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题名威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB基因SNP分析
被引量：1
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作者
王振
申小云
盘道兴
谢海强
刘若余
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机构
贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
贵州省扶贫办公室外资项目管理中心
西南科技大学生命科学院
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出处
《广东农业科学》
CAS
2016年第1期130-135,共6页
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基金
贵州省优秀教育人才省长专项(黔省专合字[2009]129)
国家现代农业产业技术体系(CARS-40-30)
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文摘
利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计11对引物扩增其Fec B基因外显子和部分内含子的序列,对纯化后的PCR产物双向测序,分析确定多态性位点。然后利用生物信息学软件分析SNPs位点对Fec B基因RNA二级结构、Fec B蛋白结构的影响。结果显示,在扩增的Fec B基因中筛选到10个SNPs,其中exon5-A39G、exon9-C37A、exon11-C87A、intron2-A62G、intron4-A1023G、intron10-G24A突变为威宁绵羊和贵州半细毛羊中所共有,而exon9-A8G和intron1-G243A突变为威宁绵羊所特有,intron3-G177A和exon8-T86C突变为贵州半细毛羊所特有。上述的SNPs中,exon5-A39G和exon9-A8G为错义突变,exon5-A39G突变导致编码的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),exon9-A8G突变导致编码的天冬酰胺(Asn)变为天冬氨酸(Asp);exon9-C37A和exon11-C87A多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变。
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关键词
FEC
B基因
威宁绵羊
贵州半细毛羊
单核苷酸多态性(SNP)
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Keywords
Fec B gene
Weining sheep
Guizhou semi-fine wool sheep
single nucleotide polymorphism（SNP）
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分类号
S813-3
[农业科学—畜牧学]
Q346.5
[生物学—遗传学]
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