉病抗性遗传规律和分子标记连锁分析,开发与烟草白粉病抗性紧密连锁的分子标记。【结果】获得白粉病抗源材料2份,分别为台烟7号和KE1,其中台烟7号的白粉病抗性符合双基因隐性遗传规律。根据抗感亲本的NtMLO基因的差异开发了分子标记,利用分离群体证明该标记与白粉病抗性共分离,并应用于主栽品种的抗性回交改良。【结论】开发了与烟草Ntmlo白粉病抗性共分离的分子标记,可显著提高烟草白粉病抗病育种效率。 展开更多

关键词 白粉病 分子标记 回交改良 资源鉴定

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利用CRISPR/Cas9系统研究REVOLUTA参与烟草叶芽发育的调控 被引量：1

8

作者 王兵 赵会纳 +3 位作者 余婧 陈杰 骆梅 雷波 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期197-208,共12页

作物叶芽受到分生组织调控,调控叶芽是作物增产的有效措施之一。目前关于烟草分生组织调控的分子机理研究偏少,可用于株型改良的种质资源缺乏。本研究通过CRISPR/Cas9编辑系统靶向突变烟草REVOLUTA(REV)基因,分别构建两个不同REV单靶点... 作物叶芽受到分生组织调控,调控叶芽是作物增产的有效措施之一。目前关于烟草分生组织调控的分子机理研究偏少,可用于株型改良的种质资源缺乏。本研究通过CRISPR/Cas9编辑系统靶向突变烟草REVOLUTA(REV)基因,分别构建两个不同REV单靶点序列C15NtREV和C16NtREV,通过农杆菌介导的叶盘转化方法获得再生苗,利用PCR测序鉴定转基因阳性单株,测序结果表明Ko-C15Ntrev突变体在NtREV氨基酸第26位置之后发生移码突变,而Ko-C16Ntrev突变体在NtREV氨基酸第60位置之后发生移码突变。此外,借助扫描电镜分别观测两个单靶点纯合突变体顶芽表型,结果表明烟草Ko-C15Ntrev双拷贝同源突变体出现顶芽缺失和叶片畸形的表型,而Ko-C16Ntrev单拷贝同源突变体未表现出顶芽缺失,但顶芽发育迟缓。相较于野生型烟草,Ko-C16Ntrev突变体自然株高较野生型增加3.76%,Ko-C16Ntrev突变体叶片数和腋芽鲜重分别较野生型减少21.47%和23.41%,且均达到极显著差异,说明NtREV参与烟草顶端分生组织发育,进而调节叶和腋芽发育。这些突变体为后续研究烟草的叶芽发育分子机理提供了重要研究材料。 展开更多

关键词 CRISPR/Cas9 REVOLUTA 叶芽 株型 侧生分生组织 烟草

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两个烟草Nup96基因的分子克隆及其表达分析 被引量：1

9

作者 林世锋 王仁刚 +4 位作者 史跃伟 张孝廉 邹颉 任学良 余婧 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第4期83-88,共6页

为研究烟草低温早花的分子机理,采用RT-PCR结合RACE法,从烟草品种NC82中克隆到2个Nup96基因c DNA全长序列,分别命名为Nt Nup96a和Nt Nup96b,Gen Bank登陆号分别为KU558693和KU558694。序列分析表明2个基因均编码1037个氨基酸残基的蛋白... 为研究烟草低温早花的分子机理,采用RT-PCR结合RACE法,从烟草品种NC82中克隆到2个Nup96基因c DNA全长序列,分别命名为Nt Nup96a和Nt Nup96b,Gen Bank登陆号分别为KU558693和KU558694。序列分析表明2个基因均编码1037个氨基酸残基的蛋白,氨基酸序列一致性为97%,与拟南芥Nup96蛋白(NP_178183)的序列一致性为60%;2个基因编码蛋白具有典型的植物Nup96结构特性,包含1个Nup96结构域和1个自酶解结构域。荧光定量PCR分析表明:在正常的生长条件下,Nt Nup96a和Nt Nup96b在烟草各组织中均有表达,在叶片中的表达量较弱,且随着植株生长其表达量显著下降;在12℃处理10天后,在烟草叶片中2基因的表达都出现了明显的下调,这一结果提示Nup96可能是烟草开花时间调控的抑制因子,其受低温诱导下调表达可能与NC82低温敏感,易早花特性相关。 展开更多

关键词 烟草 Nup96 基因克隆 表达分析

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线粒体旁路氧化途径抑制剂水杨肟酸(SHAM)协同下烟草赤星病菌对嘧菌酯的敏感性 被引量：4

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作者 黄艳飞 陈庆园 +6 位作者 王进 薛娟娟 王茂胜 鲁红学 商胜华 张长青 汪汉成 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第6期65-70,共6页

测定了线粒体旁路氧化途径抑制剂水杨肟酸(SHAM)协同下烟草赤星病菌对嘧菌酯的敏感性。结果表明:嘧菌酯抑制病原菌菌丝生长和孢子萌发的EC50值分别为25.8300 mg/L和0.0500 mg/L,在100 mg/L SHAM协同下,EC50值分别降低为15.5200和0.0038 ... 测定了线粒体旁路氧化途径抑制剂水杨肟酸(SHAM)协同下烟草赤星病菌对嘧菌酯的敏感性。结果表明:嘧菌酯抑制病原菌菌丝生长和孢子萌发的EC50值分别为25.8300 mg/L和0.0500 mg/L,在100 mg/L SHAM协同下,EC50值分别降低为15.5200和0.0038 mg/L;SHAM对烟草赤星病菌菌丝的生长和分生孢子的萌发没有影响。研究说明SHAM增强了嘧菌酯对烟草赤星病菌的毒力,线粒体电子传递的旁路氧化途径存在于烟草赤星病菌中,且在孢子萌发中的增效强于菌丝生长阶段。 展开更多

关键词 烟草赤星病菌 嘧菌酯 水杨肟酸 敏感性

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烟草赤星病胁迫对不同抗性品种光合特性和渗透调节的影响 被引量：6

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作者 杨志晓 薛刚 +6 位作者 丁燕芳 张小全 刘红峰 张杰 王轶 任学良 杨铁钊 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第3期82-87,共6页

以抗烟草赤星病品种净叶黄(JYH)和感病品种长脖黄(CBH)为材料,在盆栽试验条件下,研究不同烟草赤星病胁迫程度(轻度胁迫、中度胁迫和重度胁迫)对光合特性和渗透调节的影响。结果显示:⑴烟草赤星病胁迫导致2个品种的叶绿素a、叶绿素b、总... 以抗烟草赤星病品种净叶黄(JYH)和感病品种长脖黄(CBH)为材料,在盆栽试验条件下,研究不同烟草赤星病胁迫程度(轻度胁迫、中度胁迫和重度胁迫)对光合特性和渗透调节的影响。结果显示:⑴烟草赤星病胁迫导致2个品种的叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素和类胡萝卜素含量均呈下降趋势,且JYH的降幅小于CBH。⑵JYH、CBH的净光合速率、气孔导度因烟草赤星病胁迫而降低。2个品种的胞间CO2浓度、气孔限制值变化具有明显差异,烟草赤星病胁迫导致CBH的胞间CO2浓度上升,气孔限制值则明显下降,这与JYH在重度胁迫下的变化趋势一致。而JYH的胞间CO2浓度在轻度、中度胁迫降低,气孔限制值则呈上升趋势。⑶与CBH相比,JYH在烟草赤星病胁迫下具有较高的脯氨酸和可溶性总糖含量,较低的MDA含量。研究结果表明,JYH具有较强的光合作用和渗透物质调节能力,是对烟草赤星病胁迫具有较强抗性的生理基础。 展开更多

关键词 烟草 烟草赤星病 光合色素 光合作用 渗透调节

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一株突破va基因型烟草抗性的PVY病毒分离物的鉴定 被引量：2

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作者 李若 李尊强 +6 位作者 万秀清 乔婵 郭玉双 潘红杏 崔晓 陈荣平 郭兆奎 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第4期72-77,共6页

【背景和目的】近来,能突破va基因型抗性的马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)毒株在烟草上不断出现。2016年,我们分离到一株抗性突破的毒株PVY-CJ,本文对该病毒分离物进行了验证和鉴定。【方法】采用病毒重新接种、多重RT-PCR、RT-PCR分... 【背景和目的】近来,能突破va基因型抗性的马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)毒株在烟草上不断出现。2016年,我们分离到一株抗性突破的毒株PVY-CJ,本文对该病毒分离物进行了验证和鉴定。【方法】采用病毒重新接种、多重RT-PCR、RT-PCR分段扩增病毒全长基因组、PVY病毒分子进化分析及病毒蛋白VPg蛋白序列比对等方法对PVY-CJ毒株进行了验证和鉴定。【结果】三种重新接种了PVY-CJ的va基因型烟草品种均发病。多重RT-PCR结果将PVY-CJ鉴定为PVYNTN株系。序列分析表明,PVY-CJ全长基因组包含一个全长9180 nt的开放读框,其编码一个3060 AA的多聚蛋白。分子进化分析进一步验证了其归类于PVYNTN株系。相比其他PVYNTN株系毒株,PVY-CJ的VPg蛋白105位氨基酸出现了一个由赖氨酸到谷氨酸的替换,而这一氨基酸替换导致了其对va基因来源抗性的突破。【结论】我们首次报道并鉴定了国内一株能突破va基因型烟草抗性的PVY毒株—PVY-CJ。这为进一步研制PVY抗病烟草品种提供了材料。 展开更多

关键词 烟草 PVY va基因型 抗性突破 鉴定 PVY-CJ

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烟草糖基转移酶基因NtGT3的克隆与生物信息学分析 被引量：5

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作者 任学良 李立芹 +2 位作者 许力 郭玉双 鲁黎明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期23-30,共8页

为了给烟草糖基转移酶的生物学功能研究奠定基础,根据在GenBank上登录的烟草糖基转移酶基因NtGT3的CDS序列,以烟草栽培品种K326为材料,采用PCR的方法,对目的基因进行克隆,并测序。根据测序的结果,采用各类分析软件,对所获得的DNA片段进... 为了给烟草糖基转移酶的生物学功能研究奠定基础,根据在GenBank上登录的烟草糖基转移酶基因NtGT3的CDS序列,以烟草栽培品种K326为材料,采用PCR的方法,对目的基因进行克隆,并测序。根据测序的结果,采用各类分析软件,对所获得的DNA片段进行生物信息学分析。结果通过PCR的方法,成功克隆了烟草糖基转移酶基因NtGT3的全长CDS序列。生物信息学分析结果表明,该基因CDS全长1 449 bp,所编码的蛋白质包含482个氨基酸。其分子量为54.15 ku,等电点为5.53。在二级结构上,α-螺旋和无规则卷曲为蛋白的主要结构形式。在三级结构上,具有42%的α-螺旋以及15%的β-折叠。NtGT3蛋白是一个亲水性蛋白质,含有2个糖基化位点,不含信号肽。NtGT3蛋白广泛分布于细胞中,在细胞膜、微体、高尔基体及内质网膜的分布分别达到了79%、31.9%、30%及20%。功能结构域分析结果证实,该蛋白包含有糖基转移酶家族的功能保守域PLN03015,属于GTB类型的糖基转移酶超级家族。同源性分析结果表明,NtGT3蛋白与枸杞、睡茄、甘薯、可可、猕猴桃、杨树、葡萄、野生大豆及拟南芥等的糖基转移酶有较高的序列相似性。NtGT3基因的成功克隆,为该基因功能的深入研究提供了理论支撑。 展开更多

关键词 烟草 糖基转移酶 基因

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烟草叶宽性状主效QTL定位及育种评价 被引量：3

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作者 赵会纳 雷波 +6 位作者 程立锐 余婧 蒋彩虹 刘旦 杨爱国 王兵 余世洲 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2023年第1期1-7,共7页

为研究烟草叶宽性状调控的遗传规律,定位其主效QTL位点,利用烟草SNP芯片对构建的重组自交系(Recombinant Inbred Lines, RILs)群体(小黄金1025×Beinhart1000-1)进行基因分型,并使用IciMapping 4.2软件的ICIM-ADD方法在全基因组范... 为研究烟草叶宽性状调控的遗传规律,定位其主效QTL位点,利用烟草SNP芯片对构建的重组自交系(Recombinant Inbred Lines, RILs)群体(小黄金1025×Beinhart1000-1)进行基因分型,并使用IciMapping 4.2软件的ICIM-ADD方法在全基因组范围内定位到6个与叶宽性状相关的QTL,分别位于2、4、9、13、17和20号连锁群上,可以解释2.9%~36.8%的表型遗传变异;其中qMLW20-1可解释36.8%的表型变异,为主效基因。以K326为轮回亲本、Samsun为主效基因qMLW20-1供体亲本构建染色体片段代换系评估烟草叶宽主效QTL的遗传效应,结果表明,导入qMLW20-1主效基因能显著提高烟叶叶宽,其中G3材料显著提高了烟叶钾含量,感官质量等其他重要性状与对照无显著性差异,未携带不良性状基因,具有较好的育种利用价值。研究结果为克隆叶宽性状主效基因和进行分子改良奠定了基础。 展开更多

关键词 叶宽 重组自交系 染色体片段代换系 QTL 育种评价

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烟草钾外流通道基因NTORK1的启动子克隆及激素诱导分析 被引量：4

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作者 姜骁 吴拥军 +1 位作者 杨亚 赵杰宏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期274-277,共4页

为研究烟草钾外流通道基因NTORK1的启动子的表达特征,以烟草K326基因组DNA为模板,PCR扩增获得NTORK1的启动子片段,该启动子片段为2 111 bp,包含多个转录因子结合域。构建了NTORK1启动子驱动的GUS基因表达载体,在烟草K326叶片中进行瞬时... 为研究烟草钾外流通道基因NTORK1的启动子的表达特征,以烟草K326基因组DNA为模板,PCR扩增获得NTORK1的启动子片段,该启动子片段为2 111 bp,包含多个转录因子结合域。构建了NTORK1启动子驱动的GUS基因表达载体,在烟草K326叶片中进行瞬时表达分析。结果显示,NTORK1启动子受低浓度NAA(5.4μmol/L)和高浓度SA(500μmol/L)的诱导表达。 展开更多

关键词 烟草 钾外流通道基因NTORK1 启动子 激素

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烟草种质资源抗马铃薯Y病毒病基因型鉴定 被引量：4

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作者 林世锋 王仁刚 +5 位作者 任学良 李尊强 元野 龙明锦 张吉顺 王自力 《中国烟草学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期37-44,共8页

【背景和目的】从作物种质资源中进行等位基因鉴定,特别是优异等位基因的发掘和应用,是使种质资源加速转变为基因资源的关键所在。【方法】采用苗期汁液摩擦接种的方法,对烟草种质资源的马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)抗病性进行鉴定... 【背景和目的】从作物种质资源中进行等位基因鉴定,特别是优异等位基因的发掘和应用,是使种质资源加速转变为基因资源的关键所在。【方法】采用苗期汁液摩擦接种的方法,对烟草种质资源的马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)抗病性进行鉴定;通过烟草隐性抗PVY基因eIF4E1(又称为感PVY基因eIF4E1)等位性测验、等位基因分子标记检测和RT-PCR扩增测序,对PVY抗病资源进行基因型分析。【结果】(1)从收集到的900多份来自国内外的烟草种质资源中筛选出19份高抗PVY资源。(2)根据等位性测验结果推断19份抗源所具有的PVY抗性均由eIF4E1基因所控制。(3)等位基因分子标记检测和RT-PCR扩增测序结果将19份抗源的eIF4E1基因区分为4种突变类型。【结论】本研究结果丰富了我国对抗PVY烟草种质资源的筛选和利用的内容,为后续烟草PVY抗性优异等位基因的发掘和育种利用提供了基础材料和信息支撑。 展开更多

关键词 烟草 种质资源 马铃薯Y病毒 抗病性 eIF4E1基因 基因型

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烟草基因组中AGO蛋白的生物信息学分析 被引量：5

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作者 蔡健宇 武晓云 +1 位作者 郭玉双 李翔宇 《江西农业学报》 CAS 2017年第2期1-8,共8页

对在NCBI上登录的烟草AGO蛋白(argonaute proteins)的信息进行了整理,并对其组成成分、系统发育树、信号肽、跨膜结构域、细胞定位、亲水性/疏水性、蛋白质的二/三级结构等进行了预测和分析。结果表明:在烟草基因组中共有22个AGO蛋白,... 对在NCBI上登录的烟草AGO蛋白(argonaute proteins)的信息进行了整理,并对其组成成分、系统发育树、信号肽、跨膜结构域、细胞定位、亲水性/疏水性、蛋白质的二/三级结构等进行了预测和分析。结果表明:在烟草基因组中共有22个AGO蛋白,可分为8类;烟草的AGO蛋白与拟南芥的AGO一样在进化上分为3个分支,其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、无信号肽/导肽的亲水性蛋白,α-螺旋散布于整个蛋白质中,具有PAZ和PIWI两个特征结构域。此外,烟草的AGO2/4/7/16/PNH1定位在细胞核中,AGO10定位在细胞质中,AGO5定位在线粒体中。 展开更多

关键词 生物信息学 烟草 Argonaute(AGO) 分子结构 功能预测

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烟草糖基转移酶基因NtGT5b的克隆与序列特征分析 被引量：1

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作者 任学良 李立芹 +2 位作者 许力 郭玉双 鲁黎明 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期453-459,共7页

为研究烟草糖基转移酶的生物学功能,根据在GenBank上登录的烟草糖基转移酶基因NtGT5b(登录号BAD93690.1)的CDS序列,设计特异性引物,并以烟草栽培品种K 326总RNA逆转录后的c DNA为模板,采用PCR方法,成功获得了烟草糖基转移酶基因NtGT5b... 为研究烟草糖基转移酶的生物学功能,根据在GenBank上登录的烟草糖基转移酶基因NtGT5b(登录号BAD93690.1)的CDS序列,设计特异性引物,并以烟草栽培品种K 326总RNA逆转录后的c DNA为模板,采用PCR方法,成功获得了烟草糖基转移酶基因NtGT5b的全长CDS序列。生物信息学分析结果表明,该基因CDS全长1 458 bp,所编码的蛋白质包含485个氨基酸。其相对分子质量为54.31 k D,等电点为5.47。在二级结构上,α-螺旋和无规则卷曲为NtGT5b蛋白质的主要结构形式,而β-折叠延伸链与β-转角则相对较少。在三级结构上,该蛋白质主要由α-螺旋与β-折叠构成。NtGT5b蛋白质是一个亲水性蛋白质,含有3个糖基化位点,不含信号肽,包含有糖基转移酶家族的功能保守域PLN02410,属于GTB类型的糖基转移酶超级家族,推测具有糖基转移的功能。 展开更多

关键词 烟草 糖基转移酶 基因

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烟草NtCBT基因启动子酵母单杂诱饵载体构建及互作蛋白筛选 被引量：4

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作者 余婧 杨慧 +4 位作者 余世洲 赵会纳 郑庆霞 王兵 雷波 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期73-79,共7页

为了筛选烟草类西柏烷生物合成途径中西柏三烯一醇合酶基因(NtCBT)的上游调控转录因子,将NtCBT基因启动子截为6段(P1-P6区域),分别构建酵母单杂诱饵载体pAbAi-Px,将pAbAi-Px转化Y1H酵母感受态细胞构建诱饵菌株并进行自激活检测,从烟草... 为了筛选烟草类西柏烷生物合成途径中西柏三烯一醇合酶基因(NtCBT)的上游调控转录因子,将NtCBT基因启动子截为6段(P1-P6区域),分别构建酵母单杂诱饵载体pAbAi-Px,将pAbAi-Px转化Y1H酵母感受态细胞构建诱饵菌株并进行自激活检测,从烟草腺毛酵母cDNA文库中筛选与P5区域(-279--119 bp)互作的转录因子。结果表明,P1-P5区域所构建的诱饵菌株,在AbA浓度为200 ng/mL时转录自激活得到有效抑制;在以P5区域为诱饵菌株的筛库实验中,共获得49个阳性克隆,去除冗余序列后35个克隆为非重复序列,其中3个克隆注释为ANL2、ML1及NF-Y转录因子。以上结果为进一步研究NtCBT基因的表达调控机制奠定了基础。 展开更多

关键词 酵母单杂交 转录因子 栽培烟草 启动子 NtCBT基因 类西柏烷

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NtMAP70基因在烟草抗马铃薯Y病毒过程中的作用 被引量：1

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作者 詹琳琳 郭玉双 +2 位作者 蔡健宇 武晓云 杨靓 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第5期556-560,共5页

为了探明微管结合蛋白70(MAP70)在抗马铃薯Y病毒(PVY)中的作用机制,克隆了烟草Nt MAP70基因的全长,并进行了生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR研究了该基因在烟草不同时期和不同部位中的表达水平,结果表明,NtMAP70在烟草的各个生长期... 为了探明微管结合蛋白70(MAP70)在抗马铃薯Y病毒(PVY)中的作用机制,克隆了烟草Nt MAP70基因的全长,并进行了生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR研究了该基因在烟草不同时期和不同部位中的表达水平,结果表明,NtMAP70在烟草的各个生长期均有表达,且在根中的表达量最高.构建了基于双生病毒卫星诱导的烟草Nt MAP70的沉默载体,以中国番茄黄化曲叶病毒(TYLCCNV)为辅助病毒在烟草中沉默了该基因.与对照相比,在Nt MAP70基因沉默的烟草中PVY侵染速率明显减缓,病毒含量显著降低. 展开更多

关键词 斯M4P70 马铃薯Y病毒 烟草 抗性

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