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多裂叶水芹线粒体特征及雄性不育候选基因的鉴定
1
作者 谭国飞 李梦瑶 +4 位作者 罗庆 钟秀来 朱顺华 王堃 熊爱生 《南京农业大学学报》 2025年第5期1013-1022,共10页
[目的]本文旨在分析多裂叶水芹线粒体特征,鉴定其雄性不育候选基因,为水芹雄性不育杂交育种和理论研究提供参考。[方法]以多裂叶水芹不育株系(命名为:OtBY002)及对应的可育株系(命名为:OtKY002)为材料,采用Illumina公司提供的二代测序和... [目的]本文旨在分析多裂叶水芹线粒体特征,鉴定其雄性不育候选基因,为水芹雄性不育杂交育种和理论研究提供参考。[方法]以多裂叶水芹不育株系(命名为:OtBY002)及对应的可育株系(命名为:OtKY002)为材料,采用Illumina公司提供的二代测序和Nanopore提供的三代测序平台,分别对其线粒体基因组进行测序和组装;再对基因组进行注释,筛选、获得候选基因,并对不育基因蛋白进行三维结构分析和进化分析。[结果]OtBY002和OtKY002均含有1个大环和1个小环线粒体基因组,均含有75个基因;其中,OtBY002和OtKY002大环线粒体基因组长度分别为336668 bp(登录号:PP693295.1)和336731 bp(PP693297.1),二者小环线粒体基因组大小一致且长度均为48051 bp(登录号分别为PP693296.1和PP693298.1)。进一步分析表明,ccmFN基因序列长度在OtBY002和OtKY002中具有显著差别,分别为1050和1740 bp,其中,OtBY002中该基因在921 bp位置上发生突变导致其不育,进化上OtBY002和OtKY002的ccmFN具有一定的进化距离,不在同一分支上。[结论]ccmFN基因序列发生突变是导致OtBY002产生不育的潜在原因。 展开更多
关键词 多裂叶水芹 雄性不育 线粒体基因组 ccmFN
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